RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588439.1

TYROBP-208, Transcript of TYRO protein tyrosine kinase binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TYROBP, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYROBP-208ENST00000588439 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.7■■■■■ 5.39
TYROBP-208ENST00000588439 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.04■■■■■ 4.48
TYROBP-208ENST00000588439 ABCC9O60706 1549 aa41.44■■■■■ 4.23
TYROBP-208ENST00000588439 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
TYROBP-208ENST00000588439 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.38■■■■■ 4.06
TYROBP-208ENST00000588439 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.34■■■■■ 4.05
TYROBP-208ENST00000588439 NACADO15069 1562 aa40.31■■■■■ 4.04
TYROBP-208ENST00000588439 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.24■■■■■ 4.03
TYROBP-208ENST00000588439 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.18■■■■■ 4.02
TYROBP-208ENST00000588439 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.29■■■■□ 3.88
TYROBP-208ENST00000588439 SCRIBQ14160 1630 aa39.25■■■■□ 3.87
TYROBP-208ENST00000588439 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.99■■■■□ 3.83
TYROBP-208ENST00000588439 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.8■■■■□ 3.8
TYROBP-208ENST00000588439 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.69■■■■□ 3.78
TYROBP-208ENST00000588439 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
TYROBP-208ENST00000588439 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.85■■■■□ 3.65
TYROBP-208ENST00000588439 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
TYROBP-208ENST00000588439 SMARCA4P51532 1647 aa37.65■■■■□ 3.62
TYROBP-208ENST00000588439 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.55■■■■□ 3.6
TYROBP-208ENST00000588439 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.53■■■■□ 3.6
TYROBP-208ENST00000588439 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.53■■■■□ 3.6
TYROBP-208ENST00000588439 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.34■■■■□ 3.57
TYROBP-208ENST00000588439 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
TYROBP-208ENST00000588439 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.3■■■■□ 3.56
TYROBP-208ENST00000588439 SMARCA2P51531 1590 aa37.27■■■■□ 3.56
TYROBP-208ENST00000588439 NCAPD3P42695 1498 aa37.2■■■■□ 3.55
TYROBP-208ENST00000588439 WIZO95785 1651 aa37.13■■■■□ 3.53
TYROBP-208ENST00000588439 HMGXB3Q12766 1538 aa37.08■■■■□ 3.53
TYROBP-208ENST00000588439 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
TYROBP-208ENST00000588439 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
TYROBP-208ENST00000588439 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
TYROBP-208ENST00000588439 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.36■■■■□ 3.41
TYROBP-208ENST00000588439 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.12■■■■□ 3.37
TYROBP-208ENST00000588439 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.1■■■■□ 3.37
TYROBP-208ENST00000588439 NESP48681 1621 aa36.07■■■■□ 3.36
TYROBP-208ENST00000588439 CFTRP13569 1480 aa36.06■■■■□ 3.36
TYROBP-208ENST00000588439 PRDM2Q13029 1718 aa35.82■■■■□ 3.32
TYROBP-208ENST00000588439 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.81■■■■□ 3.32
TYROBP-208ENST00000588439 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.69■■■■□ 3.3
TYROBP-208ENST00000588439 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.66■■■■□ 3.3
TYROBP-208ENST00000588439 ERCC6Q03468 1493 aa35.64■■■■□ 3.3
TYROBP-208ENST00000588439 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.58■■■■□ 3.29
TYROBP-208ENST00000588439 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
TYROBP-208ENST00000588439 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.41■■■■□ 3.26
TYROBP-208ENST00000588439 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
TYROBP-208ENST00000588439 WDR62O43379 1518 aa35.32■■■■□ 3.24
TYROBP-208ENST00000588439 ABCC8Q09428 1581 aa35.23■■■■□ 3.23
TYROBP-208ENST00000588439 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.22■■■■□ 3.23
TYROBP-208ENST00000588439 TOPBP1Q92547 1522 aa35.21■■■■□ 3.23
TYROBP-208ENST00000588439 CUX1P39880 1505 aa35.17■■■■□ 3.22
TYROBP-208ENST00000588439 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.15■■■■□ 3.22
TYROBP-208ENST00000588439 CUX2O14529 1486 aa35.13■■■■□ 3.21
TYROBP-208ENST00000588439 SYNJ1O43426 1573 aa35.05■■■■□ 3.2
TYROBP-208ENST00000588439 TOP2BQ02880 1626 aa35.04■■■■□ 3.2
TYROBP-208ENST00000588439 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.03■■■■□ 3.2
TYROBP-208ENST00000588439 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
TYROBP-208ENST00000588439 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.93■■■■□ 3.18
TYROBP-208ENST00000588439 IFT140Q96RY7 1462 aa34.83■■■■□ 3.17
TYROBP-208ENST00000588439 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
TYROBP-208ENST00000588439 SOGA1O94964 1423 aa34.78■■■■□ 3.16
TYROBP-208ENST00000588439 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.77■■■■□ 3.16
TYROBP-208ENST00000588439 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.7■■■■□ 3.15
TYROBP-208ENST00000588439 WDR97A6NE52 1622 aa34.66■■■■□ 3.14
TYROBP-208ENST00000588439 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.66■■■■□ 3.14
TYROBP-208ENST00000588439 TRIM41Q8WV44 630 aa34.66■■■■□ 3.14
TYROBP-208ENST00000588439 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
TYROBP-208ENST00000588439 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
TYROBP-208ENST00000588439 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
TYROBP-208ENST00000588439 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.48■■■■□ 3.11
TYROBP-208ENST00000588439 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.47■■■■□ 3.11
TYROBP-208ENST00000588439 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.4■■■■□ 3.1
TYROBP-208ENST00000588439 KIF27Q86VH2 1401 aa34.36■■■■□ 3.09
TYROBP-208ENST00000588439 GRIN2BQ13224 1484 aa34.32■■■■□ 3.08
TYROBP-208ENST00000588439 PBRM1Q86U86 1689 aa34.29■■■■□ 3.08
TYROBP-208ENST00000588439 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.25■■■■□ 3.07
TYROBP-208ENST00000588439 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.25■■■■□ 3.07
TYROBP-208ENST00000588439 IGF1RP08069 1367 aa34.18■■■■□ 3.06
TYROBP-208ENST00000588439 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.18■■■■□ 3.06
TYROBP-208ENST00000588439 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
TYROBP-208ENST00000588439 EEA1Q15075 1411 aa34.13■■■■□ 3.05
TYROBP-208ENST00000588439 ADAMTS12P58397 1594 aa34.08■■■■□ 3.05
TYROBP-208ENST00000588439 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.04■■■■□ 3.04
TYROBP-208ENST00000588439 CUL7Q14999 1698 aa34.04■■■■□ 3.04
TYROBP-208ENST00000588439 SYNJ2O15056 1496 aa34.03■■■■□ 3.04
TYROBP-208ENST00000588439 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.96■■■■□ 3.03
TYROBP-208ENST00000588439 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.95■■■■□ 3.03
TYROBP-208ENST00000588439 CHD1O14646 1710 aa33.93■■■■□ 3.02
TYROBP-208ENST00000588439 PRXQ9BXM0 1461 aa33.91■■■■□ 3.02
TYROBP-208ENST00000588439 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
TYROBP-208ENST00000588439 GRIN2AQ12879 1464 aa33.88■■■■□ 3.01
TYROBP-208ENST00000588439 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
TYROBP-208ENST00000588439 FBLN2P98095 1184 aa33.83■■■■□ 3.01
TYROBP-208ENST00000588439 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.82■■■■□ 3.01
TYROBP-208ENST00000588439 NUP160Q12769 1436 aa33.75■■■□□ 2.99
TYROBP-208ENST00000588439 KIF21BO75037 1637 aa33.74■■■□□ 2.99
TYROBP-208ENST00000588439 OSCARQ8IYS5 282 aa33.72■■■□□ 2.99
TYROBP-208ENST00000588439 CEP170Q5SW79 1584 aa33.7■■■□□ 2.99
TYROBP-208ENST00000588439 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.64■■■□□ 2.98
TYROBP-208ENST00000588439 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.55■■■□□ 2.96
TYROBP-208ENST00000588439 GOLGA3Q08378 1498 aa33.55■■■□□ 2.96
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