RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597620.5

LIPE-203, Transcript of lipase E, hormone sensitive type, humanhuman

TSL 3

Gene LIPE, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPE-203ENST00000597620 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.65■■■■■ 5.54
LIPE-203ENST00000597620 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.6■■■■■ 4.57
LIPE-203ENST00000597620 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
LIPE-203ENST00000597620 ABCC9O60706 1549 aa41.56■■■■■ 4.24
LIPE-203ENST00000597620 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.18■■■■■ 4.18
LIPE-203ENST00000597620 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.95■■■■■ 4.15
LIPE-203ENST00000597620 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.94■■■■■ 4.14
LIPE-203ENST00000597620 NACADO15069 1562 aa40.77■■■■■ 4.12
LIPE-203ENST00000597620 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.51■■■■■ 4.08
LIPE-203ENST00000597620 SCRIBQ14160 1630 aa39.83■■■■□ 3.97
LIPE-203ENST00000597620 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.83■■■■□ 3.97
LIPE-203ENST00000597620 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.48■■■■□ 3.91
LIPE-203ENST00000597620 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.23■■■■□ 3.87
LIPE-203ENST00000597620 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.04■■■■□ 3.84
LIPE-203ENST00000597620 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.52■■■■□ 3.76
LIPE-203ENST00000597620 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
LIPE-203ENST00000597620 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
LIPE-203ENST00000597620 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.26■■■■□ 3.72
LIPE-203ENST00000597620 SMARCA4P51532 1647 aa38.24■■■■□ 3.71
LIPE-203ENST00000597620 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
LIPE-203ENST00000597620 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
LIPE-203ENST00000597620 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.91■■■■□ 3.66
LIPE-203ENST00000597620 WIZO95785 1651 aa37.85■■■■□ 3.65
LIPE-203ENST00000597620 SMARCA2P51531 1590 aa37.8■■■■□ 3.64
LIPE-203ENST00000597620 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.79■■■■□ 3.64
LIPE-203ENST00000597620 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.64■■■■□ 3.62
LIPE-203ENST00000597620 NCAPD3P42695 1498 aa37.63■■■■□ 3.61
LIPE-203ENST00000597620 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
LIPE-203ENST00000597620 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
LIPE-203ENST00000597620 HMGXB3Q12766 1538 aa37.52■■■■□ 3.6
LIPE-203ENST00000597620 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.13■■■■□ 3.54
LIPE-203ENST00000597620 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.13■■■■□ 3.53
LIPE-203ENST00000597620 CFTRP13569 1480 aa36.61■■■■□ 3.45
LIPE-203ENST00000597620 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.59■■■■□ 3.45
LIPE-203ENST00000597620 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.41■■■■□ 3.42
LIPE-203ENST00000597620 NESP48681 1621 aa36.3■■■■□ 3.4
LIPE-203ENST00000597620 PRDM2Q13029 1718 aa36.29■■■■□ 3.4
LIPE-203ENST00000597620 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.26■■■■□ 3.4
LIPE-203ENST00000597620 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.16■■■■□ 3.38
LIPE-203ENST00000597620 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.13■■■■□ 3.37
LIPE-203ENST00000597620 ABCC8Q09428 1581 aa36.06■■■■□ 3.36
LIPE-203ENST00000597620 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.04■■■■□ 3.36
LIPE-203ENST00000597620 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.98■■■■□ 3.35
LIPE-203ENST00000597620 TRIM41Q8WV44 630 aa35.96■■■■□ 3.35
LIPE-203ENST00000597620 SYNJ1O43426 1573 aa35.85■■■■□ 3.33
LIPE-203ENST00000597620 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.84■■■■□ 3.33
LIPE-203ENST00000597620 CUX1P39880 1505 aa35.83■■■■□ 3.33
LIPE-203ENST00000597620 TOP2BQ02880 1626 aa35.82■■■■□ 3.32
LIPE-203ENST00000597620 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.79■■■■□ 3.32
LIPE-203ENST00000597620 ERCC6Q03468 1493 aa35.74■■■■□ 3.31
LIPE-203ENST00000597620 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.73■■■■□ 3.31
LIPE-203ENST00000597620 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.7■■■■□ 3.31
LIPE-203ENST00000597620 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
LIPE-203ENST00000597620 TOPBP1Q92547 1522 aa35.67■■■■□ 3.3
LIPE-203ENST00000597620 WDR62O43379 1518 aa35.54■■■■□ 3.28
LIPE-203ENST00000597620 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.53■■■■□ 3.28
LIPE-203ENST00000597620 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
LIPE-203ENST00000597620 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
LIPE-203ENST00000597620 SOGA1O94964 1423 aa35.34■■■■□ 3.25
LIPE-203ENST00000597620 EEA1Q15075 1411 aa35.33■■■■□ 3.25
LIPE-203ENST00000597620 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.27■■■■□ 3.24
LIPE-203ENST00000597620 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.26■■■■□ 3.23
LIPE-203ENST00000597620 CUX2O14529 1486 aa35.25■■■■□ 3.23
LIPE-203ENST00000597620 KIF27Q86VH2 1401 aa35.21■■■■□ 3.23
LIPE-203ENST00000597620 IFT140Q96RY7 1462 aa35.2■■■■□ 3.23
LIPE-203ENST00000597620 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
LIPE-203ENST00000597620 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.18■■■■□ 3.22
LIPE-203ENST00000597620 WDR97A6NE52 1622 aa35.14■■■■□ 3.22
LIPE-203ENST00000597620 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
LIPE-203ENST00000597620 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.08■■■■□ 3.21
LIPE-203ENST00000597620 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.99■■■■□ 3.19
LIPE-203ENST00000597620 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
LIPE-203ENST00000597620 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.95■■■■□ 3.19
LIPE-203ENST00000597620 IGF1RP08069 1367 aa34.94■■■■□ 3.18
LIPE-203ENST00000597620 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
LIPE-203ENST00000597620 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.86■■■■□ 3.17
LIPE-203ENST00000597620 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.85■■■■□ 3.17
LIPE-203ENST00000597620 PRXQ9BXM0 1461 aa34.84■■■■□ 3.17
LIPE-203ENST00000597620 KIF21BO75037 1637 aa34.81■■■■□ 3.16
LIPE-203ENST00000597620 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
LIPE-203ENST00000597620 GRIN2BQ13224 1484 aa34.8■■■■□ 3.16
LIPE-203ENST00000597620 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.74■■■■□ 3.15
LIPE-203ENST00000597620 CUL7Q14999 1698 aa34.73■■■■□ 3.15
LIPE-203ENST00000597620 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.73■■■■□ 3.15
LIPE-203ENST00000597620 GOLGA3Q08378 1498 aa34.72■■■■□ 3.15
LIPE-203ENST00000597620 PBRM1Q86U86 1689 aa34.72■■■■□ 3.15
LIPE-203ENST00000597620 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.65■■■■□ 3.14
LIPE-203ENST00000597620 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.61■■■■□ 3.13
LIPE-203ENST00000597620 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
LIPE-203ENST00000597620 ADAMTS12P58397 1594 aa34.57■■■■□ 3.13
LIPE-203ENST00000597620 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.57■■■■□ 3.12
LIPE-203ENST00000597620 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.52■■■■□ 3.12
LIPE-203ENST00000597620 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.52■■■■□ 3.12
LIPE-203ENST00000597620 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
LIPE-203ENST00000597620 SYNJ2O15056 1496 aa34.44■■■■□ 3.1
LIPE-203ENST00000597620 GRIN2AQ12879 1464 aa34.34■■■■□ 3.09
LIPE-203ENST00000597620 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
LIPE-203ENST00000597620 CEP162Q5TB80 1403 aa34.23■■■■□ 3.07
LIPE-203ENST00000597620 FBLN2P98095 1184 aa34.19■■■■□ 3.06
LIPE-203ENST00000597620 NUP160Q12769 1436 aa34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms