RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589570.1

RDH8-202, Transcript of retinol dehydrogenase 8, humanhuman

TSL 3

Gene RDH8, Length 430 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8-202ENST00000589570 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.87■■■■■ 5.41
RDH8-202ENST00000589570 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.52■■■■■ 4.56
RDH8-202ENST00000589570 ABCC9O60706 1549 aa43.51■■■■■ 4.56
RDH8-202ENST00000589570 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.64■■■■■ 4.26
RDH8-202ENST00000589570 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.46■■■■■ 4.23
RDH8-202ENST00000589570 NACADO15069 1562 aa41.24■■■■■ 4.19
RDH8-202ENST00000589570 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.11
RDH8-202ENST00000589570 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.71■■■■■ 4.11
RDH8-202ENST00000589570 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.63■■■■■ 4.09
RDH8-202ENST00000589570 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
RDH8-202ENST00000589570 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.31■■■■■ 4.04
RDH8-202ENST00000589570 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.29■■■■■ 4.04
RDH8-202ENST00000589570 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.11■■■■■ 4.01
RDH8-202ENST00000589570 SCRIBQ14160 1630 aa39.81■■■■□ 3.96
RDH8-202ENST00000589570 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.62■■■■□ 3.93
RDH8-202ENST00000589570 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.2■■■■□ 3.87
RDH8-202ENST00000589570 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
RDH8-202ENST00000589570 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.15■■■■□ 3.86
RDH8-202ENST00000589570 NCAPD3P42695 1498 aa38.14■■■■□ 3.7
RDH8-202ENST00000589570 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.04■■■■□ 3.68
RDH8-202ENST00000589570 SMARCA4P51532 1647 aa37.97■■■■□ 3.67
RDH8-202ENST00000589570 SMARCA2P51531 1590 aa37.93■■■■□ 3.66
RDH8-202ENST00000589570 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
RDH8-202ENST00000589570 HMGXB3Q12766 1538 aa37.73■■■■□ 3.63
RDH8-202ENST00000589570 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
RDH8-202ENST00000589570 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.65■■■■□ 3.62
RDH8-202ENST00000589570 ERCC6Q03468 1493 aa37.6■■■■□ 3.61
RDH8-202ENST00000589570 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.55■■■■□ 3.6
RDH8-202ENST00000589570 NESP48681 1621 aa37.41■■■■□ 3.58
RDH8-202ENST00000589570 CUX2O14529 1486 aa37.29■■■■□ 3.56
RDH8-202ENST00000589570 WIZO95785 1651 aa37.18■■■■□ 3.54
RDH8-202ENST00000589570 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.14■■■■□ 3.54
RDH8-202ENST00000589570 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.14■■■■□ 3.54
RDH8-202ENST00000589570 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.1■■■■□ 3.53
RDH8-202ENST00000589570 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.08■■■■□ 3.53
RDH8-202ENST00000589570 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
RDH8-202ENST00000589570 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.77■■■■□ 3.48
RDH8-202ENST00000589570 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
RDH8-202ENST00000589570 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
RDH8-202ENST00000589570 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.62■■■■□ 3.45
RDH8-202ENST00000589570 CFTRP13569 1480 aa36.62■■■■□ 3.45
RDH8-202ENST00000589570 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.58■■■■□ 3.45
RDH8-202ENST00000589570 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.56■■■■□ 3.44
RDH8-202ENST00000589570 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.43■■■■□ 3.42
RDH8-202ENST00000589570 WDR62O43379 1518 aa36.43■■■■□ 3.42
RDH8-202ENST00000589570 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
RDH8-202ENST00000589570 PRDM2Q13029 1718 aa36■■■■□ 3.35
RDH8-202ENST00000589570 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
RDH8-202ENST00000589570 OSCARQ8IYS5 282 aa35.96■■■■□ 3.35
RDH8-202ENST00000589570 ABCC8Q09428 1581 aa35.92■■■■□ 3.34
RDH8-202ENST00000589570 TOPBP1Q92547 1522 aa35.88■■■■□ 3.33
RDH8-202ENST00000589570 IFT140Q96RY7 1462 aa35.85■■■■□ 3.33
RDH8-202ENST00000589570 TRIM41Q8WV44 630 aa35.76■■■■□ 3.32
RDH8-202ENST00000589570 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
RDH8-202ENST00000589570 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.72■■■■□ 3.31
RDH8-202ENST00000589570 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
RDH8-202ENST00000589570 SOGA1O94964 1423 aa35.55■■■■□ 3.28
RDH8-202ENST00000589570 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
RDH8-202ENST00000589570 FBLN2P98095 1184 aa35.51■■■■□ 3.28
RDH8-202ENST00000589570 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.47■■■■□ 3.27
RDH8-202ENST00000589570 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
RDH8-202ENST00000589570 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
RDH8-202ENST00000589570 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
RDH8-202ENST00000589570 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.36■■■■□ 3.25
RDH8-202ENST00000589570 CUX1P39880 1505 aa35.33■■■■□ 3.25
RDH8-202ENST00000589570 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
RDH8-202ENST00000589570 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.12■■■■□ 3.21
RDH8-202ENST00000589570 GRIN2BQ13224 1484 aa35.09■■■■□ 3.21
RDH8-202ENST00000589570 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.09■■■■□ 3.21
RDH8-202ENST00000589570 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.08■■■■□ 3.21
RDH8-202ENST00000589570 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.08■■■■□ 3.21
RDH8-202ENST00000589570 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.08■■■■□ 3.21
RDH8-202ENST00000589570 WDR97A6NE52 1622 aa35.07■■■■□ 3.21
RDH8-202ENST00000589570 CHD1O14646 1710 aa35.07■■■■□ 3.2
RDH8-202ENST00000589570 ARHGEF11O15085 1522 aa35.06■■■■□ 3.2
RDH8-202ENST00000589570 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.03■■■■□ 3.2
RDH8-202ENST00000589570 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.2
RDH8-202ENST00000589570 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
RDH8-202ENST00000589570 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.96■■■■□ 3.19
RDH8-202ENST00000589570 SYNJ2O15056 1496 aa34.91■■■■□ 3.18
RDH8-202ENST00000589570 TOP2BQ02880 1626 aa34.83■■■■□ 3.17
RDH8-202ENST00000589570 SYNJ1O43426 1573 aa34.82■■■■□ 3.16
RDH8-202ENST00000589570 PBRM1Q86U86 1689 aa34.76■■■■□ 3.16
RDH8-202ENST00000589570 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.76■■■■□ 3.15
RDH8-202ENST00000589570 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.74■■■■□ 3.15
RDH8-202ENST00000589570 ARAP1Q96P48 1450 aa34.71■■■■□ 3.15
RDH8-202ENST00000589570 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.7■■■■□ 3.14
RDH8-202ENST00000589570 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
RDH8-202ENST00000589570 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.61■■■■□ 3.13
RDH8-202ENST00000589570 GRIN2AQ12879 1464 aa34.59■■■■□ 3.13
RDH8-202ENST00000589570 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.52■■■■□ 3.12
RDH8-202ENST00000589570 ADAMTS12P58397 1594 aa34.48■■■■□ 3.11
RDH8-202ENST00000589570 NUP160Q12769 1436 aa34.44■■■■□ 3.1
RDH8-202ENST00000589570 JPH4Q96JJ6 628 aa34.39■■■■□ 3.1
RDH8-202ENST00000589570 CEP170Q5SW79 1584 aa34.36■■■■□ 3.09
RDH8-202ENST00000589570 KIF27Q86VH2 1401 aa34.36■■■■□ 3.09
RDH8-202ENST00000589570 IGF1RP08069 1367 aa34.34■■■■□ 3.09
RDH8-202ENST00000589570 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
RDH8-202ENST00000589570 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.23■■■■□ 3.07
RDH8-202ENST00000589570 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.14■■■■□ 3.06
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