RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590198.1

ROGDI-212, Transcript of rogdi homolog, humanhuman

TSL 3

Gene ROGDI, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDI-212ENST00000590198 NISCHQ9Y2I1 1504 aa73.91■■■■■ 9.42
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ROGDI-212ENST00000590198 MYO15BQ96JP2 1530 aa61.25■■■■■ 7.4
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ROGDI-212ENST00000590198 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.6■■■■■ 6.81
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ROGDI-212ENST00000590198 PEG3Q9GZU2 1588 aa56.67■■■■■ 6.66
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ROGDI-212ENST00000590198 NESP48681 1621 aa55.46■■■■■ 6.47
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ROGDI-212ENST00000590198 CADPSQ9ULU8 1353 aa55.25■■■■■ 6.43
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ROGDI-212ENST00000590198 CFTRP13569 1480 aa54.93■■■■■ 6.38
ROGDI-212ENST00000590198 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.75■■■■■ 6.36
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ROGDI-212ENST00000590198 CEP164Q9UPV0 1460 aa54.51■■■■■ 6.32
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ROGDI-212ENST00000590198 MRC2Q9UBG0 1479 aa54.37■■■■■ 6.29
ROGDI-212ENST00000590198 WDR62O43379 1518 aa54.14■■■■■ 6.26
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ROGDI-212ENST00000590198 TOPBP1Q92547 1522 aa53.76■■■■■ 6.2
ROGDI-212ENST00000590198 ABCC8Q09428 1581 aa53.74■■■■■ 6.19
ROGDI-212ENST00000590198 DNMBPQ6XZF7 1577 aa53.69■■■■■ 6.19
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ROGDI-212ENST00000590198 IFT140Q96RY7 1462 aa53.35■■■■■ 6.13
ROGDI-212ENST00000590198 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP53.31■■■■■ 6.12
ROGDI-212ENST00000590198 FGD5Q6ZNL6 1462 aa53.24■■■■■ 6.11
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ROGDI-212ENST00000590198 SOGA1O94964 1423 aa53.16■■■■■ 6.1
ROGDI-212ENST00000590198 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa53.14■■■■■ 6.1
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ROGDI-212ENST00000590198 TOP2BQ02880 1626 aa53.02■■■■■ 6.08
ROGDI-212ENST00000590198 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa52.99■■■■■ 6.07
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ROGDI-212ENST00000590198 WDR97A6NE52 1622 aa52.69■■■■■ 6.02
ROGDI-212ENST00000590198 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.53■■■■■ 6
ROGDI-212ENST00000590198 GAPVD1Q14C86 1478 aa52.51■■■■■ 6
ROGDI-212ENST00000590198 GRIN2BQ13224 1484 aa52.46■■■■■ 5.99
ROGDI-212ENST00000590198 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa52.44■■■■■ 5.98
ROGDI-212ENST00000590198 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa52.37■■■■■ 5.97
ROGDI-212ENST00000590198 PBRM1Q86U86 1689 aa52.32■■■■■ 5.97
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ROGDI-212ENST00000590198 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP52.14■■■■■ 5.94
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ROGDI-212ENST00000590198 NUP160Q12769 1436 aa51.52■■■■■ 5.84
ROGDI-212ENST00000590198 CEP170Q5SW79 1584 aa51.5■■■■■ 5.84
ROGDI-212ENST00000590198 ARHGEF11O15085 1522 aa51.38■■■■■ 5.82
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ROGDI-212ENST00000590198 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.36■■■■■ 5.81
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ROGDI-212ENST00000590198 EEA1Q15075 1411 aa51.22■■■■■ 5.79
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