RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579578.6

PNLIPRP2-201, Transcript of pancreatic lipase related protein 2 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene PNLIPRP2, Length 1,482 nt, Biotype polymorphic pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLIPRP2-201ENST00000579578 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.39■■■□□ 2.29
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.67■■□□□ 1.7
PNLIPRP2-201ENST00000579578 NACADO15069 1562 aa25.39■■□□□ 1.65
PNLIPRP2-201ENST00000579578 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.94■■□□□ 1.58
PNLIPRP2-201ENST00000579578 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.93■■□□□ 1.58
PNLIPRP2-201ENST00000579578 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.92■■□□□ 1.58
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.61■■□□□ 1.53
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.54■■□□□ 1.52
PNLIPRP2-201ENST00000579578 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.52■■□□□ 1.52
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PNLIPRP2-201ENST00000579578 SCRIBQ14160 1630 aa24.11■■□□□ 1.45
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CUX2O14529 1486 aa23.81■■□□□ 1.4
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 NCAPD3P42695 1498 aa23.48■■□□□ 1.35
PNLIPRP2-201ENST00000579578 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.25■■□□□ 1.31
PNLIPRP2-201ENST00000579578 HMGXB3Q12766 1538 aa23.21■■□□□ 1.31
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PNLIPRP2-201ENST00000579578 SMARCA4P51532 1647 aa23.01■■□□□ 1.27
PNLIPRP2-201ENST00000579578 TRIM41Q8WV44 630 aa23.01■■□□□ 1.27
PNLIPRP2-201ENST00000579578 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.99■■□□□ 1.27
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
PNLIPRP2-201ENST00000579578 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.9■■□□□ 1.26
PNLIPRP2-201ENST00000579578 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PNLIPRP2-201ENST00000579578 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.79■■□□□ 1.24
PNLIPRP2-201ENST00000579578 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.71■■□□□ 1.23
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.7■■□□□ 1.22
PNLIPRP2-201ENST00000579578 WDR62O43379 1518 aa22.69■■□□□ 1.22
PNLIPRP2-201ENST00000579578 OSCARQ8IYS5 282 aa22.6■■□□□ 1.21
PNLIPRP2-201ENST00000579578 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.58■■□□□ 1.21
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.47■■□□□ 1.19
PNLIPRP2-201ENST00000579578 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.39■■□□□ 1.17
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CFTRP13569 1480 aa22.31■■□□□ 1.16
PNLIPRP2-201ENST00000579578 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.27■■□□□ 1.16
PNLIPRP2-201ENST00000579578 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.27■■□□□ 1.16
PNLIPRP2-201ENST00000579578 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.27■■□□□ 1.16
PNLIPRP2-201ENST00000579578 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PNLIPRP2-201ENST00000579578 WIZO95785 1651 aa22.21■■□□□ 1.15
PNLIPRP2-201ENST00000579578 ARHGEF11O15085 1522 aa22.18■■□□□ 1.14
PNLIPRP2-201ENST00000579578 IFT140Q96RY7 1462 aa22.09■■□□□ 1.13
PNLIPRP2-201ENST00000579578 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.03■■□□□ 1.12
PNLIPRP2-201ENST00000579578 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PNLIPRP2-201ENST00000579578 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 ARAP1Q96P48 1450 aa21.92■■□□□ 1.1
PNLIPRP2-201ENST00000579578 ABCC8Q09428 1581 aa21.9■■□□□ 1.1
PNLIPRP2-201ENST00000579578 TOPBP1Q92547 1522 aa21.89■■□□□ 1.09
PNLIPRP2-201ENST00000579578 PRDM2Q13029 1718 aa21.89■■□□□ 1.09
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PNLIPRP2-201ENST00000579578 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.07
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CHD1O14646 1710 aa21.76■■□□□ 1.07
PNLIPRP2-201ENST00000579578 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.76■■□□□ 1.07
PNLIPRP2-201ENST00000579578 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.74■■□□□ 1.07
PNLIPRP2-201ENST00000579578 FBLN2P98095 1184 aa21.7■■□□□ 1.06
PNLIPRP2-201ENST00000579578 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.62■■□□□ 1.05
PNLIPRP2-201ENST00000579578 WDR97A6NE52 1622 aa21.57■■□□□ 1.04
PNLIPRP2-201ENST00000579578 SYNJ1O43426 1573 aa21.54■■□□□ 1.04
PNLIPRP2-201ENST00000579578 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PNLIPRP2-201ENST00000579578 SOGA1O94964 1423 aa21.53■■□□□ 1.04
PNLIPRP2-201ENST00000579578 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.52■■□□□ 1.04
PNLIPRP2-201ENST00000579578 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PNLIPRP2-201ENST00000579578 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 SHROOM2Q13796 1616 aa21.07■□□□□ 0.96
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 ADAMTS12P58397 1594 aa21.01■□□□□ 0.95
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.99■□□□□ 0.95
PNLIPRP2-201ENST00000579578 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.95■□□□□ 0.94
PNLIPRP2-201ENST00000579578 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.95■□□□□ 0.94
PNLIPRP2-201ENST00000579578 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
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PNLIPRP2-201ENST00000579578 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
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