RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585149.1

TSPOAP1-211, Transcript of TSPO associated protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1, Length 381 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-211ENST00000585149 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.41■■■■■ 4.06
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TSPOAP1-211ENST00000585149 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
TSPOAP1-211ENST00000585149 NACADO15069 1562 aa33.52■■■□□ 2.96
TSPOAP1-211ENST00000585149 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.47■■■□□ 2.95
TSPOAP1-211ENST00000585149 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.46■■■□□ 2.95
TSPOAP1-211ENST00000585149 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.44■■■□□ 2.94
TSPOAP1-211ENST00000585149 SCRIBQ14160 1630 aa32.63■■■□□ 2.81
TSPOAP1-211ENST00000585149 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.63■■■□□ 2.81
TSPOAP1-211ENST00000585149 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.37■■■□□ 2.77
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TSPOAP1-211ENST00000585149 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.23■■■□□ 2.75
TSPOAP1-211ENST00000585149 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-211ENST00000585149 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.38■■■□□ 2.61
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TSPOAP1-211ENST00000585149 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.25■■■□□ 2.59
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TSPOAP1-211ENST00000585149 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.11■■■□□ 2.57
TSPOAP1-211ENST00000585149 SMARCA2P51531 1590 aa31.01■■■□□ 2.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.96■■■□□ 2.55
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TSPOAP1-211ENST00000585149 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.92■■■□□ 2.54
TSPOAP1-211ENST00000585149 NCAPD3P42695 1498 aa30.9■■■□□ 2.54
TSPOAP1-211ENST00000585149 WIZO95785 1651 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-211ENST00000585149 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
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TSPOAP1-211ENST00000585149 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-211ENST00000585149 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.05■■■□□ 2.4
TSPOAP1-211ENST00000585149 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPOAP1-211ENST00000585149 NESP48681 1621 aa29.97■■■□□ 2.39
TSPOAP1-211ENST00000585149 CFTRP13569 1480 aa29.93■■■□□ 2.38
TSPOAP1-211ENST00000585149 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPOAP1-211ENST00000585149 ERCC6Q03468 1493 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPOAP1-211ENST00000585149 PRDM2Q13029 1718 aa29.78■■■□□ 2.36
TSPOAP1-211ENST00000585149 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.69■■■□□ 2.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.66■■■□□ 2.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.64■■■□□ 2.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.48■■■□□ 2.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 ABCC8Q09428 1581 aa29.38■■■□□ 2.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 WDR62O43379 1518 aa29.33■■■□□ 2.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
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TSPOAP1-211ENST00000585149 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.27■■■□□ 2.28
TSPOAP1-211ENST00000585149 TOPBP1Q92547 1522 aa29.25■■■□□ 2.27
TSPOAP1-211ENST00000585149 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-211ENST00000585149 CUX1P39880 1505 aa29.16■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-211ENST00000585149 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.05■■■□□ 2.24
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TSPOAP1-211ENST00000585149 IFT140Q96RY7 1462 aa28.99■■■□□ 2.23
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TSPOAP1-211ENST00000585149 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.89■■■□□ 2.22
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TSPOAP1-211ENST00000585149 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-211ENST00000585149 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-211ENST00000585149 WDR97A6NE52 1622 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-211ENST00000585149 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-211ENST00000585149 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.59■■■□□ 2.17
TSPOAP1-211ENST00000585149 GRIN2BQ13224 1484 aa28.57■■■□□ 2.16
TSPOAP1-211ENST00000585149 PBRM1Q86U86 1689 aa28.52■■■□□ 2.16
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TSPOAP1-211ENST00000585149 EEA1Q15075 1411 aa28.39■■■□□ 2.14
TSPOAP1-211ENST00000585149 FBLN2P98095 1184 aa28.38■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-211ENST00000585149 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-211ENST00000585149 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.33■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-211ENST00000585149 ADAMTS12P58397 1594 aa28.29■■■□□ 2.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.26■■■□□ 2.12
TSPOAP1-211ENST00000585149 CHD1O14646 1710 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-211ENST00000585149 OSCARQ8IYS5 282 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-211ENST00000585149 GRIN2AQ12879 1464 aa28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-211ENST00000585149 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-211ENST00000585149 PRXQ9BXM0 1461 aa28.09■■■□□ 2.09
TSPOAP1-211ENST00000585149 NUP160Q12769 1436 aa28.01■■■□□ 2.07
TSPOAP1-211ENST00000585149 KIF21BO75037 1637 aa27.99■■■□□ 2.07
TSPOAP1-211ENST00000585149 CEP170Q5SW79 1584 aa27.98■■■□□ 2.07
TSPOAP1-211ENST00000585149 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.92■■■□□ 2.06
TSPOAP1-211ENST00000585149 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-211ENST00000585149 GOLGA3Q08378 1498 aa27.89■■■□□ 2.05
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