RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571287.1

HOXB2-203, Transcript of homeobox B2, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB2, Length 625 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2-203ENST00000571287 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.23■■■■■ 6.91
HOXB2-203ENST00000571287 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.68■■■■■ 5.86
HOXB2-203ENST00000571287 ABCC9O60706 1549 aa50.11■■■■■ 5.61
HOXB2-203ENST00000571287 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.59■■■■■ 5.37
HOXB2-203ENST00000571287 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.44■■■■■ 5.34
HOXB2-203ENST00000571287 NACADO15069 1562 aa48.43■■■■■ 5.34
HOXB2-203ENST00000571287 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.4■■■■■ 5.34
HOXB2-203ENST00000571287 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.24■■■■■ 5.31
HOXB2-203ENST00000571287 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.2■■■■■ 5.31
HOXB2-203ENST00000571287 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.47■■■■■ 5.19
HOXB2-203ENST00000571287 SCRIBQ14160 1630 aa47.16■■■■■ 5.14
HOXB2-203ENST00000571287 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.94■■■■■ 5.1
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HOXB2-203ENST00000571287 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.43■■■■■ 5.02
HOXB2-203ENST00000571287 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
HOXB2-203ENST00000571287 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.59■■■■■ 4.89
HOXB2-203ENST00000571287 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.39■■■■■ 4.86
HOXB2-203ENST00000571287 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.31■■■■■ 4.84
HOXB2-203ENST00000571287 SMARCA4P51532 1647 aa45.15■■■■■ 4.82
HOXB2-203ENST00000571287 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
HOXB2-203ENST00000571287 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.9■■■■■ 4.78
HOXB2-203ENST00000571287 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.74■■■■■ 4.75
HOXB2-203ENST00000571287 SMARCA2P51531 1590 aa44.73■■■■■ 4.75
HOXB2-203ENST00000571287 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.68■■■■■ 4.74
HOXB2-203ENST00000571287 NCAPD3P42695 1498 aa44.64■■■■■ 4.74
HOXB2-203ENST00000571287 HMGXB3Q12766 1538 aa44.5■■■■■ 4.71
HOXB2-203ENST00000571287 WIZO95785 1651 aa44.49■■■■■ 4.71
HOXB2-203ENST00000571287 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
HOXB2-203ENST00000571287 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
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HOXB2-203ENST00000571287 NESP48681 1621 aa43.49■■■■■ 4.55
HOXB2-203ENST00000571287 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.46■■■■■ 4.55
HOXB2-203ENST00000571287 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.45■■■■■ 4.55
HOXB2-203ENST00000571287 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.35■■■■■ 4.53
HOXB2-203ENST00000571287 CFTRP13569 1480 aa43.19■■■■■ 4.51
HOXB2-203ENST00000571287 ERCC6Q03468 1493 aa43.16■■■■■ 4.5
HOXB2-203ENST00000571287 PRDM2Q13029 1718 aa43.11■■■■■ 4.49
HOXB2-203ENST00000571287 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.1■■■■■ 4.49
HOXB2-203ENST00000571287 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.09■■■■■ 4.49
HOXB2-203ENST00000571287 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.88■■■■■ 4.46
HOXB2-203ENST00000571287 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.81■■■■■ 4.44
HOXB2-203ENST00000571287 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
HOXB2-203ENST00000571287 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.66■■■■■ 4.42
HOXB2-203ENST00000571287 CUX2O14529 1486 aa42.55■■■■■ 4.4
HOXB2-203ENST00000571287 WDR62O43379 1518 aa42.53■■■■■ 4.4
HOXB2-203ENST00000571287 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
HOXB2-203ENST00000571287 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.27■■■■■ 4.36
HOXB2-203ENST00000571287 ABCC8Q09428 1581 aa42.27■■■■■ 4.36
HOXB2-203ENST00000571287 TOPBP1Q92547 1522 aa42.26■■■■■ 4.36
HOXB2-203ENST00000571287 CUX1P39880 1505 aa42.1■■■■■ 4.33
HOXB2-203ENST00000571287 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.94■■■■■ 4.3
HOXB2-203ENST00000571287 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
HOXB2-203ENST00000571287 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.89■■■■■ 4.3
HOXB2-203ENST00000571287 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.88■■■■■ 4.29
HOXB2-203ENST00000571287 IFT140Q96RY7 1462 aa41.88■■■■■ 4.29
HOXB2-203ENST00000571287 SYNJ1O43426 1573 aa41.88■■■■■ 4.29
HOXB2-203ENST00000571287 TOP2BQ02880 1626 aa41.87■■■■■ 4.29
HOXB2-203ENST00000571287 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
HOXB2-203ENST00000571287 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.73■■■■■ 4.27
HOXB2-203ENST00000571287 SOGA1O94964 1423 aa41.73■■■■■ 4.27
HOXB2-203ENST00000571287 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
HOXB2-203ENST00000571287 WDR97A6NE52 1622 aa41.62■■■■■ 4.25
HOXB2-203ENST00000571287 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
HOXB2-203ENST00000571287 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.49■■■■■ 4.23
HOXB2-203ENST00000571287 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.238e-24■■□□□ 12.6
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HOXB2-203ENST00000571287 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.34■■■■■ 4.21
HOXB2-203ENST00000571287 PBRM1Q86U86 1689 aa41.29■■■■■ 4.2
HOXB2-203ENST00000571287 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.28■■■■■ 4.2
HOXB2-203ENST00000571287 GRIN2BQ13224 1484 aa41.21■■■■■ 4.19
HOXB2-203ENST00000571287 TRIM41Q8WV44 630 aa41.2■■■■■ 4.19
HOXB2-203ENST00000571287 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.12■■■■■ 4.17
HOXB2-203ENST00000571287 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
HOXB2-203ENST00000571287 CHD1O14646 1710 aa41.05■■■■■ 4.16
HOXB2-203ENST00000571287 KIF27Q86VH2 1401 aa41.03■■■■■ 4.16
HOXB2-203ENST00000571287 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.02■■■■■ 4.16
HOXB2-203ENST00000571287 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.96■■■■■ 4.15
HOXB2-203ENST00000571287 ADAMTS12P58397 1594 aa40.91■■■■■ 4.14
HOXB2-203ENST00000571287 SYNJ2O15056 1496 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXB2-203ENST00000571287 FBLN2P98095 1184 aa40.87■■■■■ 4.13
HOXB2-203ENST00000571287 OSCARQ8IYS5 282 aa40.82■■■■■ 4.13
HOXB2-203ENST00000571287 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
HOXB2-203ENST00000571287 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.81■■■■■ 4.12
HOXB2-203ENST00000571287 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.8■■■■■ 4.12
HOXB2-203ENST00000571287 IGF1RP08069 1367 aa40.79■■■■■ 4.12
HOXB2-203ENST00000571287 CUL7Q14999 1698 aa40.77■■■■■ 4.12
HOXB2-203ENST00000571287 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.74■■■■■ 4.11
HOXB2-203ENST00000571287 GRIN2AQ12879 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
HOXB2-203ENST00000571287 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.58■■■■■ 4.09
HOXB2-203ENST00000571287 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.52■■■■■ 4.08
HOXB2-203ENST00000571287 CEP170Q5SW79 1584 aa40.51■■■■■ 4.08
HOXB2-203ENST00000571287 EEA1Q15075 1411 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXB2-203ENST00000571287 NUP160Q12769 1436 aa40.49■■■■■ 4.07
HOXB2-203ENST00000571287 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.4■■■■■ 4.06
HOXB2-203ENST00000571287 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.38■■■■■ 4.05
HOXB2-203ENST00000571287 PRXQ9BXM0 1461 aa40.34■■■■■ 4.05
HOXB2-203ENST00000571287 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
HOXB2-203ENST00000571287 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.23■■■■■ 4.03
HOXB2-203ENST00000571287 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.23■■■■■ 4.03
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