RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592701.2

EFTUD2-224, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-224ENST00000592701 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.11■■□□□ 1.61
EFTUD2-224ENST00000592701 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.98■■□□□ 1.11
EFTUD2-224ENST00000592701 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
EFTUD2-224ENST00000592701 ABCC9O60706 1549 aa20.87■□□□□ 0.93
EFTUD2-224ENST00000592701 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.79■□□□□ 0.92
EFTUD2-224ENST00000592701 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.78■□□□□ 0.92
EFTUD2-224ENST00000592701 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.58■□□□□ 0.88
EFTUD2-224ENST00000592701 NACADO15069 1562 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-224ENST00000592701 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.4■□□□□ 0.86
EFTUD2-224ENST00000592701 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.36■□□□□ 0.85
EFTUD2-224ENST00000592701 SCRIBQ14160 1630 aa20.19■□□□□ 0.82
EFTUD2-224ENST00000592701 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.88■□□□□ 0.77
EFTUD2-224ENST00000592701 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.69■□□□□ 0.74
EFTUD2-224ENST00000592701 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.73
EFTUD2-224ENST00000592701 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
EFTUD2-224ENST00000592701 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.5■□□□□ 0.71
EFTUD2-224ENST00000592701 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
EFTUD2-224ENST00000592701 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
EFTUD2-224ENST00000592701 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.38■□□□□ 0.69
EFTUD2-224ENST00000592701 SMARCA4P51532 1647 aa19.33■□□□□ 0.69
EFTUD2-224ENST00000592701 WIZO95785 1651 aa19.22■□□□□ 0.67
EFTUD2-224ENST00000592701 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
EFTUD2-224ENST00000592701 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.1■□□□□ 0.65
EFTUD2-224ENST00000592701 SMARCA2P51531 1590 aa19.06■□□□□ 0.64
EFTUD2-224ENST00000592701 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
EFTUD2-224ENST00000592701 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.04■□□□□ 0.64
EFTUD2-224ENST00000592701 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
EFTUD2-224ENST00000592701 NCAPD3P42695 1498 aa18.9■□□□□ 0.62
EFTUD2-224ENST00000592701 HMGXB3Q12766 1538 aa18.89■□□□□ 0.61
EFTUD2-224ENST00000592701 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.88■□□□□ 0.61
EFTUD2-224ENST00000592701 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.83■□□□□ 0.6
EFTUD2-224ENST00000592701 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-224ENST00000592701 CFTRP13569 1480 aa18.45■□□□□ 0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.44■□□□□ 0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 TRIM41Q8WV44 630 aa18.43■□□□□ 0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.42■□□□□ 0.54
EFTUD2-224ENST00000592701 ABCC8Q09428 1581 aa18.39■□□□□ 0.53
EFTUD2-224ENST00000592701 PRDM2Q13029 1718 aa18.36■□□□□ 0.53
EFTUD2-224ENST00000592701 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
EFTUD2-224ENST00000592701 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.3■□□□□ 0.52
EFTUD2-224ENST00000592701 NESP48681 1621 aa18.27■□□□□ 0.51
EFTUD2-224ENST00000592701 SYNJ1O43426 1573 aa18.22■□□□□ 0.51
EFTUD2-224ENST00000592701 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.22■□□□□ 0.51
EFTUD2-224ENST00000592701 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-224ENST00000592701 TOP2BQ02880 1626 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-224ENST00000592701 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-224ENST00000592701 CUX1P39880 1505 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-224ENST00000592701 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-224ENST00000592701 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
EFTUD2-224ENST00000592701 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.06■□□□□ 0.48
EFTUD2-224ENST00000592701 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-224ENST00000592701 EEA1Q15075 1411 aa18.03■□□□□ 0.48
EFTUD2-224ENST00000592701 SOGA1O94964 1423 aa18.02■□□□□ 0.48
EFTUD2-224ENST00000592701 TOPBP1Q92547 1522 aa18■□□□□ 0.47
EFTUD2-224ENST00000592701 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.98■□□□□ 0.47
EFTUD2-224ENST00000592701 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
EFTUD2-224ENST00000592701 ERCC6Q03468 1493 aa17.95■□□□□ 0.46
EFTUD2-224ENST00000592701 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.95■□□□□ 0.46
EFTUD2-224ENST00000592701 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.94■□□□□ 0.46
EFTUD2-224ENST00000592701 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.92■□□□□ 0.46
EFTUD2-224ENST00000592701 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.9■□□□□ 0.46
EFTUD2-224ENST00000592701 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
EFTUD2-224ENST00000592701 KIF27Q86VH2 1401 aa17.88■□□□□ 0.45
EFTUD2-224ENST00000592701 CUX2O14529 1486 aa17.85■□□□□ 0.45
EFTUD2-224ENST00000592701 WDR62O43379 1518 aa17.83■□□□□ 0.45
EFTUD2-224ENST00000592701 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.83■□□□□ 0.45
EFTUD2-224ENST00000592701 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-224ENST00000592701 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-224ENST00000592701 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
EFTUD2-224ENST00000592701 KIF21BO75037 1637 aa17.77■□□□□ 0.44
EFTUD2-224ENST00000592701 GOLGA3Q08378 1498 aa17.76■□□□□ 0.43
EFTUD2-224ENST00000592701 WDR97A6NE52 1622 aa17.76■□□□□ 0.43
EFTUD2-224ENST00000592701 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
EFTUD2-224ENST00000592701 IFT140Q96RY7 1462 aa17.7■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 PRXQ9BXM0 1461 aa17.69■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 IGF1RP08069 1367 aa17.69■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.68■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.67■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.67■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.66■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.65■□□□□ 0.42
EFTUD2-224ENST00000592701 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.63■□□□□ 0.41
EFTUD2-224ENST00000592701 CUL7Q14999 1698 aa17.61■□□□□ 0.41
EFTUD2-224ENST00000592701 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.42e-11■■□□□ 13.5
EFTUD2-224ENST00000592701 PBRM1Q86U86 1689 aa17.57■□□□□ 0.4
EFTUD2-224ENST00000592701 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
EFTUD2-224ENST00000592701 CEP162Q5TB80 1403 aa17.55■□□□□ 0.4
EFTUD2-224ENST00000592701 GRIN2BQ13224 1484 aa17.55■□□□□ 0.4
EFTUD2-224ENST00000592701 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
EFTUD2-224ENST00000592701 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.47■□□□□ 0.39
EFTUD2-224ENST00000592701 ADAMTS12P58397 1594 aa17.47■□□□□ 0.39
EFTUD2-224ENST00000592701 CLIP1P30622 1438 aa17.47■□□□□ 0.39
EFTUD2-224ENST00000592701 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.44■□□□□ 0.38
EFTUD2-224ENST00000592701 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
EFTUD2-224ENST00000592701 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
EFTUD2-224ENST00000592701 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.39■□□□□ 0.37
EFTUD2-224ENST00000592701 SYNJ2O15056 1496 aa17.34■□□□□ 0.37
EFTUD2-224ENST00000592701 GRIN2AQ12879 1464 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms