RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577297.5

USP2-AS1-204, Transcript of USP2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP2-AS1, Length 689 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2-AS1-204ENST00000577297 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.6■■□□□ 1.69
USP2-AS1-204ENST00000577297 ABCC9O60706 1549 aa23.76■■□□□ 1.39
USP2-AS1-204ENST00000577297 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.18■■□□□ 1.3
USP2-AS1-204ENST00000577297 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.95■■□□□ 1.26
USP2-AS1-204ENST00000577297 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.33■■□□□ 1.16
USP2-AS1-204ENST00000577297 NACADO15069 1562 aa22.07■■□□□ 1.12
USP2-AS1-204ENST00000577297 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
USP2-AS1-204ENST00000577297 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.86■■□□□ 1.09
USP2-AS1-204ENST00000577297 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.82■■□□□ 1.08
USP2-AS1-204ENST00000577297 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.71■■□□□ 1.07
USP2-AS1-204ENST00000577297 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.62■■□□□ 1.05
USP2-AS1-204ENST00000577297 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.47■■□□□ 1.03
USP2-AS1-204ENST00000577297 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.45■■□□□ 1.02
USP2-AS1-204ENST00000577297 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.43■■□□□ 1.02
USP2-AS1-204ENST00000577297 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.39■■□□□ 1.01
USP2-AS1-204ENST00000577297 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
USP2-AS1-204ENST00000577297 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.13■□□□□ 0.97
USP2-AS1-204ENST00000577297 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP2-AS1-204ENST00000577297 SCRIBQ14160 1630 aa21.07■□□□□ 0.96
USP2-AS1-204ENST00000577297 CUX2O14529 1486 aa20.72■□□□□ 0.91
USP2-AS1-204ENST00000577297 ERCC6Q03468 1493 aa20.48■□□□□ 0.87
USP2-AS1-204ENST00000577297 NCAPD3P42695 1498 aa20.43■□□□□ 0.86
USP2-AS1-204ENST00000577297 NESP48681 1621 aa20.29■□□□□ 0.84
USP2-AS1-204ENST00000577297 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.27■□□□□ 0.84
USP2-AS1-204ENST00000577297 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP2-AS1-204ENST00000577297 HMGXB3Q12766 1538 aa20.18■□□□□ 0.82
USP2-AS1-204ENST00000577297 TRIM41Q8WV44 630 aa20.12■□□□□ 0.81
USP2-AS1-204ENST00000577297 SMARCA2P51531 1590 aa20.12■□□□□ 0.81
USP2-AS1-204ENST00000577297 SMARCA4P51532 1647 aa20.07■□□□□ 0.8
USP2-AS1-204ENST00000577297 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.99■□□□□ 0.79
USP2-AS1-204ENST00000577297 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
USP2-AS1-204ENST00000577297 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.95■□□□□ 0.78
USP2-AS1-204ENST00000577297 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.93■□□□□ 0.78
USP2-AS1-204ENST00000577297 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.88■□□□□ 0.77
USP2-AS1-204ENST00000577297 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
USP2-AS1-204ENST00000577297 WDR62O43379 1518 aa19.78■□□□□ 0.76
USP2-AS1-204ENST00000577297 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.77■□□□□ 0.76
USP2-AS1-204ENST00000577297 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.74■□□□□ 0.75
USP2-AS1-204ENST00000577297 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.74■□□□□ 0.75
USP2-AS1-204ENST00000577297 OSCARQ8IYS5 282 aa19.65■□□□□ 0.74
USP2-AS1-204ENST00000577297 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.54■□□□□ 0.72
USP2-AS1-204ENST00000577297 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.5■□□□□ 0.71
USP2-AS1-204ENST00000577297 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.49■□□□□ 0.71
USP2-AS1-204ENST00000577297 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.49■□□□□ 0.71
USP2-AS1-204ENST00000577297 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.49■□□□□ 0.71
USP2-AS1-204ENST00000577297 WIZO95785 1651 aa19.43■□□□□ 0.7
USP2-AS1-204ENST00000577297 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
USP2-AS1-204ENST00000577297 CFTRP13569 1480 aa19.42■□□□□ 0.7
USP2-AS1-204ENST00000577297 ARHGEF11O15085 1522 aa19.37■□□□□ 0.69
USP2-AS1-204ENST00000577297 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
USP2-AS1-204ENST00000577297 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.23■□□□□ 0.67
USP2-AS1-204ENST00000577297 IFT140Q96RY7 1462 aa19.21■□□□□ 0.67
USP2-AS1-204ENST00000577297 ARAP1Q96P48 1450 aa19.17■□□□□ 0.66
USP2-AS1-204ENST00000577297 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
USP2-AS1-204ENST00000577297 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
USP2-AS1-204ENST00000577297 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
USP2-AS1-204ENST00000577297 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP2-AS1-204ENST00000577297 TOPBP1Q92547 1522 aa19.09■□□□□ 0.65
USP2-AS1-204ENST00000577297 PRDM2Q13029 1718 aa19.08■□□□□ 0.65
USP2-AS1-204ENST00000577297 CHD1O14646 1710 aa19.05■□□□□ 0.64
USP2-AS1-204ENST00000577297 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.02■□□□□ 0.63
USP2-AS1-204ENST00000577297 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
USP2-AS1-204ENST00000577297 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.96■□□□□ 0.63
USP2-AS1-204ENST00000577297 ABCC8Q09428 1581 aa18.95■□□□□ 0.62
USP2-AS1-204ENST00000577297 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
USP2-AS1-204ENST00000577297 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.93■□□□□ 0.62
USP2-AS1-204ENST00000577297 FBLN2P98095 1184 aa18.89■□□□□ 0.61
USP2-AS1-204ENST00000577297 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.89■□□□□ 0.61
USP2-AS1-204ENST00000577297 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
USP2-AS1-204ENST00000577297 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.8■□□□□ 0.6
USP2-AS1-204ENST00000577297 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
USP2-AS1-204ENST00000577297 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.77■□□□□ 0.6
USP2-AS1-204ENST00000577297 SOGA1O94964 1423 aa18.73■□□□□ 0.59
USP2-AS1-204ENST00000577297 SYNJ1O43426 1573 aa18.72■□□□□ 0.59
USP2-AS1-204ENST00000577297 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
USP2-AS1-204ENST00000577297 WDR97A6NE52 1622 aa18.69■□□□□ 0.58
USP2-AS1-204ENST00000577297 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
USP2-AS1-204ENST00000577297 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.68■□□□□ 0.58
USP2-AS1-204ENST00000577297 SYNJ2O15056 1496 aa18.65■□□□□ 0.58
USP2-AS1-204ENST00000577297 GRIN2BQ13224 1484 aa18.64■□□□□ 0.57
USP2-AS1-204ENST00000577297 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.64■□□□□ 0.57
USP2-AS1-204ENST00000577297 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.57■□□□□ 0.56
USP2-AS1-204ENST00000577297 CUX1P39880 1505 aa18.57■□□□□ 0.56
USP2-AS1-204ENST00000577297 PBRM1Q86U86 1689 aa18.49■□□□□ 0.55
USP2-AS1-204ENST00000577297 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.45■□□□□ 0.54
USP2-AS1-204ENST00000577297 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.44■□□□□ 0.54
USP2-AS1-204ENST00000577297 CEP170Q5SW79 1584 aa18.43■□□□□ 0.54
USP2-AS1-204ENST00000577297 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.42■□□□□ 0.54
USP2-AS1-204ENST00000577297 NUP160Q12769 1436 aa18.41■□□□□ 0.54
USP2-AS1-204ENST00000577297 GRIN2AQ12879 1464 aa18.41■□□□□ 0.54
USP2-AS1-204ENST00000577297 SHROOM2Q13796 1616 aa18.39■□□□□ 0.53
USP2-AS1-204ENST00000577297 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa18.34■□□□□ 0.53
USP2-AS1-204ENST00000577297 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
USP2-AS1-204ENST00000577297 ADAMTS12P58397 1594 aa18.33■□□□□ 0.52
USP2-AS1-204ENST00000577297 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.28■□□□□ 0.52
USP2-AS1-204ENST00000577297 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.24■□□□□ 0.51
USP2-AS1-204ENST00000577297 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.23■□□□□ 0.51
USP2-AS1-204ENST00000577297 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP2-AS1-204ENST00000577297 MAPKBP1O60336 1514 aa18.22■□□□□ 0.51
USP2-AS1-204ENST00000577297 DIP2BQ9P265 1576 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms