RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578431.1

EPB41L3-210, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3, humanhuman

TSL 2

Gene EPB41L3, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3-210ENST00000578431 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.47■■■■■ 8.71
EPB41L3-210ENST00000578431 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.74■■■■■ 7.47
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCC9O60706 1549 aa59.8■■■■■ 7.16
EPB41L3-210ENST00000578431 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.99■■■■■ 6.87
EPB41L3-210ENST00000578431 NACADO15069 1562 aa57.89■■■■■ 6.86
EPB41L3-210ENST00000578431 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.84■■■■■ 6.85
EPB41L3-210ENST00000578431 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.75■■■■■ 6.83
EPB41L3-210ENST00000578431 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.61■■■■■ 6.81
EPB41L3-210ENST00000578431 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.54■■■■■ 6.8
EPB41L3-210ENST00000578431 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.57■■■■■ 6.65
EPB41L3-210ENST00000578431 SCRIBQ14160 1630 aa56.19■■■■■ 6.59
EPB41L3-210ENST00000578431 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.08■■■■■ 6.57
EPB41L3-210ENST00000578431 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.82■■■■■ 6.53
EPB41L3-210ENST00000578431 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.66■■■■■ 6.5
EPB41L3-210ENST00000578431 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.55■■■■■ 6.32
EPB41L3-210ENST00000578431 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.47■■■■■ 6.31
EPB41L3-210ENST00000578431 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.21■■■■■ 6.27
EPB41L3-210ENST00000578431 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.98■■■■■ 6.23
EPB41L3-210ENST00000578431 SMARCA4P51532 1647 aa53.86■■■■■ 6.21
EPB41L3-210ENST00000578431 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.85■■■■■ 6.21
EPB41L3-210ENST00000578431 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.49■■■■■ 6.15
EPB41L3-210ENST00000578431 SMARCA2P51531 1590 aa53.44■■■■■ 6.14
EPB41L3-210ENST00000578431 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.42■■■■■ 6.14
EPB41L3-210ENST00000578431 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.4■■■■■ 6.14
EPB41L3-210ENST00000578431 NCAPD3P42695 1498 aa53.37■■■■■ 6.13
EPB41L3-210ENST00000578431 HMGXB3Q12766 1538 aa53.22■■■■■ 6.11
EPB41L3-210ENST00000578431 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53■■■■■ 6.08
EPB41L3-210ENST00000578431 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53■■■■■ 6.07
EPB41L3-210ENST00000578431 WIZO95785 1651 aa52.95■■■■■ 6.07
EPB41L3-210ENST00000578431 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.47■■■■■ 5.99
EPB41L3-210ENST00000578431 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.96■■■■■ 5.91
EPB41L3-210ENST00000578431 NESP48681 1621 aa51.87■■■■■ 5.89
EPB41L3-210ENST00000578431 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.77■■■■■ 5.88
EPB41L3-210ENST00000578431 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.76■■■■■ 5.88
EPB41L3-210ENST00000578431 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.7■■■■■ 5.87
EPB41L3-210ENST00000578431 CFTRP13569 1480 aa51.6■■■■■ 5.85
EPB41L3-210ENST00000578431 ERCC6Q03468 1493 aa51.54■■■■■ 5.84
EPB41L3-210ENST00000578431 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.5■■■■■ 5.84
EPB41L3-210ENST00000578431 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.38■■■■■ 5.82
EPB41L3-210ENST00000578431 PRDM2Q13029 1718 aa51.38■■■■■ 5.82
EPB41L3-210ENST00000578431 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.19■■■■■ 5.79
EPB41L3-210ENST00000578431 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.17■■■■■ 5.78
EPB41L3-210ENST00000578431 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.12■■■■■ 5.77
EPB41L3-210ENST00000578431 CUX2O14529 1486 aa50.99■■■■■ 5.75
EPB41L3-210ENST00000578431 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.97■■■■■ 5.75
EPB41L3-210ENST00000578431 WDR62O43379 1518 aa50.86■■■■■ 5.73
EPB41L3-210ENST00000578431 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.67■■■■■ 5.7
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCC8Q09428 1581 aa50.51■■■■■ 5.68
EPB41L3-210ENST00000578431 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.46■■■■■ 5.67
EPB41L3-210ENST00000578431 TOPBP1Q92547 1522 aa50.43■■■■■ 5.66
EPB41L3-210ENST00000578431 CUX1P39880 1505 aa50.18■■■■■ 5.62
EPB41L3-210ENST00000578431 IFT140Q96RY7 1462 aa50.04■■■■■ 5.6
EPB41L3-210ENST00000578431 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.03■■■■■ 5.6
EPB41L3-210ENST00000578431 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.97■■■■■ 5.59
EPB41L3-210ENST00000578431 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.95■■■■■ 5.59
EPB41L3-210ENST00000578431 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.94■■■■■ 5.59
EPB41L3-210ENST00000578431 TOP2BQ02880 1626 aa49.91■■■■■ 5.58
EPB41L3-210ENST00000578431 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.91■■■■■ 5.58
EPB41L3-210ENST00000578431 SYNJ1O43426 1573 aa49.87■■■■■ 5.57
EPB41L3-210ENST00000578431 SOGA1O94964 1423 aa49.76■■■■■ 5.56
EPB41L3-210ENST00000578431 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.72■■■■■ 5.55
EPB41L3-210ENST00000578431 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.71■■■■■ 5.55
EPB41L3-210ENST00000578431 WDR97A6NE52 1622 aa49.66■■■■■ 5.54
EPB41L3-210ENST00000578431 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.64■■■■■ 5.54
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.53■■■■■ 5.52
EPB41L3-210ENST00000578431 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.44■■■■■ 5.5
EPB41L3-210ENST00000578431 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
EPB41L3-210ENST00000578431 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.35■■■■■ 5.49
EPB41L3-210ENST00000578431 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.24■■■■■ 5.47
EPB41L3-210ENST00000578431 PBRM1Q86U86 1689 aa49.21■■■■■ 5.47
EPB41L3-210ENST00000578431 GRIN2BQ13224 1484 aa49.2■■■■■ 5.47
EPB41L3-210ENST00000578431 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.08■■■■■ 5.45
EPB41L3-210ENST00000578431 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.06■■■■■ 5.44
EPB41L3-210ENST00000578431 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.97■■■■■ 5.43
EPB41L3-210ENST00000578431 CHD1O14646 1710 aa48.94■■■■■ 5.42
EPB41L3-210ENST00000578431 KIF27Q86VH2 1401 aa48.9■■■■■ 5.42
EPB41L3-210ENST00000578431 TRIM41Q8WV44 630 aa48.89■■■■■ 5.42
EPB41L3-210ENST00000578431 SYNJ2O15056 1496 aa48.86■■■■■ 5.41
EPB41L3-210ENST00000578431 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.84■■■■■ 5.41
EPB41L3-210ENST00000578431 ADAMTS12P58397 1594 aa48.83■■■■■ 5.41
EPB41L3-210ENST00000578431 OSCARQ8IYS5 282 aa48.76■■■■■ 5.4
EPB41L3-210ENST00000578431 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.7■■■■■ 5.39
EPB41L3-210ENST00000578431 FBLN2P98095 1184 aa48.65■■■■■ 5.38
EPB41L3-210ENST00000578431 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.65■■■■■ 5.38
EPB41L3-210ENST00000578431 CUL7Q14999 1698 aa48.63■■■■■ 5.37
EPB41L3-210ENST00000578431 IGF1RP08069 1367 aa48.61■■■■■ 5.37
EPB41L3-210ENST00000578431 GRIN2AQ12879 1464 aa48.59■■■■■ 5.37
EPB41L3-210ENST00000578431 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.55■■■■■ 5.36
EPB41L3-210ENST00000578431 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.49■■■■■ 5.35
EPB41L3-210ENST00000578431 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.44■■■■■ 5.35
EPB41L3-210ENST00000578431 NUP160Q12769 1436 aa48.38■■■■■ 5.34
EPB41L3-210ENST00000578431 CEP170Q5SW79 1584 aa48.34■■■■■ 5.33
EPB41L3-210ENST00000578431 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.32■■■■■ 5.33
EPB41L3-210ENST00000578431 EEA1Q15075 1411 aa48.27■■■■■ 5.32
EPB41L3-210ENST00000578431 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.14■■■■■ 5.3
EPB41L3-210ENST00000578431 ARHGEF11O15085 1522 aa48.1■■■■■ 5.29
EPB41L3-210ENST00000578431 PRXQ9BXM0 1461 aa48.1■■■■■ 5.29
EPB41L3-210ENST00000578431 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.07■■■■■ 5.29
EPB41L3-210ENST00000578431 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.07■■■■■ 5.29
EPB41L3-210ENST00000578431 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.07■■■■■ 5.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms