RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573635.1

NOMO3-210, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 2

Gene NOMO3, Length 1,898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-210ENST00000573635 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.59■■■□□ 2.17
NOMO3-210ENST00000573635 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.17■■□□□ 1.62
NOMO3-210ENST00000573635 ABCC9O60706 1549 aa24.13■■□□□ 1.45
NOMO3-210ENST00000573635 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NOMO3-210ENST00000573635 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.71■■□□□ 1.39
NOMO3-210ENST00000573635 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.67■■□□□ 1.38
NOMO3-210ENST00000573635 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.62■■□□□ 1.37
NOMO3-210ENST00000573635 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.57■■□□□ 1.36
NOMO3-210ENST00000573635 NACADO15069 1562 aa23.54■■□□□ 1.36
NOMO3-210ENST00000573635 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.43■■□□□ 1.34
NOMO3-210ENST00000573635 SCRIBQ14160 1630 aa23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-210ENST00000573635 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.95■■□□□ 1.26
NOMO3-210ENST00000573635 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NOMO3-210ENST00000573635 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.72■■□□□ 1.23
NOMO3-210ENST00000573635 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
NOMO3-210ENST00000573635 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-210ENST00000573635 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.22■■□□□ 1.15
NOMO3-210ENST00000573635 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-210ENST00000573635 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NOMO3-210ENST00000573635 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.11■■□□□ 1.13
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NOMO3-210ENST00000573635 WIZO95785 1651 aa21.96■■□□□ 1.11
NOMO3-210ENST00000573635 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-210ENST00000573635 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.84■■□□□ 1.09
NOMO3-210ENST00000573635 SMARCA2P51531 1590 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-210ENST00000573635 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-210ENST00000573635 NCAPD3P42695 1498 aa21.71■■□□□ 1.07
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NOMO3-210ENST00000573635 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.49■■□□□ 1.03
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NOMO3-210ENST00000573635 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-210ENST00000573635 ABCC8Q09428 1581 aa21.22■□□□□ 0.99
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NOMO3-210ENST00000573635 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.12■□□□□ 0.97
NOMO3-210ENST00000573635 CFTRP13569 1480 aa21.11■□□□□ 0.97
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NOMO3-210ENST00000573635 PRDM2Q13029 1718 aa21■□□□□ 0.95
NOMO3-210ENST00000573635 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
NOMO3-210ENST00000573635 SYNJ1O43426 1573 aa20.92■□□□□ 0.94
NOMO3-210ENST00000573635 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.9■□□□□ 0.94
NOMO3-210ENST00000573635 SOGA1O94964 1423 aa20.89■□□□□ 0.94
NOMO3-210ENST00000573635 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.88■□□□□ 0.93
NOMO3-210ENST00000573635 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.85■□□□□ 0.93
NOMO3-210ENST00000573635 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.84■□□□□ 0.93
NOMO3-210ENST00000573635 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.82■□□□□ 0.92
NOMO3-210ENST00000573635 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.8■□□□□ 0.92
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NOMO3-210ENST00000573635 WDR62O43379 1518 aa20.56■□□□□ 0.88
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NOMO3-210ENST00000573635 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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NOMO3-210ENST00000573635 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.34■□□□□ 0.85
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NOMO3-210ENST00000573635 CUL7Q14999 1698 aa20.02■□□□□ 0.79
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