RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600318.1

ZSCAN18-211, Transcript of zinc finger and SCAN domain containing 18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZSCAN18, Length 2,004 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN18-211ENST00000600318 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.8■■■■■ 5.88
ZSCAN18-211ENST00000600318 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.27■■■■■ 4.84
ZSCAN18-211ENST00000600318 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
ZSCAN18-211ENST00000600318 ABCC9O60706 1549 aa43.33■■■■■ 4.53
ZSCAN18-211ENST00000600318 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.05■■■■■ 4.48
ZSCAN18-211ENST00000600318 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.75■■■■■ 4.43
ZSCAN18-211ENST00000600318 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.38■■■■■ 4.38
ZSCAN18-211ENST00000600318 NACADO15069 1562 aa42.29■■■■■ 4.36
ZSCAN18-211ENST00000600318 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.11■■■■■ 4.33
ZSCAN18-211ENST00000600318 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.04■■■■■ 4.32
ZSCAN18-211ENST00000600318 SCRIBQ14160 1630 aa41.7■■■■■ 4.27
ZSCAN18-211ENST00000600318 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.21■■■■■ 4.19
ZSCAN18-211ENST00000600318 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.84■■■■■ 4.13
ZSCAN18-211ENST00000600318 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.84■■■■■ 4.13
ZSCAN18-211ENST00000600318 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.36■■■■■ 4.05
ZSCAN18-211ENST00000600318 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
ZSCAN18-211ENST00000600318 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
ZSCAN18-211ENST00000600318 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.05■■■■■ 4
ZSCAN18-211ENST00000600318 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
ZSCAN18-211ENST00000600318 SMARCA4P51532 1647 aa39.9■■■■□ 3.98
ZSCAN18-211ENST00000600318 WIZO95785 1651 aa39.69■■■■□ 3.94
ZSCAN18-211ENST00000600318 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
ZSCAN18-211ENST00000600318 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.38■■■■□ 3.89
ZSCAN18-211ENST00000600318 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.37■■■■□ 3.89
ZSCAN18-211ENST00000600318 SMARCA2P51531 1590 aa39.28■■■■□ 3.88
ZSCAN18-211ENST00000600318 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
ZSCAN18-211ENST00000600318 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.16■■■■□ 3.86
ZSCAN18-211ENST00000600318 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
ZSCAN18-211ENST00000600318 NCAPD3P42695 1498 aa39.07■■■■□ 3.85
ZSCAN18-211ENST00000600318 HMGXB3Q12766 1538 aa38.94■■■■□ 3.82
ZSCAN18-211ENST00000600318 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.87■■■■□ 3.81
ZSCAN18-211ENST00000600318 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.67■■■■□ 3.78
ZSCAN18-211ENST00000600318 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.33■■■■□ 3.73
ZSCAN18-211ENST00000600318 CFTRP13569 1480 aa38.1■■■■□ 3.69
ZSCAN18-211ENST00000600318 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.07■■■■□ 3.68
ZSCAN18-211ENST00000600318 ABCC8Q09428 1581 aa37.94■■■■□ 3.66
ZSCAN18-211ENST00000600318 NESP48681 1621 aa37.94■■■■□ 3.66
ZSCAN18-211ENST00000600318 TRIM41Q8WV44 630 aa37.87■■■■□ 3.65
ZSCAN18-211ENST00000600318 PRDM2Q13029 1718 aa37.8■■■■□ 3.64
ZSCAN18-211ENST00000600318 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.77■■■■□ 3.64
ZSCAN18-211ENST00000600318 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.71■■■■□ 3.63
ZSCAN18-211ENST00000600318 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.65■■■■□ 3.62
ZSCAN18-211ENST00000600318 SYNJ1O43426 1573 aa37.58■■■■□ 3.61
ZSCAN18-211ENST00000600318 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.52■■■■□ 3.6
ZSCAN18-211ENST00000600318 CUX1P39880 1505 aa37.46■■■■□ 3.59
ZSCAN18-211ENST00000600318 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.43■■■■□ 3.58
ZSCAN18-211ENST00000600318 TOP2BQ02880 1626 aa37.41■■■■□ 3.58
ZSCAN18-211ENST00000600318 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.4■■■■□ 3.58
ZSCAN18-211ENST00000600318 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.36■■■■□ 3.57
ZSCAN18-211ENST00000600318 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
ZSCAN18-211ENST00000600318 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
ZSCAN18-211ENST00000600318 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.2■■■■□ 3.55
ZSCAN18-211ENST00000600318 TOPBP1Q92547 1522 aa37.2■■■■□ 3.55
ZSCAN18-211ENST00000600318 SOGA1O94964 1423 aa37.16■■■■□ 3.54
ZSCAN18-211ENST00000600318 ERCC6Q03468 1493 aa37.16■■■■□ 3.54
ZSCAN18-211ENST00000600318 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.11■■■■□ 3.53
ZSCAN18-211ENST00000600318 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.08■■■■□ 3.53
ZSCAN18-211ENST00000600318 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.07■■■■□ 3.52
ZSCAN18-211ENST00000600318 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
ZSCAN18-211ENST00000600318 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.92■■■■□ 3.5
ZSCAN18-211ENST00000600318 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.92■■■■□ 3.5
ZSCAN18-211ENST00000600318 WDR62O43379 1518 aa36.88■■■■□ 3.49
ZSCAN18-211ENST00000600318 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
ZSCAN18-211ENST00000600318 EEA1Q15075 1411 aa36.87■■■■□ 3.49
ZSCAN18-211ENST00000600318 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.81■■■■□ 3.48
ZSCAN18-211ENST00000600318 CUX2O14529 1486 aa36.8■■■■□ 3.48
ZSCAN18-211ENST00000600318 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.8■■■■□ 3.48
ZSCAN18-211ENST00000600318 KIF27Q86VH2 1401 aa36.77■■■■□ 3.48
ZSCAN18-211ENST00000600318 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.74■■■■□ 3.47
ZSCAN18-211ENST00000600318 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
ZSCAN18-211ENST00000600318 WDR97A6NE52 1622 aa36.63■■■■□ 3.45
ZSCAN18-211ENST00000600318 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
ZSCAN18-211ENST00000600318 IFT140Q96RY7 1462 aa36.55■■■■□ 3.44
ZSCAN18-211ENST00000600318 IGF1RP08069 1367 aa36.54■■■■□ 3.44
ZSCAN18-211ENST00000600318 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.47■■■■□ 3.43
ZSCAN18-211ENST00000600318 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.45■■■■□ 3.43
ZSCAN18-211ENST00000600318 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
ZSCAN18-211ENST00000600318 KIF21BO75037 1637 aa36.44■■■■□ 3.42
ZSCAN18-211ENST00000600318 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.425e-10■■■■■ 47.4
ZSCAN18-211ENST00000600318 PRXQ9BXM0 1461 aa36.43■■■■□ 3.42
ZSCAN18-211ENST00000600318 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.4■■■■□ 3.42
ZSCAN18-211ENST00000600318 GOLGA3Q08378 1498 aa36.39■■■■□ 3.42
ZSCAN18-211ENST00000600318 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
ZSCAN18-211ENST00000600318 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.33■■■■□ 3.41
ZSCAN18-211ENST00000600318 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.28■■■■□ 3.4
ZSCAN18-211ENST00000600318 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
ZSCAN18-211ENST00000600318 PBRM1Q86U86 1689 aa36.23■■■■□ 3.39
ZSCAN18-211ENST00000600318 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.21■■■■□ 3.39
ZSCAN18-211ENST00000600318 GRIN2BQ13224 1484 aa36.21■■■■□ 3.39
ZSCAN18-211ENST00000600318 CUL7Q14999 1698 aa36.19■■■■□ 3.38
ZSCAN18-211ENST00000600318 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.05■■■■□ 3.36
ZSCAN18-211ENST00000600318 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.03■■■■□ 3.36
ZSCAN18-211ENST00000600318 ADAMTS12P58397 1594 aa36.03■■■■□ 3.36
ZSCAN18-211ENST00000600318 CEP162Q5TB80 1403 aa36.02■■■■□ 3.36
ZSCAN18-211ENST00000600318 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
ZSCAN18-211ENST00000600318 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
ZSCAN18-211ENST00000600318 CLIP1P30622 1438 aa35.83■■■■□ 3.33
ZSCAN18-211ENST00000600318 SYNJ2O15056 1496 aa35.81■■■■□ 3.32
ZSCAN18-211ENST00000600318 FBLN2P98095 1184 aa35.81■■■■□ 3.32
ZSCAN18-211ENST00000600318 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
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