RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606351.5

CPB2-AS1-203, CPB2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene CPB2-AS1, Length 565 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPB2-AS1-203ENST00000606351 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.55■■□□□ 1.68
CPB2-AS1-203ENST00000606351 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.68■■□□□ 1.22
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.58■■□□□ 1.21
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ABCC9O60706 1549 aa21.99■■□□□ 1.11
CPB2-AS1-203ENST00000606351 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.35■■□□□ 1.01
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CPB2-AS1-203ENST00000606351 NACADO15069 1562 aa21.19■□□□□ 0.98
CPB2-AS1-203ENST00000606351 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.17■□□□□ 0.98
CPB2-AS1-203ENST00000606351 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.09■□□□□ 0.97
CPB2-AS1-203ENST00000606351 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.09■□□□□ 0.97
CPB2-AS1-203ENST00000606351 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.77■□□□□ 0.92
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SCRIBQ14160 1630 aa20.71■□□□□ 0.91
CPB2-AS1-203ENST00000606351 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
CPB2-AS1-203ENST00000606351 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.58■□□□□ 0.88
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.41■□□□□ 0.86
CPB2-AS1-203ENST00000606351 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CPB2-AS1-203ENST00000606351 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.05■□□□□ 0.8
CPB2-AS1-203ENST00000606351 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.93■□□□□ 0.78
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.88■□□□□ 0.77
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SMARCA4P51532 1647 aa19.79■□□□□ 0.76
CPB2-AS1-203ENST00000606351 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CPB2-AS1-203ENST00000606351 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.74■□□□□ 0.75
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.63■□□□□ 0.73
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SMARCA2P51531 1590 aa19.57■□□□□ 0.72
CPB2-AS1-203ENST00000606351 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CPB2-AS1-203ENST00000606351 NCAPD3P42695 1498 aa19.56■□□□□ 0.72
CPB2-AS1-203ENST00000606351 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.55■□□□□ 0.72
CPB2-AS1-203ENST00000606351 WIZO95785 1651 aa19.55■□□□□ 0.72
CPB2-AS1-203ENST00000606351 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CPB2-AS1-203ENST00000606351 HMGXB3Q12766 1538 aa19.46■□□□□ 0.71
CPB2-AS1-203ENST00000606351 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CPB2-AS1-203ENST00000606351 FOXD1Q16676 465 aa19.13■□□□□ 0.65
CPB2-AS1-203ENST00000606351 NESP48681 1621 aa19.11■□□□□ 0.65
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.1■□□□□ 0.65
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.02■□□□□ 0.64
CPB2-AS1-203ENST00000606351 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.01■□□□□ 0.63
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CFTRP13569 1480 aa18.94■□□□□ 0.62
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ERCC6Q03468 1493 aa18.89■□□□□ 0.61
CPB2-AS1-203ENST00000606351 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.87■□□□□ 0.61
CPB2-AS1-203ENST00000606351 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.87■□□□□ 0.61
CPB2-AS1-203ENST00000606351 PRDM2Q13029 1718 aa18.81■□□□□ 0.6
CPB2-AS1-203ENST00000606351 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.81■□□□□ 0.6
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.75■□□□□ 0.59
CPB2-AS1-203ENST00000606351 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CPB2-AS1-203ENST00000606351 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.68■□□□□ 0.58
CPB2-AS1-203ENST00000606351 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CPB2-AS1-203ENST00000606351 WDR62O43379 1518 aa18.61■□□□□ 0.57
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CUX2O14529 1486 aa18.58■□□□□ 0.56
CPB2-AS1-203ENST00000606351 TOPBP1Q92547 1522 aa18.54■□□□□ 0.56
CPB2-AS1-203ENST00000606351 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.51■□□□□ 0.55
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ABCC8Q09428 1581 aa18.51■□□□□ 0.55
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CUX1P39880 1505 aa18.49■□□□□ 0.55
CPB2-AS1-203ENST00000606351 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SYNJ1O43426 1573 aa18.41■□□□□ 0.54
CPB2-AS1-203ENST00000606351 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.54
CPB2-AS1-203ENST00000606351 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.39■□□□□ 0.53
CPB2-AS1-203ENST00000606351 TOP2BQ02880 1626 aa18.36■□□□□ 0.53
CPB2-AS1-203ENST00000606351 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.36■□□□□ 0.53
CPB2-AS1-203ENST00000606351 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.35■□□□□ 0.53
CPB2-AS1-203ENST00000606351 IFT140Q96RY7 1462 aa18.33■□□□□ 0.53
CPB2-AS1-203ENST00000606351 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SOGA1O94964 1423 aa18.32■□□□□ 0.52
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CPB2-AS1-203ENST00000606351 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
CPB2-AS1-203ENST00000606351 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CPB2-AS1-203ENST00000606351 WDR97A6NE52 1622 aa18.22■□□□□ 0.51
CPB2-AS1-203ENST00000606351 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.18■□□□□ 0.5
CPB2-AS1-203ENST00000606351 TRIM41Q8WV44 630 aa18.16■□□□□ 0.5
CPB2-AS1-203ENST00000606351 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.11■□□□□ 0.49
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.11■□□□□ 0.49
CPB2-AS1-203ENST00000606351 PBRM1Q86U86 1689 aa18.07■□□□□ 0.48
CPB2-AS1-203ENST00000606351 GRIN2BQ13224 1484 aa18.06■□□□□ 0.48
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.04■□□□□ 0.48
CPB2-AS1-203ENST00000606351 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.03■□□□□ 0.48
CPB2-AS1-203ENST00000606351 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.01■□□□□ 0.47
CPB2-AS1-203ENST00000606351 KIF27Q86VH2 1401 aa18■□□□□ 0.47
CPB2-AS1-203ENST00000606351 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CPB2-AS1-203ENST00000606351 FBLN2P98095 1184 aa17.97■□□□□ 0.47
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CHD1O14646 1710 aa17.96■□□□□ 0.47
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.96■□□□□ 0.47
CPB2-AS1-203ENST00000606351 IGF1RP08069 1367 aa17.94■□□□□ 0.46
CPB2-AS1-203ENST00000606351 ADAMTS12P58397 1594 aa17.92■□□□□ 0.46
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CPB2-AS1-203ENST00000606351 SYNJ2O15056 1496 aa17.92■□□□□ 0.46
CPB2-AS1-203ENST00000606351 MSH5O43196 834 aa17.91■□□□□ 0.46
CPB2-AS1-203ENST00000606351 OSCARQ8IYS5 282 aa17.89■□□□□ 0.45
CPB2-AS1-203ENST00000606351 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.89■□□□□ 0.45
CPB2-AS1-203ENST00000606351 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CUL7Q14999 1698 aa17.84■□□□□ 0.45
CPB2-AS1-203ENST00000606351 GRIN2AQ12879 1464 aa17.84■□□□□ 0.45
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.83■□□□□ 0.45
CPB2-AS1-203ENST00000606351 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.82■□□□□ 0.44
CPB2-AS1-203ENST00000606351 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.81■□□□□ 0.44
CPB2-AS1-203ENST00000606351 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CPB2-AS1-203ENST00000606351 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms