RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.2■■■■□ 3.87
POLR2E-210ENST00000592597 ABCC9O60706 1549 aa36.48■■■■□ 3.43
POLR2E-210ENST00000592597 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.48■■■■□ 3.27
POLR2E-210ENST00000592597 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.03■■■■□ 3.2
POLR2E-210ENST00000592597 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.2■■■■□ 3.07
POLR2E-210ENST00000592597 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.89■■■■□ 3.02
POLR2E-210ENST00000592597 NACADO15069 1562 aa33.73■■■□□ 2.99
POLR2E-210ENST00000592597 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.68■■■□□ 2.98
POLR2E-210ENST00000592597 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.59■■■□□ 2.97
POLR2E-210ENST00000592597 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.32■■■□□ 2.92
POLR2E-210ENST00000592597 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.88■■■□□ 2.85
POLR2E-210ENST00000592597 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.87■■■□□ 2.85
POLR2E-210ENST00000592597 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.86■■■□□ 2.85
POLR2E-210ENST00000592597 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.64■■■□□ 2.82
POLR2E-210ENST00000592597 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
POLR2E-210ENST00000592597 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.53■■■□□ 2.8
POLR2E-210ENST00000592597 SCRIBQ14160 1630 aa32.44■■■□□ 2.78
POLR2E-210ENST00000592597 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
POLR2E-210ENST00000592597 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.2■■■□□ 2.74
POLR2E-210ENST00000592597 CUX2O14529 1486 aa31.6■■■□□ 2.65
POLR2E-210ENST00000592597 ERCC6Q03468 1493 aa31.49■■■□□ 2.63
POLR2E-210ENST00000592597 NCAPD3P42695 1498 aa31.16■■■□□ 2.58
POLR2E-210ENST00000592597 NESP48681 1621 aa31.12■■■□□ 2.57
POLR2E-210ENST00000592597 TRIM41Q8WV44 630 aa31.01■■■□□ 2.55
POLR2E-210ENST00000592597 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.01■■■□□ 2.55
POLR2E-210ENST00000592597 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
POLR2E-210ENST00000592597 HMGXB3Q12766 1538 aa30.83■■■□□ 2.53
POLR2E-210ENST00000592597 SMARCA2P51531 1590 aa30.82■■■□□ 2.52
POLR2E-210ENST00000592597 SMARCA4P51532 1647 aa30.78■■■□□ 2.52
POLR2E-210ENST00000592597 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.68■■■□□ 2.5
POLR2E-210ENST00000592597 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
POLR2E-210ENST00000592597 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.6■■■□□ 2.49
POLR2E-210ENST00000592597 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.46■■■□□ 2.47
POLR2E-210ENST00000592597 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
POLR2E-210ENST00000592597 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.39■■■□□ 2.46
POLR2E-210ENST00000592597 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.27■■■□□ 2.44
POLR2E-210ENST00000592597 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.27■■■□□ 2.44
POLR2E-210ENST00000592597 WDR62O43379 1518 aa30.22■■■□□ 2.43
POLR2E-210ENST00000592597 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.21■■■□□ 2.43
POLR2E-210ENST00000592597 OSCARQ8IYS5 282 aa30.12■■■□□ 2.41
POLR2E-210ENST00000592597 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.99■■■□□ 2.39
POLR2E-210ENST00000592597 WIZO95785 1651 aa29.91■■■□□ 2.38
POLR2E-210ENST00000592597 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.91■■■□□ 2.38
POLR2E-210ENST00000592597 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.86■■■□□ 2.37
POLR2E-210ENST00000592597 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.86■■■□□ 2.37
POLR2E-210ENST00000592597 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.86■■■□□ 2.37
POLR2E-210ENST00000592597 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
POLR2E-210ENST00000592597 CFTRP13569 1480 aa29.68■■■□□ 2.34
POLR2E-210ENST00000592597 ARHGEF11O15085 1522 aa29.64■■■□□ 2.34
POLR2E-210ENST00000592597 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.57■■■□□ 2.32
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
POLR2E-210ENST00000592597 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
POLR2E-210ENST00000592597 IFT140Q96RY7 1462 aa29.39■■■□□ 2.3
POLR2E-210ENST00000592597 PRDM2Q13029 1718 aa29.37■■■□□ 2.29
POLR2E-210ENST00000592597 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
POLR2E-210ENST00000592597 CHD1O14646 1710 aa29.31■■■□□ 2.28
POLR2E-210ENST00000592597 ARAP1Q96P48 1450 aa29.3■■■□□ 2.28
POLR2E-210ENST00000592597 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
POLR2E-210ENST00000592597 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
POLR2E-210ENST00000592597 TOPBP1Q92547 1522 aa29.25■■■□□ 2.27
POLR2E-210ENST00000592597 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
POLR2E-210ENST00000592597 FBLN2P98095 1184 aa29.22■■■□□ 2.27
POLR2E-210ENST00000592597 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.263e-7■■■■■ 35
POLR2E-210ENST00000592597 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.1■■■□□ 2.25
POLR2E-210ENST00000592597 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
POLR2E-210ENST00000592597 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.04■■■□□ 2.24
POLR2E-210ENST00000592597 ABCC8Q09428 1581 aa29.01■■■□□ 2.24
POLR2E-210ENST00000592597 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
POLR2E-210ENST00000592597 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.9■■■□□ 2.22
POLR2E-210ENST00000592597 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
POLR2E-210ENST00000592597 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.84■■■□□ 2.21
POLR2E-210ENST00000592597 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.81■■■□□ 2.2
POLR2E-210ENST00000592597 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
POLR2E-210ENST00000592597 SOGA1O94964 1423 aa28.77■■■□□ 2.2
POLR2E-210ENST00000592597 SYNJ1O43426 1573 aa28.73■■■□□ 2.19
POLR2E-210ENST00000592597 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.64■■■□□ 2.17
POLR2E-210ENST00000592597 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.62■■■□□ 2.17
POLR2E-210ENST00000592597 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
POLR2E-210ENST00000592597 SYNJ2O15056 1496 aa28.56■■■□□ 2.16
POLR2E-210ENST00000592597 GRIN2BQ13224 1484 aa28.56■■■□□ 2.16
POLR2E-210ENST00000592597 WDR97A6NE52 1622 aa28.54■■■□□ 2.16
POLR2E-210ENST00000592597 PBRM1Q86U86 1689 aa28.48■■■□□ 2.15
POLR2E-210ENST00000592597 CUX1P39880 1505 aa28.47■■■□□ 2.15
POLR2E-210ENST00000592597 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.46■■■□□ 2.15
POLR2E-210ENST00000592597 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.32■■■□□ 2.12
POLR2E-210ENST00000592597 CEP170Q5SW79 1584 aa28.25■■■□□ 2.11
POLR2E-210ENST00000592597 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.24■■■□□ 2.11
POLR2E-210ENST00000592597 GRIN2AQ12879 1464 aa28.21■■■□□ 2.11
POLR2E-210ENST00000592597 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.18■■■□□ 2.1
POLR2E-210ENST00000592597 NUP160Q12769 1436 aa28.11■■■□□ 2.09
POLR2E-210ENST00000592597 SHROOM2Q13796 1616 aa28.1■■■□□ 2.09
POLR2E-210ENST00000592597 ADAMTS12P58397 1594 aa28.09■■■□□ 2.09
POLR2E-210ENST00000592597 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
POLR2E-210ENST00000592597 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.06■■■□□ 2.08
POLR2E-210ENST00000592597 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.04■■■□□ 2.08
POLR2E-210ENST00000592597 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
POLR2E-210ENST00000592597 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.95■■■□□ 2.07
POLR2E-210ENST00000592597 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.95■■■□□ 2.06
POLR2E-210ENST00000592597 TSPOAP1O95153 1857 aa27.91■■■□□ 2.06
POLR2E-210ENST00000592597 JPH4Q96JJ6 628 aa27.91■■■□□ 2.06
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