RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574406.1

NLRP1-211, Transcript of NLR family pyrin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene NLRP1, Length 1,750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1-211ENST00000574406 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.8■■■■□ 3.48
NLRP1-211ENST00000574406 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.06■■■□□ 2.72
NLRP1-211ENST00000574406 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
NLRP1-211ENST00000574406 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.47■■■□□ 2.47
NLRP1-211ENST00000574406 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.32■■■□□ 2.44
NLRP1-211ENST00000574406 ABCC9O60706 1549 aa30.27■■■□□ 2.44
NLRP1-211ENST00000574406 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.11■■■□□ 2.41
NLRP1-211ENST00000574406 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.96■■■□□ 2.39
NLRP1-211ENST00000574406 NACADO15069 1562 aa29.88■■■□□ 2.37
NLRP1-211ENST00000574406 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.59■■■□□ 2.33
NLRP1-211ENST00000574406 SCRIBQ14160 1630 aa29.44■■■□□ 2.3
NLRP1-211ENST00000574406 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.95■■■□□ 2.23
NLRP1-211ENST00000574406 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
NLRP1-211ENST00000574406 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.71■■■□□ 2.19
NLRP1-211ENST00000574406 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.58■■■□□ 2.17
NLRP1-211ENST00000574406 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
NLRP1-211ENST00000574406 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
NLRP1-211ENST00000574406 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.42■■■□□ 2.14
NLRP1-211ENST00000574406 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
NLRP1-211ENST00000574406 SMARCA4P51532 1647 aa28.26■■■□□ 2.11
NLRP1-211ENST00000574406 WIZO95785 1651 aa28.15■■■□□ 2.1
NLRP1-211ENST00000574406 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.96■■■□□ 2.07
NLRP1-211ENST00000574406 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
NLRP1-211ENST00000574406 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
NLRP1-211ENST00000574406 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.82■■■□□ 2.04
NLRP1-211ENST00000574406 SMARCA2P51531 1590 aa27.8■■■□□ 2.04
NLRP1-211ENST00000574406 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.75■■■□□ 2.03
NLRP1-211ENST00000574406 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
NLRP1-211ENST00000574406 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.62■■■□□ 2.01
NLRP1-211ENST00000574406 NCAPD3P42695 1498 aa27.6■■■□□ 2.01
NLRP1-211ENST00000574406 HMGXB3Q12766 1538 aa27.54■■■□□ 2
NLRP1-211ENST00000574406 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.4■■□□□ 1.98
NLRP1-211ENST00000574406 TRIM41Q8WV44 630 aa27.19■■□□□ 1.94
NLRP1-211ENST00000574406 ABCC8Q09428 1581 aa27■■□□□ 1.91
NLRP1-211ENST00000574406 CFTRP13569 1480 aa26.98■■□□□ 1.91
NLRP1-211ENST00000574406 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.88■■□□□ 1.89
NLRP1-211ENST00000574406 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
NLRP1-211ENST00000574406 PRDM2Q13029 1718 aa26.77■■□□□ 1.88
NLRP1-211ENST00000574406 SYNJ1O43426 1573 aa26.74■■□□□ 1.87
NLRP1-211ENST00000574406 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.73■■□□□ 1.87
NLRP1-211ENST00000574406 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.68■■□□□ 1.86
NLRP1-211ENST00000574406 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
NLRP1-211ENST00000574406 TOP2BQ02880 1626 aa26.65■■□□□ 1.86
NLRP1-211ENST00000574406 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.62■■□□□ 1.85
NLRP1-211ENST00000574406 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.61■■□□□ 1.85
NLRP1-211ENST00000574406 NESP48681 1621 aa26.59■■□□□ 1.85
NLRP1-211ENST00000574406 CUX1P39880 1505 aa26.57■■□□□ 1.84
NLRP1-211ENST00000574406 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.56■■□□□ 1.84
NLRP1-211ENST00000574406 SOGA1O94964 1423 aa26.53■■□□□ 1.84
NLRP1-211ENST00000574406 EEA1Q15075 1411 aa26.52■■□□□ 1.84
NLRP1-211ENST00000574406 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.43■■□□□ 1.82
NLRP1-211ENST00000574406 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.42■■□□□ 1.82
NLRP1-211ENST00000574406 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.38■■□□□ 1.81
NLRP1-211ENST00000574406 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.36■■□□□ 1.81
NLRP1-211ENST00000574406 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.32■■□□□ 1.8
NLRP1-211ENST00000574406 TOPBP1Q92547 1522 aa26.27■■□□□ 1.8
NLRP1-211ENST00000574406 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.27■■□□□ 1.8
NLRP1-211ENST00000574406 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.25■■□□□ 1.79
NLRP1-211ENST00000574406 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.24■■□□□ 1.79
NLRP1-211ENST00000574406 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
NLRP1-211ENST00000574406 KIF27Q86VH2 1401 aa26.2■■□□□ 1.78
NLRP1-211ENST00000574406 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
NLRP1-211ENST00000574406 KIF21BO75037 1637 aa26.15■■□□□ 1.78
NLRP1-211ENST00000574406 GOLGA3Q08378 1498 aa26.12■■□□□ 1.77
NLRP1-211ENST00000574406 CUX2O14529 1486 aa26.1■■□□□ 1.77
NLRP1-211ENST00000574406 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.08■■□□□ 1.76
NLRP1-211ENST00000574406 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.07■■□□□ 1.76
NLRP1-211ENST00000574406 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.06■■□□□ 1.76
NLRP1-211ENST00000574406 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.05■■□□□ 1.76
NLRP1-211ENST00000574406 PRXQ9BXM0 1461 aa26.04■■□□□ 1.76
NLRP1-211ENST00000574406 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
NLRP1-211ENST00000574406 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.99■■□□□ 1.75
NLRP1-211ENST00000574406 IGF1RP08069 1367 aa25.98■■□□□ 1.75
NLRP1-211ENST00000574406 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.98■■□□□ 1.75
NLRP1-211ENST00000574406 ERCC6Q03468 1493 aa25.95■■□□□ 1.75
NLRP1-211ENST00000574406 WDR62O43379 1518 aa25.94■■□□□ 1.74
NLRP1-211ENST00000574406 WDR97A6NE52 1622 aa25.94■■□□□ 1.74
NLRP1-211ENST00000574406 CEP162Q5TB80 1403 aa25.93■■□□□ 1.74
NLRP1-211ENST00000574406 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
NLRP1-211ENST00000574406 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.84■■□□□ 1.73
NLRP1-211ENST00000574406 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
NLRP1-211ENST00000574406 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.82■■□□□ 1.72
NLRP1-211ENST00000574406 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
NLRP1-211ENST00000574406 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.78■■□□□ 1.72
NLRP1-211ENST00000574406 IFT140Q96RY7 1462 aa25.77■■□□□ 1.72
NLRP1-211ENST00000574406 CUL7Q14999 1698 aa25.74■■□□□ 1.71
NLRP1-211ENST00000574406 CLIP1P30622 1438 aa25.71■■□□□ 1.71
NLRP1-211ENST00000574406 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.67■■□□□ 1.7
NLRP1-211ENST00000574406 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
NLRP1-211ENST00000574406 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.69
NLRP1-211ENST00000574406 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
NLRP1-211ENST00000574406 PBRM1Q86U86 1689 aa25.58■■□□□ 1.69
NLRP1-211ENST00000574406 GRIN2BQ13224 1484 aa25.58■■□□□ 1.69
NLRP1-211ENST00000574406 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.52■■□□□ 1.68
NLRP1-211ENST00000574406 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
NLRP1-211ENST00000574406 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
NLRP1-211ENST00000574406 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.5■■□□□ 1.67
NLRP1-211ENST00000574406 ADAMTS12P58397 1594 aa25.48■■□□□ 1.67
NLRP1-211ENST00000574406 ARAP1Q96P48 1450 aa25.45■■□□□ 1.66
NLRP1-211ENST00000574406 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.45■■□□□ 1.66
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