RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581366.5

TMEM220-AS1-203, TMEM220 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TMEM220-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.73■■■■■ 4.43
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.78■■■■□ 3.64
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 ABCC9O60706 1549 aa36.51■■■■□ 3.44
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.54■■■■□ 3.28
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 NACADO15069 1562 aa35.38■■■■□ 3.25
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.35■■■■□ 3.25
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.32■■■■□ 3.24
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.3■■■■□ 3.24
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.58■■■■□ 3.13
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 SCRIBQ14160 1630 aa34.56■■■■□ 3.12
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.23■■■■□ 3.07
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.12■■■■□ 3.05
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.25■■■□□ 2.91
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 SMARCA4P51532 1647 aa33.08■■■□□ 2.89
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.04■■■□□ 2.88
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.01■■■□□ 2.87
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.96■■■□□ 2.87
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.74■■■□□ 2.83
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 SMARCA2P51531 1590 aa32.73■■■□□ 2.83
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.71■■■□□ 2.83
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 WIZO95785 1651 aa32.66■■■□□ 2.82
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 NCAPD3P42695 1498 aa32.62■■■□□ 2.81
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 HMGXB3Q12766 1538 aa32.53■■■□□ 2.8
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.93■■■□□ 2.7
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 NESP48681 1621 aa31.75■■■□□ 2.67
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.72■■■□□ 2.67
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.71■■■□□ 2.67
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CFTRP13569 1480 aa31.63■■■□□ 2.65
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 PRDM2Q13029 1718 aa31.5■■■□□ 2.63
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.47■■■□□ 2.63
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 ERCC6Q03468 1493 aa31.42■■■□□ 2.62
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.41■■■□□ 2.62
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.37■■■□□ 2.61
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.29■■■□□ 2.6
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.13■■■□□ 2.57
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 WDR62O43379 1518 aa31.01■■■□□ 2.55
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 ABCC8Q09428 1581 aa30.96■■■□□ 2.55
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.94■■■□□ 2.54
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 TOPBP1Q92547 1522 aa30.93■■■□□ 2.54
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CUX1P39880 1505 aa30.89■■■□□ 2.54
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CUX2O14529 1486 aa30.87■■■□□ 2.53
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 SYNJ1O43426 1573 aa30.79■■■□□ 2.52
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 TOP2BQ02880 1626 aa30.76■■■□□ 2.52
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.76■■■□□ 2.52
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.71■■■□□ 2.51
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TMEM220-AS1-203ENST00000581366 IFT140Q96RY7 1462 aa30.6■■■□□ 2.49
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 SOGA1O94964 1423 aa30.58■■■□□ 2.49
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.57■■■□□ 2.48
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 TRIM41Q8WV44 630 aa30.49■■■□□ 2.47
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 WDR97A6NE52 1622 aa30.46■■■□□ 2.47
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TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.44■■■□□ 2.46
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.42■■■□□ 2.46
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.28■■■□□ 2.44
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.24■■■□□ 2.43
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 PBRM1Q86U86 1689 aa30.2■■■□□ 2.42
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 KIF27Q86VH2 1401 aa30.18■■■□□ 2.42
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 GRIN2BQ13224 1484 aa30.16■■■□□ 2.42
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.1■■■□□ 2.41
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.07■■■□□ 2.4
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.06■■■□□ 2.4
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 IGF1RP08069 1367 aa29.98■■■□□ 2.39
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 ADAMTS12P58397 1594 aa29.95■■■□□ 2.39
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 EEA1Q15075 1411 aa29.93■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CUL7Q14999 1698 aa29.91■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CHD1O14646 1710 aa29.91■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.9■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 SYNJ2O15056 1496 aa29.9■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 FBLN2P98095 1184 aa29.88■■■□□ 2.37
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.83■■■□□ 2.37
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.82■■■□□ 2.36
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 GRIN2AQ12879 1464 aa29.78■■■□□ 2.36
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 PRXQ9BXM0 1461 aa29.72■■■□□ 2.35
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.72■■■□□ 2.35
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 OSCARQ8IYS5 282 aa29.68■■■□□ 2.34
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CEP170Q5SW79 1584 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 KIF21BO75037 1637 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 NUP160Q12769 1436 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.54■■■□□ 2.32
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.5■■■□□ 2.31
TMEM220-AS1-203ENST00000581366 GOLGA3Q08378 1498 aa29.48■■■□□ 2.31
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