RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570732.1

NOMO3-205, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 2

Gene NOMO3, Length 643 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-205ENST00000570732 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.52■■■■□ 3.28
NOMO3-205ENST00000570732 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.13■■■□□ 2.57
NOMO3-205ENST00000570732 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
NOMO3-205ENST00000570732 ABCC9O60706 1549 aa29.6■■■□□ 2.33
NOMO3-205ENST00000570732 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.44■■■□□ 2.3
NOMO3-205ENST00000570732 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.4■■■□□ 2.3
NOMO3-205ENST00000570732 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.23■■■□□ 2.27
NOMO3-205ENST00000570732 NACADO15069 1562 aa29.09■■■□□ 2.25
NOMO3-205ENST00000570732 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.89■■■□□ 2.22
NOMO3-205ENST00000570732 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.68■■■□□ 2.18
NOMO3-205ENST00000570732 SCRIBQ14160 1630 aa28.5■■■□□ 2.15
NOMO3-205ENST00000570732 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.09■■■□□ 2.09
NOMO3-205ENST00000570732 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.9■■■□□ 2.06
NOMO3-205ENST00000570732 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
NOMO3-205ENST00000570732 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.53■■■□□ 2
NOMO3-205ENST00000570732 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
NOMO3-205ENST00000570732 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
NOMO3-205ENST00000570732 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
NOMO3-205ENST00000570732 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.37■■□□□ 1.97
NOMO3-205ENST00000570732 SMARCA4P51532 1647 aa27.34■■□□□ 1.97
NOMO3-205ENST00000570732 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
NOMO3-205ENST00000570732 WIZO95785 1651 aa27.09■■□□□ 1.93
NOMO3-205ENST00000570732 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.05■■□□□ 1.92
NOMO3-205ENST00000570732 SMARCA2P51531 1590 aa27.02■■□□□ 1.92
NOMO3-205ENST00000570732 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.98■■□□□ 1.91
NOMO3-205ENST00000570732 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
NOMO3-205ENST00000570732 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
NOMO3-205ENST00000570732 NCAPD3P42695 1498 aa26.83■■□□□ 1.89
NOMO3-205ENST00000570732 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.78■■□□□ 1.88
NOMO3-205ENST00000570732 HMGXB3Q12766 1538 aa26.77■■□□□ 1.88
NOMO3-205ENST00000570732 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.6■■□□□ 1.85
NOMO3-205ENST00000570732 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.26■■□□□ 1.79
NOMO3-205ENST00000570732 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.2■■□□□ 1.78
NOMO3-205ENST00000570732 CFTRP13569 1480 aa26.15■■□□□ 1.78
NOMO3-205ENST00000570732 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.13■■□□□ 1.77
NOMO3-205ENST00000570732 TRIM41Q8WV44 630 aa25.98■■□□□ 1.75
NOMO3-205ENST00000570732 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.96■■□□□ 1.75
NOMO3-205ENST00000570732 PRDM2Q13029 1718 aa25.93■■□□□ 1.74
NOMO3-205ENST00000570732 ABCC8Q09428 1581 aa25.88■■□□□ 1.73
NOMO3-205ENST00000570732 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
NOMO3-205ENST00000570732 NESP48681 1621 aa25.85■■□□□ 1.73
NOMO3-205ENST00000570732 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.82■■□□□ 1.72
NOMO3-205ENST00000570732 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.81■■□□□ 1.72
NOMO3-205ENST00000570732 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.71■■□□□ 1.71
NOMO3-205ENST00000570732 SYNJ1O43426 1573 aa25.68■■□□□ 1.7
NOMO3-205ENST00000570732 TOP2BQ02880 1626 aa25.66■■□□□ 1.7
NOMO3-205ENST00000570732 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.63■■□□□ 1.69
NOMO3-205ENST00000570732 CUX1P39880 1505 aa25.63■■□□□ 1.69
NOMO3-205ENST00000570732 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.54■■□□□ 1.68
NOMO3-205ENST00000570732 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.53■■□□□ 1.68
NOMO3-205ENST00000570732 ERCC6Q03468 1493 aa25.5■■□□□ 1.67
NOMO3-205ENST00000570732 TOPBP1Q92547 1522 aa25.49■■□□□ 1.67
NOMO3-205ENST00000570732 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.47■■□□□ 1.67
NOMO3-205ENST00000570732 EEA1Q15075 1411 aa25.46■■□□□ 1.67
NOMO3-205ENST00000570732 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
NOMO3-205ENST00000570732 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.42■■□□□ 1.66
NOMO3-205ENST00000570732 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
NOMO3-205ENST00000570732 SOGA1O94964 1423 aa25.37■■□□□ 1.65
NOMO3-205ENST00000570732 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
NOMO3-205ENST00000570732 WDR62O43379 1518 aa25.32■■□□□ 1.64
NOMO3-205ENST00000570732 KIF27Q86VH2 1401 aa25.29■■□□□ 1.64
NOMO3-205ENST00000570732 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.26■■□□□ 1.63
NOMO3-205ENST00000570732 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.24■■□□□ 1.63
NOMO3-205ENST00000570732 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NOMO3-205ENST00000570732 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.22■■□□□ 1.63
NOMO3-205ENST00000570732 CUX2O14529 1486 aa25.22■■□□□ 1.63
NOMO3-205ENST00000570732 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.21■■□□□ 1.63
NOMO3-205ENST00000570732 IFT140Q96RY7 1462 aa25.14■■□□□ 1.61
NOMO3-205ENST00000570732 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.12■■□□□ 1.61
NOMO3-205ENST00000570732 WDR97A6NE52 1622 aa25.08■■□□□ 1.6
NOMO3-205ENST00000570732 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
NOMO3-205ENST00000570732 KIF21BO75037 1637 aa25.03■■□□□ 1.6
NOMO3-205ENST00000570732 GOLGA3Q08378 1498 aa25.02■■□□□ 1.6
NOMO3-205ENST00000570732 IGF1RP08069 1367 aa25.02■■□□□ 1.6
NOMO3-205ENST00000570732 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
NOMO3-205ENST00000570732 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.01■■□□□ 1.59
NOMO3-205ENST00000570732 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.99■■□□□ 1.59
NOMO3-205ENST00000570732 PRXQ9BXM0 1461 aa24.99■■□□□ 1.59
NOMO3-205ENST00000570732 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.97■■□□□ 1.59
NOMO3-205ENST00000570732 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.95■■□□□ 1.58
NOMO3-205ENST00000570732 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.93■■□□□ 1.58
NOMO3-205ENST00000570732 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NOMO3-205ENST00000570732 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.89■■□□□ 1.58
NOMO3-205ENST00000570732 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.89■■□□□ 1.57
NOMO3-205ENST00000570732 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
NOMO3-205ENST00000570732 CUL7Q14999 1698 aa24.88■■□□□ 1.57
NOMO3-205ENST00000570732 GRIN2BQ13224 1484 aa24.88■■□□□ 1.57
NOMO3-205ENST00000570732 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NOMO3-205ENST00000570732 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
NOMO3-205ENST00000570732 PBRM1Q86U86 1689 aa24.8■■□□□ 1.56
NOMO3-205ENST00000570732 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.77■■□□□ 1.56
NOMO3-205ENST00000570732 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
NOMO3-205ENST00000570732 ADAMTS12P58397 1594 aa24.7■■□□□ 1.54
NOMO3-205ENST00000570732 CEP162Q5TB80 1403 aa24.69■■□□□ 1.54
NOMO3-205ENST00000570732 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.69■■□□□ 1.54
NOMO3-205ENST00000570732 CLIP1P30622 1438 aa24.6■■□□□ 1.53
NOMO3-205ENST00000570732 SYNJ2O15056 1496 aa24.59■■□□□ 1.53
NOMO3-205ENST00000570732 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
NOMO3-205ENST00000570732 GRIN2AQ12879 1464 aa24.54■■□□□ 1.52
NOMO3-205ENST00000570732 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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