RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.07■□□□□ 0.8
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GGA3-218ENST00000584243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.86■□□□□ 0.77
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.36■□□□□ 0.69
GGA3-218ENST00000584243 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.38■□□□□ 0.53
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GGA3-218ENST00000584243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.87■□□□□ 0.45
GGA3-218ENST00000584243 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.86■□□□□ 0.45
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GGA3-218ENST00000584243 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.61■□□□□ 0.25
GGA3-218ENST00000584243 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.61■□□□□ 0.25
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GGA3-218ENST00000584243 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
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GGA3-218ENST00000584243 NCAPD3P42695 1498 aa16.44■□□□□ 0.22
GGA3-218ENST00000584243 ARHGEF11O15085 1522 aa16.41■□□□□ 0.22
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GGA3-218ENST00000584243 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.23■□□□□ 0.19
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GGA3-218ENST00000584243 ARAP1Q96P48 1450 aa16.19■□□□□ 0.18
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GGA3-218ENST00000584243 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.84■□□□□ 0.13
GGA3-218ENST00000584243 SMARCA4P51532 1647 aa15.82■□□□□ 0.12
GGA3-218ENST00000584243 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
GGA3-218ENST00000584243 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.79■□□□□ 0.12
GGA3-218ENST00000584243 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.78■□□□□ 0.12
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GGA3-218ENST00000584243 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.53■□□□□ 0.08
GGA3-218ENST00000584243 IFT140Q96RY7 1462 aa15.52■□□□□ 0.08
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GGA3-218ENST00000584243 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.37■□□□□ 0.05
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GGA3-218ENST00000584243 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.33■□□□□ 0.05
GGA3-218ENST00000584243 KDM6BO15054 1643 aa15.28■□□□□ 0.04
GGA3-218ENST00000584243 SYNJ1O43426 1573 aa15.25■□□□□ 0.03
GGA3-218ENST00000584243 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.25■□□□□ 0.03
GGA3-218ENST00000584243 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
GGA3-218ENST00000584243 TOPBP1Q92547 1522 aa15.23■□□□□ 0.03
GGA3-218ENST00000584243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.16■□□□□ 0.02
GGA3-218ENST00000584243 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.16■□□□□ 0.02
GGA3-218ENST00000584243 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.15■□□□□ 0.02
GGA3-218ENST00000584243 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.11■□□□□ 0.01
GGA3-218ENST00000584243 DIP2BQ9P265 1576 aa15.11■□□□□ 0.01
GGA3-218ENST00000584243 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
GGA3-218ENST00000584243 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
GGA3-218ENST00000584243 WIZO95785 1651 aa15.05■□□□□ -0
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GGA3-218ENST00000584243 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-218ENST00000584243 PRDM2Q13029 1718 aa15□□□□□ -0.01
GGA3-218ENST00000584243 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
GGA3-218ENST00000584243 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15□□□□□ -0.01
GGA3-218ENST00000584243 TSPOAP1O95153 1857 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-218ENST00000584243 MAPKBP1O60336 1514 aa14.97□□□□□ -0.01
GGA3-218ENST00000584243 ABCC8Q09428 1581 aa14.96□□□□□ -0.01
GGA3-218ENST00000584243 CEP170Q5SW79 1584 aa14.96□□□□□ -0.01
GGA3-218ENST00000584243 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GGA3-218ENST00000584243 CERKQ8TCT0 537 aa14.89□□□□□ -0.03
GGA3-218ENST00000584243 GRIN2BQ13224 1484 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-218ENST00000584243 SHROOM2Q13796 1616 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-218ENST00000584243 WDR97A6NE52 1622 aa14.85□□□□□ -0.03
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