RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580667.5

PLXDC1-218, Transcript of plexin domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene PLXDC1, Length 565 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1-218ENST00000580667 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.78■■■■□ 3.32
PLXDC1-218ENST00000580667 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.78■■■□□ 2.68
PLXDC1-218ENST00000580667 ABCC9O60706 1549 aa30.63■■■□□ 2.49
PLXDC1-218ENST00000580667 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
PLXDC1-218ENST00000580667 NACADO15069 1562 aa29.69■■■□□ 2.34
PLXDC1-218ENST00000580667 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.65■■■□□ 2.34
PLXDC1-218ENST00000580667 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.64■■■□□ 2.34
PLXDC1-218ENST00000580667 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.62■■■□□ 2.33
PLXDC1-218ENST00000580667 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.54■■■□□ 2.32
PLXDC1-218ENST00000580667 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.23■■■□□ 2.27
PLXDC1-218ENST00000580667 SCRIBQ14160 1630 aa28.97■■■□□ 2.23
PLXDC1-218ENST00000580667 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.82■■■□□ 2.2
PLXDC1-218ENST00000580667 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
PLXDC1-218ENST00000580667 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.46■■■□□ 2.15
PLXDC1-218ENST00000580667 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PLXDC1-218ENST00000580667 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.83■■■□□ 2.05
PLXDC1-218ENST00000580667 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.81■■■□□ 2.04
PLXDC1-218ENST00000580667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.76■■■□□ 2.03
PLXDC1-218ENST00000580667 SMARCA4P51532 1647 aa27.76■■■□□ 2.03
PLXDC1-218ENST00000580667 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
PLXDC1-218ENST00000580667 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.6■■■□□ 2.01
PLXDC1-218ENST00000580667 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.48■■□□□ 1.99
PLXDC1-218ENST00000580667 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.44■■□□□ 1.98
PLXDC1-218ENST00000580667 SMARCA2P51531 1590 aa27.43■■□□□ 1.98
PLXDC1-218ENST00000580667 WIZO95785 1651 aa27.38■■□□□ 1.97
PLXDC1-218ENST00000580667 NCAPD3P42695 1498 aa27.35■■□□□ 1.97
PLXDC1-218ENST00000580667 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PLXDC1-218ENST00000580667 HMGXB3Q12766 1538 aa27.32■■□□□ 1.96
PLXDC1-218ENST00000580667 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PLXDC1-218ENST00000580667 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PLXDC1-218ENST00000580667 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PLXDC1-218ENST00000580667 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.68■■□□□ 1.86
PLXDC1-218ENST00000580667 NESP48681 1621 aa26.64■■□□□ 1.85
PLXDC1-218ENST00000580667 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.63■■□□□ 1.85
PLXDC1-218ENST00000580667 PRDM2Q13029 1718 aa26.58■■□□□ 1.85
PLXDC1-218ENST00000580667 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.53■■□□□ 1.84
PLXDC1-218ENST00000580667 CFTRP13569 1480 aa26.49■■□□□ 1.83
PLXDC1-218ENST00000580667 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.47■■□□□ 1.83
PLXDC1-218ENST00000580667 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.33■■□□□ 1.81
PLXDC1-218ENST00000580667 ERCC6Q03468 1493 aa26.32■■□□□ 1.8
PLXDC1-218ENST00000580667 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.28■■□□□ 1.8
PLXDC1-218ENST00000580667 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PLXDC1-218ENST00000580667 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.22■■□□□ 1.79
PLXDC1-218ENST00000580667 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.11■■□□□ 1.77
PLXDC1-218ENST00000580667 WDR62O43379 1518 aa26.08■■□□□ 1.77
PLXDC1-218ENST00000580667 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PLXDC1-218ENST00000580667 CUX2O14529 1486 aa25.97■■□□□ 1.75
PLXDC1-218ENST00000580667 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.95■■□□□ 1.75
PLXDC1-218ENST00000580667 TOPBP1Q92547 1522 aa25.93■■□□□ 1.74
PLXDC1-218ENST00000580667 CUX1P39880 1505 aa25.88■■□□□ 1.73
PLXDC1-218ENST00000580667 ABCC8Q09428 1581 aa25.88■■□□□ 1.73
PLXDC1-218ENST00000580667 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.81■■□□□ 1.72
PLXDC1-218ENST00000580667 SYNJ1O43426 1573 aa25.79■■□□□ 1.72
PLXDC1-218ENST00000580667 TOP2BQ02880 1626 aa25.77■■□□□ 1.72
PLXDC1-218ENST00000580667 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
PLXDC1-218ENST00000580667 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PLXDC1-218ENST00000580667 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.71■■□□□ 1.71
PLXDC1-218ENST00000580667 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PLXDC1-218ENST00000580667 WDR97A6NE52 1622 aa25.65■■□□□ 1.7
PLXDC1-218ENST00000580667 IFT140Q96RY7 1462 aa25.63■■□□□ 1.69
PLXDC1-218ENST00000580667 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.59■■□□□ 1.69
PLXDC1-218ENST00000580667 SOGA1O94964 1423 aa25.54■■□□□ 1.68
PLXDC1-218ENST00000580667 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PLXDC1-218ENST00000580667 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PLXDC1-218ENST00000580667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.47■■□□□ 1.67
PLXDC1-218ENST00000580667 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.44■■□□□ 1.66
PLXDC1-218ENST00000580667 PBRM1Q86U86 1689 aa25.41■■□□□ 1.66
PLXDC1-218ENST00000580667 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
PLXDC1-218ENST00000580667 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PLXDC1-218ENST00000580667 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.29■■□□□ 1.64
PLXDC1-218ENST00000580667 TRIM41Q8WV44 630 aa25.26■■□□□ 1.63
PLXDC1-218ENST00000580667 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.24■■□□□ 1.63
PLXDC1-218ENST00000580667 GRIN2BQ13224 1484 aa25.23■■□□□ 1.63
PLXDC1-218ENST00000580667 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.23■■□□□ 1.63
PLXDC1-218ENST00000580667 CHD1O14646 1710 aa25.21■■□□□ 1.63
PLXDC1-218ENST00000580667 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.2■■□□□ 1.62
PLXDC1-218ENST00000580667 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.18■■□□□ 1.62
PLXDC1-218ENST00000580667 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PLXDC1-218ENST00000580667 KIF27Q86VH2 1401 aa25.16■■□□□ 1.62
PLXDC1-218ENST00000580667 ADAMTS12P58397 1594 aa25.15■■□□□ 1.62
PLXDC1-218ENST00000580667 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.12■■□□□ 1.61
PLXDC1-218ENST00000580667 CUL7Q14999 1698 aa25.08■■□□□ 1.61
PLXDC1-218ENST00000580667 SYNJ2O15056 1496 aa25.05■■□□□ 1.6
PLXDC1-218ENST00000580667 IGF1RP08069 1367 aa25.02■■□□□ 1.6
PLXDC1-218ENST00000580667 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25■■□□□ 1.59
PLXDC1-218ENST00000580667 GRIN2AQ12879 1464 aa24.96■■□□□ 1.59
PLXDC1-218ENST00000580667 EEA1Q15075 1411 aa24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1-218ENST00000580667 FBLN2P98095 1184 aa24.89■■□□□ 1.58
PLXDC1-218ENST00000580667 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PLXDC1-218ENST00000580667 CEP170Q5SW79 1584 aa24.88■■□□□ 1.57
PLXDC1-218ENST00000580667 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.87■■□□□ 1.57
PLXDC1-218ENST00000580667 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1-218ENST00000580667 NUP160Q12769 1436 aa24.83■■□□□ 1.57
PLXDC1-218ENST00000580667 PRXQ9BXM0 1461 aa24.83■■□□□ 1.56
PLXDC1-218ENST00000580667 OSCARQ8IYS5 282 aa24.82■■□□□ 1.56
PLXDC1-218ENST00000580667 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.8■■□□□ 1.56
PLXDC1-218ENST00000580667 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.76■■□□□ 1.55
PLXDC1-218ENST00000580667 KIF21BO75037 1637 aa24.75■■□□□ 1.55
PLXDC1-218ENST00000580667 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PLXDC1-218ENST00000580667 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms