RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591231.5

CHST8-204, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 8, humanhuman

TSL 2

Gene CHST8, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST8-204ENST00000591231 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.83■■■■■ 6.05
CHST8-204ENST00000591231 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.94■■■■■ 5.11
CHST8-204ENST00000591231 ABCC9O60706 1549 aa45.87■■■■■ 4.93
CHST8-204ENST00000591231 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.21■■■■■ 4.67
CHST8-204ENST00000591231 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.18■■■■■ 4.66
CHST8-204ENST00000591231 NACADO15069 1562 aa44.16■■■■■ 4.66
CHST8-204ENST00000591231 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
CHST8-204ENST00000591231 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.91■■■■■ 4.62
CHST8-204ENST00000591231 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.73■■■■■ 4.59
CHST8-204ENST00000591231 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.16■■■■■ 4.5
CHST8-204ENST00000591231 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.92■■■■■ 4.46
CHST8-204ENST00000591231 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.8■■■■■ 4.44
CHST8-204ENST00000591231 SCRIBQ14160 1630 aa42.79■■■■■ 4.44
CHST8-204ENST00000591231 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.39■■■■■ 4.38
CHST8-204ENST00000591231 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.1■■■■■ 4.33
CHST8-204ENST00000591231 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
CHST8-204ENST00000591231 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.51■■■■■ 4.24
CHST8-204ENST00000591231 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.23■■■■■ 4.19
CHST8-204ENST00000591231 SMARCA4P51532 1647 aa40.96■■■■■ 4.15
CHST8-204ENST00000591231 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
CHST8-204ENST00000591231 NCAPD3P42695 1498 aa40.76■■■■■ 4.12
CHST8-204ENST00000591231 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.76■■■■■ 4.12
CHST8-204ENST00000591231 SMARCA2P51531 1590 aa40.72■■■■■ 4.11
CHST8-204ENST00000591231 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.69■■■■■ 4.11
CHST8-204ENST00000591231 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.57■■■■■ 4.09
CHST8-204ENST00000591231 HMGXB3Q12766 1538 aa40.51■■■■■ 4.08
CHST8-204ENST00000591231 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
CHST8-204ENST00000591231 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
CHST8-204ENST00000591231 WIZO95785 1651 aa40.27■■■■■ 4.04
CHST8-204ENST00000591231 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
CHST8-204ENST00000591231 NESP48681 1621 aa39.7■■■■□ 3.95
CHST8-204ENST00000591231 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.66■■■■□ 3.94
CHST8-204ENST00000591231 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.58■■■■□ 3.93
CHST8-204ENST00000591231 ERCC6Q03468 1493 aa39.56■■■■□ 3.92
CHST8-204ENST00000591231 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.42■■■■□ 3.9
CHST8-204ENST00000591231 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.4■■■■□ 3.9
CHST8-204ENST00000591231 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
CHST8-204ENST00000591231 CFTRP13569 1480 aa39.32■■■■□ 3.89
CHST8-204ENST00000591231 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.23■■■■□ 3.87
CHST8-204ENST00000591231 CUX2O14529 1486 aa39.13■■■■□ 3.85
CHST8-204ENST00000591231 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.08■■■■□ 3.85
CHST8-204ENST00000591231 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
CHST8-204ENST00000591231 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.04■■■■□ 3.84
CHST8-204ENST00000591231 PRDM2Q13029 1718 aa39.03■■■■□ 3.84
CHST8-204ENST00000591231 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.96■■■■□ 3.83
CHST8-204ENST00000591231 WDR62O43379 1518 aa38.81■■■■□ 3.8
CHST8-204ENST00000591231 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
CHST8-204ENST00000591231 ABCC8Q09428 1581 aa38.53■■■■□ 3.76
CHST8-204ENST00000591231 TOPBP1Q92547 1522 aa38.46■■■■□ 3.75
CHST8-204ENST00000591231 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.41■■■■□ 3.74
CHST8-204ENST00000591231 IFT140Q96RY7 1462 aa38.22■■■■□ 3.71
CHST8-204ENST00000591231 CUX1P39880 1505 aa38.17■■■■□ 3.7
CHST8-204ENST00000591231 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
CHST8-204ENST00000591231 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.04■■■■□ 3.68
CHST8-204ENST00000591231 SOGA1O94964 1423 aa38.04■■■■□ 3.68
CHST8-204ENST00000591231 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
CHST8-204ENST00000591231 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.67
CHST8-204ENST00000591231 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.97■■■■□ 3.67
CHST8-204ENST00000591231 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.96■■■■□ 3.67
CHST8-204ENST00000591231 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.94■■■■□ 3.66
CHST8-204ENST00000591231 TOP2BQ02880 1626 aa37.87■■■■□ 3.65
CHST8-204ENST00000591231 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.87■■■■□ 3.65
CHST8-204ENST00000591231 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
CHST8-204ENST00000591231 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.84■■■■□ 3.65
CHST8-204ENST00000591231 SYNJ1O43426 1573 aa37.82■■■■□ 3.65
CHST8-204ENST00000591231 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
CHST8-204ENST00000591231 WDR97A6NE52 1622 aa37.76■■■■□ 3.64
CHST8-204ENST00000591231 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.7■■■■□ 3.63
CHST8-204ENST00000591231 OSCARQ8IYS5 282 aa37.61■■■■□ 3.61
CHST8-204ENST00000591231 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.57■■■■□ 3.6
CHST8-204ENST00000591231 GRIN2BQ13224 1484 aa37.55■■■■□ 3.6
CHST8-204ENST00000591231 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.5■■■■□ 3.59
CHST8-204ENST00000591231 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.45■■■■□ 3.59
CHST8-204ENST00000591231 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
CHST8-204ENST00000591231 PBRM1Q86U86 1689 aa37.44■■■■□ 3.58
CHST8-204ENST00000591231 FBLN2P98095 1184 aa37.42■■■■□ 3.58
CHST8-204ENST00000591231 CHD1O14646 1710 aa37.39■■■■□ 3.58
CHST8-204ENST00000591231 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
CHST8-204ENST00000591231 SYNJ2O15056 1496 aa37.29■■■■□ 3.56
CHST8-204ENST00000591231 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.26■■■■□ 3.55
CHST8-204ENST00000591231 KIF27Q86VH2 1401 aa37.2■■■■□ 3.55
CHST8-204ENST00000591231 TRIM41Q8WV44 630 aa37.19■■■■□ 3.54
CHST8-204ENST00000591231 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.14■■■■□ 3.54
CHST8-204ENST00000591231 ADAMTS12P58397 1594 aa37.13■■■■□ 3.53
CHST8-204ENST00000591231 IGF1RP08069 1367 aa37.05■■■■□ 3.52
CHST8-204ENST00000591231 GRIN2AQ12879 1464 aa37.05■■■■□ 3.52
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CHST8-204ENST00000591231 ARHGEF11O15085 1522 aa36.89■■■■□ 3.5
CHST8-204ENST00000591231 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.88■■■■□ 3.5
CHST8-204ENST00000591231 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.88■■■■□ 3.5
CHST8-204ENST00000591231 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.88■■■■□ 3.5
CHST8-204ENST00000591231 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.85■■■■□ 3.49
CHST8-204ENST00000591231 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.84■■■■□ 3.49
CHST8-204ENST00000591231 CEP170Q5SW79 1584 aa36.83■■■■□ 3.49
CHST8-204ENST00000591231 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.73■■■■□ 3.47
CHST8-204ENST00000591231 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.63■■■■□ 3.45
CHST8-204ENST00000591231 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.61■■■■□ 3.45
CHST8-204ENST00000591231 JPH4Q96JJ6 628 aa36.6■■■■□ 3.45
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