RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.49■■■■■ 8.55
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.81■■■■■ 7.32
NOMO3-217ENST00000576589 ABCC9O60706 1549 aa60.59■■■■■ 7.29
NOMO3-217ENST00000576589 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.6■■■■■ 6.81
NOMO3-217ENST00000576589 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.46■■■■■ 6.79
NOMO3-217ENST00000576589 NACADO15069 1562 aa57.3■■■■■ 6.76
NOMO3-217ENST00000576589 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.02■■■■■ 6.72
NOMO3-217ENST00000576589 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.97■■■■■ 6.71
NOMO3-217ENST00000576589 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.9■■■■■ 6.7
NOMO3-217ENST00000576589 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.62■■■■■ 6.65
NOMO3-217ENST00000576589 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.47■■■■■ 6.63
NOMO3-217ENST00000576589 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.2■■■■■ 6.59
NOMO3-217ENST00000576589 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.92■■■■■ 6.54
NOMO3-217ENST00000576589 SCRIBQ14160 1630 aa55.58■■■■■ 6.49
NOMO3-217ENST00000576589 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.16■■■■■ 6.42
NOMO3-217ENST00000576589 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.69■■■■■ 6.35
NOMO3-217ENST00000576589 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.59■■■■■ 6.33
NOMO3-217ENST00000576589 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.56■■■■■ 6.32
NOMO3-217ENST00000576589 SMARCA4P51532 1647 aa53.13■■■■■ 6.1
NOMO3-217ENST00000576589 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.07■■■■■ 6.09
NOMO3-217ENST00000576589 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.94■■■■■ 6.06
NOMO3-217ENST00000576589 NCAPD3P42695 1498 aa52.93■■■■■ 6.06
NOMO3-217ENST00000576589 SMARCA2P51531 1590 aa52.83■■■■■ 6.05
NOMO3-217ENST00000576589 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.8■■■■■ 6.04
NOMO3-217ENST00000576589 HMGXB3Q12766 1538 aa52.59■■■■■ 6.01
NOMO3-217ENST00000576589 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.59■■■■■ 6.01
NOMO3-217ENST00000576589 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.5■■■■■ 5.99
NOMO3-217ENST00000576589 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.36■■■■■ 5.97
NOMO3-217ENST00000576589 ERCC6Q03468 1493 aa52.31■■■■■ 5.97
NOMO3-217ENST00000576589 CUX2O14529 1486 aa52.24■■■■■ 5.95
NOMO3-217ENST00000576589 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.19■■■■■ 5.95
NOMO3-217ENST00000576589 WIZO95785 1651 aa52.16■■■■■ 5.94
NOMO3-217ENST00000576589 NESP48681 1621 aa52.02■■■■■ 5.92
NOMO3-217ENST00000576589 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.63■■■■■ 5.86
NOMO3-217ENST00000576589 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.62■■■■■ 5.85
NOMO3-217ENST00000576589 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.45■■■■■ 5.83
NOMO3-217ENST00000576589 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.42■■■■■ 5.82
NOMO3-217ENST00000576589 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.38■■■■■ 5.82
NOMO3-217ENST00000576589 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.27■■■■■ 5.8
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.08■■■■■ 5.77
NOMO3-217ENST00000576589 CFTRP13569 1480 aa51.04■■■■■ 5.76
NOMO3-217ENST00000576589 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.91■■■■■ 5.74
NOMO3-217ENST00000576589 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.89■■■■■ 5.74
NOMO3-217ENST00000576589 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.79■■■■■ 5.72
NOMO3-217ENST00000576589 WDR62O43379 1518 aa50.76■■■■■ 5.72
NOMO3-217ENST00000576589 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.73■■■■■ 5.71
NOMO3-217ENST00000576589 PRDM2Q13029 1718 aa50.42■■■■■ 5.66
NOMO3-217ENST00000576589 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
NOMO3-217ENST00000576589 TRIM41Q8WV44 630 aa50.04■■■■■ 5.6
NOMO3-217ENST00000576589 TOPBP1Q92547 1522 aa49.95■■■■■ 5.59
NOMO3-217ENST00000576589 ABCC8Q09428 1581 aa49.94■■■■■ 5.59
NOMO3-217ENST00000576589 OSCARQ8IYS5 282 aa49.93■■■■■ 5.58
NOMO3-217ENST00000576589 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.85■■■■■ 5.57
NOMO3-217ENST00000576589 IFT140Q96RY7 1462 aa49.7■■■■■ 5.55
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.63■■■■■ 5.54
NOMO3-217ENST00000576589 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.53■■■■■ 5.52
NOMO3-217ENST00000576589 CUX1P39880 1505 aa49.53■■■■■ 5.52
NOMO3-217ENST00000576589 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.39■■■■■ 5.5
NOMO3-217ENST00000576589 SOGA1O94964 1423 aa49.38■■■■■ 5.5
NOMO3-217ENST00000576589 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.35■■■■■ 5.49
NOMO3-217ENST00000576589 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.35■■■■■ 5.49
NOMO3-217ENST00000576589 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
NOMO3-217ENST00000576589 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.22■■■■■ 5.47
NOMO3-217ENST00000576589 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.21■■■■■ 5.47
NOMO3-217ENST00000576589 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.16■■■■■ 5.46
NOMO3-217ENST00000576589 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.16■■■■■ 5.46
NOMO3-217ENST00000576589 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.16■■■■■ 5.46
NOMO3-217ENST00000576589 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.13■■■■■ 5.45
NOMO3-217ENST00000576589 ARHGEF11O15085 1522 aa49.03■■■■■ 5.44
NOMO3-217ENST00000576589 TOP2BQ02880 1626 aa49.02■■■■■ 5.44
NOMO3-217ENST00000576589 SYNJ1O43426 1573 aa49.02■■■■■ 5.44
NOMO3-217ENST00000576589 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.98■■■■■ 5.43
NOMO3-217ENST00000576589 FBLN2P98095 1184 aa48.93■■■■■ 5.42
NOMO3-217ENST00000576589 WDR97A6NE52 1622 aa48.93■■■■■ 5.42
NOMO3-217ENST00000576589 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.9■■■■■ 5.42
NOMO3-217ENST00000576589 CHD1O14646 1710 aa48.9■■■■■ 5.42
NOMO3-217ENST00000576589 GRIN2BQ13224 1484 aa48.78■■■■■ 5.4
NOMO3-217ENST00000576589 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.78■■■■■ 5.4
NOMO3-217ENST00000576589 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.76■■■■■ 5.4
NOMO3-217ENST00000576589 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.73■■■■■ 5.39
NOMO3-217ENST00000576589 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.65■■■■■ 5.38
NOMO3-217ENST00000576589 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.63■■■■■ 5.38
NOMO3-217ENST00000576589 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.56■■■■■ 5.36
NOMO3-217ENST00000576589 ARAP1Q96P48 1450 aa48.55■■■■■ 5.36
NOMO3-217ENST00000576589 PBRM1Q86U86 1689 aa48.52■■■■■ 5.36
NOMO3-217ENST00000576589 SYNJ2O15056 1496 aa48.46■■■■■ 5.35
NOMO3-217ENST00000576589 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.39■■■■■ 5.34
NOMO3-217ENST00000576589 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.29■■■■■ 5.32
NOMO3-217ENST00000576589 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.25■■■■■ 5.31
NOMO3-217ENST00000576589 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.21■■■■■ 5.31
NOMO3-217ENST00000576589 KIF27Q86VH2 1401 aa48.21■■■■■ 5.31
NOMO3-217ENST00000576589 ADAMTS12P58397 1594 aa48.21■■■■■ 5.31
NOMO3-217ENST00000576589 GRIN2AQ12879 1464 aa48.13■■■■■ 5.3
NOMO3-217ENST00000576589 IGF1RP08069 1367 aa48.04■■■■■ 5.28
NOMO3-217ENST00000576589 NUP160Q12769 1436 aa47.93■■■■■ 5.26
NOMO3-217ENST00000576589 CEP170Q5SW79 1584 aa47.86■■■■■ 5.25
NOMO3-217ENST00000576589 CUL7Q14999 1698 aa47.77■■■■■ 5.24
NOMO3-217ENST00000576589 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.76■■■■■ 5.24
NOMO3-217ENST00000576589 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.73■■■■■ 5.23
NOMO3-217ENST00000576589 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.66■■■■■ 5.22
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