RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591152.5

PSME3-211, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene PSME3, Length 1,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-211ENST00000591152 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.22■■■■■ 6.11
PSME3-211ENST00000591152 ABCC9O60706 1549 aa49■■■■■ 5.43
PSME3-211ENST00000591152 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.99■■■■■ 5.27
PSME3-211ENST00000591152 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.73■■■■■ 5.07
PSME3-211ENST00000591152 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.14■■■■■ 4.98
PSME3-211ENST00000591152 NACADO15069 1562 aa45.61■■■■■ 4.89
PSME3-211ENST00000591152 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.59■■■■■ 4.89
PSME3-211ENST00000591152 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.55■■■■■ 4.88
PSME3-211ENST00000591152 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.09■■■■■ 4.81
PSME3-211ENST00000591152 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.86■■■■■ 4.77
PSME3-211ENST00000591152 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.63■■■■■ 4.73
PSME3-211ENST00000591152 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.18■■■■■ 4.66
PSME3-211ENST00000591152 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.13■■■■■ 4.66
PSME3-211ENST00000591152 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.02■■■■■ 4.64
PSME3-211ENST00000591152 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
PSME3-211ENST00000591152 SCRIBQ14160 1630 aa43.86■■■■■ 4.61
PSME3-211ENST00000591152 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
PSME3-211ENST00000591152 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.79■■■■■ 4.6
PSME3-211ENST00000591152 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.42■■■■■ 4.54
PSME3-211ENST00000591152 CUX2O14529 1486 aa42.43■■■■■ 4.38
PSME3-211ENST00000591152 ERCC6Q03468 1493 aa42.35■■■■■ 4.37
PSME3-211ENST00000591152 NCAPD3P42695 1498 aa42.15■■■■■ 4.34
PSME3-211ENST00000591152 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.95■■■■■ 4.31
PSME3-211ENST00000591152 NESP48681 1621 aa41.86■■■■■ 4.29
PSME3-211ENST00000591152 SMARCA2P51531 1590 aa41.74■■■■■ 4.27
PSME3-211ENST00000591152 HMGXB3Q12766 1538 aa41.71■■■■■ 4.27
PSME3-211ENST00000591152 SMARCA4P51532 1647 aa41.67■■■■■ 4.26
PSME3-211ENST00000591152 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
PSME3-211ENST00000591152 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
PSME3-211ENST00000591152 TRIM41Q8WV44 630 aa41.34■■■■■ 4.21
PSME3-211ENST00000591152 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
PSME3-211ENST00000591152 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.3■■■■■ 4.2
PSME3-211ENST00000591152 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.21■■■■■ 4.19
PSME3-211ENST00000591152 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.2■■■■■ 4.19
PSME3-211ENST00000591152 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.16■■■■■ 4.18
PSME3-211ENST00000591152 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.04■■■■■ 4.16
PSME3-211ENST00000591152 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.88■■■■■ 4.14
PSME3-211ENST00000591152 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.84■■■■■ 4.13
PSME3-211ENST00000591152 WDR62O43379 1518 aa40.73■■■■■ 4.11
PSME3-211ENST00000591152 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.53■■■■■ 4.08
PSME3-211ENST00000591152 WIZO95785 1651 aa40.52■■■■■ 4.08
PSME3-211ENST00000591152 OSCARQ8IYS5 282 aa40.48■■■■■ 4.07
PSME3-211ENST00000591152 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.43■■■■■ 4.06
PSME3-211ENST00000591152 CFTRP13569 1480 aa40.21■■■■■ 4.03
PSME3-211ENST00000591152 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
PSME3-211ENST00000591152 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.98■■■■□ 3.99
PSME3-211ENST00000591152 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.98■■■■□ 3.99
PSME3-211ENST00000591152 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.98■■■■□ 3.99
PSME3-211ENST00000591152 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
PSME3-211ENST00000591152 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
PSME3-211ENST00000591152 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
PSME3-211ENST00000591152 ARHGEF11O15085 1522 aa39.77■■■■□ 3.96
PSME3-211ENST00000591152 IFT140Q96RY7 1462 aa39.74■■■■□ 3.95
PSME3-211ENST00000591152 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.67■■■■□ 3.94
PSME3-211ENST00000591152 PRDM2Q13029 1718 aa39.63■■■■□ 3.94
PSME3-211ENST00000591152 TOPBP1Q92547 1522 aa39.55■■■■□ 3.92
PSME3-211ENST00000591152 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.52■■■■□ 3.92
PSME3-211ENST00000591152 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
PSME3-211ENST00000591152 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
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PSME3-211ENST00000591152 CHD1O14646 1710 aa39.35■■■■□ 3.89
PSME3-211ENST00000591152 ABCC8Q09428 1581 aa39.35■■■■□ 3.89
PSME3-211ENST00000591152 ARAP1Q96P48 1450 aa39.34■■■■□ 3.89
PSME3-211ENST00000591152 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.3■■■■□ 3.88
PSME3-211ENST00000591152 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
PSME3-211ENST00000591152 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
PSME3-211ENST00000591152 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.05■■■■□ 3.84
PSME3-211ENST00000591152 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
PSME3-211ENST00000591152 SOGA1O94964 1423 aa38.96■■■■□ 3.83
PSME3-211ENST00000591152 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
PSME3-211ENST00000591152 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.92■■■■□ 3.82
PSME3-211ENST00000591152 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
PSME3-211ENST00000591152 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.85■■■■□ 3.81
PSME3-211ENST00000591152 SYNJ1O43426 1573 aa38.78■■■■□ 3.8
PSME3-211ENST00000591152 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.77■■■■□ 3.8
PSME3-211ENST00000591152 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
PSME3-211ENST00000591152 WDR97A6NE52 1622 aa38.67■■■■□ 3.78
PSME3-211ENST00000591152 GRIN2BQ13224 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
PSME3-211ENST00000591152 SYNJ2O15056 1496 aa38.62■■■■□ 3.77
PSME3-211ENST00000591152 CUX1P39880 1505 aa38.6■■■■□ 3.77
PSME3-211ENST00000591152 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.57■■■■□ 3.76
PSME3-211ENST00000591152 PBRM1Q86U86 1689 aa38.42■■■■□ 3.74
PSME3-211ENST00000591152 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.29■■■■□ 3.72
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PSME3-211ENST00000591152 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.22■■■■□ 3.71
PSME3-211ENST00000591152 GRIN2AQ12879 1464 aa38.16■■■■□ 3.7
PSME3-211ENST00000591152 CEP170Q5SW79 1584 aa38.11■■■■□ 3.69
PSME3-211ENST00000591152 NUP160Q12769 1436 aa38.04■■■■□ 3.68
PSME3-211ENST00000591152 ADAMTS12P58397 1594 aa38.02■■■■□ 3.68
PSME3-211ENST00000591152 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.96■■■■□ 3.67
PSME3-211ENST00000591152 SHROOM2Q13796 1616 aa37.92■■■■□ 3.66
PSME3-211ENST00000591152 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.9■■■■□ 3.66
PSME3-211ENST00000591152 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.89■■■■□ 3.66
PSME3-211ENST00000591152 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
PSME3-211ENST00000591152 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.77■■■■□ 3.64
PSME3-211ENST00000591152 JPH4Q96JJ6 628 aa37.76■■■■□ 3.64
PSME3-211ENST00000591152 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
PSME3-211ENST00000591152 TOP2BQ02880 1626 aa37.71■■■■□ 3.63
PSME3-211ENST00000591152 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.71■■■■□ 3.63
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