RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593024.1

UBXN6-210, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-210ENST00000593024 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.86■■■■□ 3.97
UBXN6-210ENST00000593024 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.21■■■■□ 3.23
UBXN6-210ENST00000593024 ABCC9O60706 1549 aa33.84■■■■□ 3.01
UBXN6-210ENST00000593024 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
UBXN6-210ENST00000593024 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.05■■■□□ 2.88
UBXN6-210ENST00000593024 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.04■■■□□ 2.88
UBXN6-210ENST00000593024 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.97■■■□□ 2.87
UBXN6-210ENST00000593024 NACADO15069 1562 aa32.96■■■□□ 2.87
UBXN6-210ENST00000593024 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.85■■■□□ 2.85
UBXN6-210ENST00000593024 SCRIBQ14160 1630 aa32.13■■■□□ 2.73
UBXN6-210ENST00000593024 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.09■■■□□ 2.73
UBXN6-210ENST00000593024 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.81■■■□□ 2.68
UBXN6-210ENST00000593024 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.79■■■□□ 2.68
UBXN6-210ENST00000593024 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
UBXN6-210ENST00000593024 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.96■■■□□ 2.55
UBXN6-210ENST00000593024 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
UBXN6-210ENST00000593024 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
UBXN6-210ENST00000593024 SMARCA4P51532 1647 aa30.8■■■□□ 2.52
UBXN6-210ENST00000593024 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.71■■■□□ 2.51
UBXN6-210ENST00000593024 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.65■■■□□ 2.5
UBXN6-210ENST00000593024 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
UBXN6-210ENST00000593024 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.52■■■□□ 2.48
UBXN6-210ENST00000593024 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.52■■■□□ 2.48
UBXN6-210ENST00000593024 SMARCA2P51531 1590 aa30.5■■■□□ 2.47
UBXN6-210ENST00000593024 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.5■■■□□ 2.47
UBXN6-210ENST00000593024 WIZO95785 1651 aa30.41■■■□□ 2.46
UBXN6-210ENST00000593024 NCAPD3P42695 1498 aa30.4■■■□□ 2.46
UBXN6-210ENST00000593024 HMGXB3Q12766 1538 aa30.31■■■□□ 2.44
UBXN6-210ENST00000593024 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
UBXN6-210ENST00000593024 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
UBXN6-210ENST00000593024 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
UBXN6-210ENST00000593024 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.78■■■□□ 2.36
UBXN6-210ENST00000593024 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.54■■■□□ 2.32
UBXN6-210ENST00000593024 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.51■■■□□ 2.31
UBXN6-210ENST00000593024 CFTRP13569 1480 aa29.49■■■□□ 2.31
UBXN6-210ENST00000593024 NESP48681 1621 aa29.45■■■□□ 2.31
UBXN6-210ENST00000593024 PRDM2Q13029 1718 aa29.32■■■□□ 2.28
UBXN6-210ENST00000593024 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.29■■■□□ 2.28
UBXN6-210ENST00000593024 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.2■■■□□ 2.26
UBXN6-210ENST00000593024 ERCC6Q03468 1493 aa29.15■■■□□ 2.26
UBXN6-210ENST00000593024 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.14■■■□□ 2.26
UBXN6-210ENST00000593024 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.11■■■□□ 2.25
UBXN6-210ENST00000593024 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.95■■■□□ 2.22
UBXN6-210ENST00000593024 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
UBXN6-210ENST00000593024 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
UBXN6-210ENST00000593024 ABCC8Q09428 1581 aa28.86■■■□□ 2.21
UBXN6-210ENST00000593024 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
UBXN6-210ENST00000593024 WDR62O43379 1518 aa28.84■■■□□ 2.21
UBXN6-210ENST00000593024 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.82■■■□□ 2.2
UBXN6-210ENST00000593024 TOPBP1Q92547 1522 aa28.79■■■□□ 2.2
UBXN6-210ENST00000593024 CUX1P39880 1505 aa28.78■■■□□ 2.2
UBXN6-210ENST00000593024 SYNJ1O43426 1573 aa28.71■■■□□ 2.19
UBXN6-210ENST00000593024 TOP2BQ02880 1626 aa28.71■■■□□ 2.19
UBXN6-210ENST00000593024 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.7■■■□□ 2.19
UBXN6-210ENST00000593024 CUX2O14529 1486 aa28.64■■■□□ 2.17
UBXN6-210ENST00000593024 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.6■■■□□ 2.17
UBXN6-210ENST00000593024 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
UBXN6-210ENST00000593024 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.58■■■□□ 2.17
UBXN6-210ENST00000593024 TRIM41Q8WV44 630 aa28.55■■■□□ 2.16
UBXN6-210ENST00000593024 SOGA1O94964 1423 aa28.49■■■□□ 2.15
UBXN6-210ENST00000593024 IFT140Q96RY7 1462 aa28.48■■■□□ 2.15
UBXN6-210ENST00000593024 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.44■■■□□ 2.14
UBXN6-210ENST00000593024 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
UBXN6-210ENST00000593024 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.37■■■□□ 2.13
UBXN6-210ENST00000593024 WDR97A6NE52 1622 aa28.34■■■□□ 2.13
UBXN6-210ENST00000593024 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
UBXN6-210ENST00000593024 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
UBXN6-210ENST00000593024 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
UBXN6-210ENST00000593024 KIF27Q86VH2 1401 aa28.19■■■□□ 2.1
UBXN6-210ENST00000593024 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.19■■■□□ 2.1
UBXN6-210ENST00000593024 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.14e-7■■■□□ 19.1
UBXN6-210ENST00000593024 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.17■■■□□ 2.1
UBXN6-210ENST00000593024 GRIN2BQ13224 1484 aa28.09■■■□□ 2.09
UBXN6-210ENST00000593024 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.08■■■□□ 2.08
UBXN6-210ENST00000593024 EEA1Q15075 1411 aa28.07■■■□□ 2.08
UBXN6-210ENST00000593024 PBRM1Q86U86 1689 aa28.07■■■□□ 2.08
UBXN6-210ENST00000593024 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.04■■■□□ 2.08
UBXN6-210ENST00000593024 IGF1RP08069 1367 aa27.99■■■□□ 2.07
UBXN6-210ENST00000593024 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
UBXN6-210ENST00000593024 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.95■■■□□ 2.06
UBXN6-210ENST00000593024 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.92■■■□□ 2.06
UBXN6-210ENST00000593024 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
UBXN6-210ENST00000593024 CUL7Q14999 1698 aa27.91■■■□□ 2.06
UBXN6-210ENST00000593024 ADAMTS12P58397 1594 aa27.88■■■□□ 2.05
UBXN6-210ENST00000593024 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.87■■■□□ 2.05
UBXN6-210ENST00000593024 SYNJ2O15056 1496 aa27.84■■■□□ 2.05
UBXN6-210ENST00000593024 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.84■■■□□ 2.05
UBXN6-210ENST00000593024 PRXQ9BXM0 1461 aa27.79■■■□□ 2.04
UBXN6-210ENST00000593024 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
UBXN6-210ENST00000593024 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.75■■■□□ 2.03
UBXN6-210ENST00000593024 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.75■■■□□ 2.03
UBXN6-210ENST00000593024 FBLN2P98095 1184 aa27.74■■■□□ 2.03
UBXN6-210ENST00000593024 CHD1O14646 1710 aa27.73■■■□□ 2.03
UBXN6-210ENST00000593024 GRIN2AQ12879 1464 aa27.72■■■□□ 2.03
UBXN6-210ENST00000593024 KIF21BO75037 1637 aa27.7■■■□□ 2.03
UBXN6-210ENST00000593024 GOLGA3Q08378 1498 aa27.59■■■□□ 2.01
UBXN6-210ENST00000593024 NUP160Q12769 1436 aa27.58■■■□□ 2
UBXN6-210ENST00000593024 OSCARQ8IYS5 282 aa27.56■■■□□ 2
UBXN6-210ENST00000593024 CEP170Q5SW79 1584 aa27.55■■■□□ 2
UBXN6-210ENST00000593024 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.47■■□□□ 1.99
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