RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593438.1

HOXA-AS2-211, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXA-AS2, Length 629 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.51■■■□□ 2.63
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ABCC9O60706 1549 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NACADO15069 1562 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXA-AS2-211ENST00000593438 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SCRIBQ14160 1630 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXA-AS2-211ENST00000593438 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SMARCA4P51532 1647 aa27.57■■■□□ 2
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SMARCA2P51531 1590 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NCAPD3P42695 1498 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HMGXB3Q12766 1538 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA-AS2-211ENST00000593438 WIZO95785 1651 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NESP48681 1621 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ERCC6Q03468 1493 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CFTRP13569 1480 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PRDM2Q13029 1718 aa26.2■■□□□ 1.79
HOXA-AS2-211ENST00000593438 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CUX2O14529 1486 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXA-AS2-211ENST00000593438 WDR62O43379 1518 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA-AS2-211ENST00000593438 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ABCC8Q09428 1581 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TOPBP1Q92547 1522 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CUX1P39880 1505 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IFT140Q96RY7 1462 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SOGA1O94964 1423 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SYNJ1O43426 1573 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TOP2BQ02880 1626 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXA-AS2-211ENST00000593438 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
HOXA-AS2-211ENST00000593438 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXA-AS2-211ENST00000593438 WDR97A6NE52 1622 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TRIM41Q8WV44 630 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GRIN2BQ13224 1484 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FBLN2P98095 1184 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PBRM1Q86U86 1689 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA-AS2-211ENST00000593438 OSCARQ8IYS5 282 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIF27Q86VH2 1401 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CHD1O14646 1710 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SYNJ2O15056 1496 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IGF1RP08069 1367 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADAMTS12P58397 1594 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GRIN2AQ12879 1464 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CUL7Q14999 1698 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NUP160Q12769 1436 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CEP170Q5SW79 1584 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXA-AS2-211ENST00000593438 EEA1Q15075 1411 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ARHGEF11O15085 1522 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms