RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570511.5

MEFV-211, Transcript of MEFV, pyrin innate immunity regulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEFV, Length 1,751 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFV-211ENST00000570511 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.7■■■■■ 5.55
MEFV-211ENST00000570511 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.53■■■■■ 4.56
MEFV-211ENST00000570511 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
MEFV-211ENST00000570511 ABCC9O60706 1549 aa41.26■■■■■ 4.2
MEFV-211ENST00000570511 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.14■■■■■ 4.18
MEFV-211ENST00000570511 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.95■■■■■ 4.15
MEFV-211ENST00000570511 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.76■■■■■ 4.12
MEFV-211ENST00000570511 NACADO15069 1562 aa40.55■■■■■ 4.08
MEFV-211ENST00000570511 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.26■■■■■ 4.03
MEFV-211ENST00000570511 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.25■■■■■ 4.03
MEFV-211ENST00000570511 SCRIBQ14160 1630 aa39.92■■■■□ 3.98
MEFV-211ENST00000570511 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.51■■■■□ 3.91
MEFV-211ENST00000570511 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.06■■■■□ 3.84
MEFV-211ENST00000570511 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.8■■■■□ 3.8
MEFV-211ENST00000570511 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.61■■■■□ 3.77
MEFV-211ENST00000570511 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.77
MEFV-211ENST00000570511 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
MEFV-211ENST00000570511 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
MEFV-211ENST00000570511 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.37■■■■□ 3.73
MEFV-211ENST00000570511 SMARCA4P51532 1647 aa38.29■■■■□ 3.72
MEFV-211ENST00000570511 WIZO95785 1651 aa38.06■■■■□ 3.68
MEFV-211ENST00000570511 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
MEFV-211ENST00000570511 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.86■■■■□ 3.65
MEFV-211ENST00000570511 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
MEFV-211ENST00000570511 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.68■■■■□ 3.62
MEFV-211ENST00000570511 SMARCA2P51531 1590 aa37.67■■■■□ 3.62
MEFV-211ENST00000570511 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
MEFV-211ENST00000570511 NCAPD3P42695 1498 aa37.4■■■■□ 3.58
MEFV-211ENST00000570511 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.39■■■■□ 3.58
MEFV-211ENST00000570511 HMGXB3Q12766 1538 aa37.38■■■■□ 3.57
MEFV-211ENST00000570511 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.24■■■■□ 3.55
MEFV-211ENST00000570511 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.83■■■■□ 3.49
MEFV-211ENST00000570511 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.57■■■■□ 3.44
MEFV-211ENST00000570511 CFTRP13569 1480 aa36.51■■■■□ 3.44
MEFV-211ENST00000570511 PRDM2Q13029 1718 aa36.41■■■■□ 3.42
MEFV-211ENST00000570511 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.4■■■■□ 3.42
MEFV-211ENST00000570511 ABCC8Q09428 1581 aa36.4■■■■□ 3.42
MEFV-211ENST00000570511 TRIM41Q8WV44 630 aa36.31■■■■□ 3.4
MEFV-211ENST00000570511 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.2■■■■□ 3.39
MEFV-211ENST00000570511 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.38
MEFV-211ENST00000570511 NESP48681 1621 aa36.16■■■■□ 3.38
MEFV-211ENST00000570511 SYNJ1O43426 1573 aa36.08■■■■□ 3.37
MEFV-211ENST00000570511 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.01■■■■□ 3.36
MEFV-211ENST00000570511 TOP2BQ02880 1626 aa35.97■■■■□ 3.35
MEFV-211ENST00000570511 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.96■■■■□ 3.35
MEFV-211ENST00000570511 CUX1P39880 1505 aa35.9■■■■□ 3.34
MEFV-211ENST00000570511 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.88■■■■□ 3.33
MEFV-211ENST00000570511 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.82■■■■□ 3.32
MEFV-211ENST00000570511 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.8■■■■□ 3.32
MEFV-211ENST00000570511 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.68■■■■□ 3.3
MEFV-211ENST00000570511 SOGA1O94964 1423 aa35.62■■■■□ 3.29
MEFV-211ENST00000570511 TOPBP1Q92547 1522 aa35.61■■■■□ 3.29
MEFV-211ENST00000570511 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
MEFV-211ENST00000570511 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
MEFV-211ENST00000570511 EEA1Q15075 1411 aa35.54■■■■□ 3.28
MEFV-211ENST00000570511 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.54■■■■□ 3.28
MEFV-211ENST00000570511 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.51■■■■□ 3.28
MEFV-211ENST00000570511 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.45■■■■□ 3.27
MEFV-211ENST00000570511 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
MEFV-211ENST00000570511 ERCC6Q03468 1493 aa35.4■■■■□ 3.26
MEFV-211ENST00000570511 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.37■■■■□ 3.25
MEFV-211ENST00000570511 WDR62O43379 1518 aa35.31■■■■□ 3.24
MEFV-211ENST00000570511 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.3■■■■□ 3.24
MEFV-211ENST00000570511 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
MEFV-211ENST00000570511 KIF27Q86VH2 1401 aa35.28■■■■□ 3.24
MEFV-211ENST00000570511 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.27■■■■□ 3.24
MEFV-211ENST00000570511 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.25■■■■□ 3.23
MEFV-211ENST00000570511 CUX2O14529 1486 aa35.24■■■■□ 3.23
MEFV-211ENST00000570511 WDR97A6NE52 1622 aa35.22■■■■□ 3.23
MEFV-211ENST00000570511 KIF21BO75037 1637 aa35.13■■■■□ 3.22
MEFV-211ENST00000570511 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
MEFV-211ENST00000570511 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.07■■■■□ 3.2
MEFV-211ENST00000570511 GOLGA3Q08378 1498 aa35.03■■■■□ 3.2
MEFV-211ENST00000570511 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.02■■■■□ 3.2
MEFV-211ENST00000570511 PRXQ9BXM0 1461 aa35.01■■■■□ 3.19
MEFV-211ENST00000570511 IFT140Q96RY7 1462 aa34.98■■■■□ 3.19
MEFV-211ENST00000570511 IGF1RP08069 1367 aa34.98■■■■□ 3.19
MEFV-211ENST00000570511 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.95■■■■□ 3.18
MEFV-211ENST00000570511 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.93■■■■□ 3.18
MEFV-211ENST00000570511 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
MEFV-211ENST00000570511 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.88■■■■□ 3.17
MEFV-211ENST00000570511 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.85■■■■□ 3.17
MEFV-211ENST00000570511 CUL7Q14999 1698 aa34.82■■■■□ 3.16
MEFV-211ENST00000570511 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.79■■■■□ 3.16
MEFV-211ENST00000570511 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
MEFV-211ENST00000570511 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
MEFV-211ENST00000570511 PBRM1Q86U86 1689 aa34.78■■■■□ 3.16
MEFV-211ENST00000570511 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.76■■■■□ 3.15
MEFV-211ENST00000570511 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
MEFV-211ENST00000570511 GRIN2BQ13224 1484 aa34.66■■■■□ 3.14
MEFV-211ENST00000570511 CEP162Q5TB80 1403 aa34.65■■■■□ 3.14
MEFV-211ENST00000570511 ADAMTS12P58397 1594 aa34.57■■■■□ 3.12
MEFV-211ENST00000570511 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.51■■■■□ 3.11
MEFV-211ENST00000570511 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.46■■■■□ 3.11
MEFV-211ENST00000570511 CLIP1P30622 1438 aa34.44■■■■□ 3.1
MEFV-211ENST00000570511 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
MEFV-211ENST00000570511 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.41■■■■□ 3.1
MEFV-211ENST00000570511 SYNJ2O15056 1496 aa34.28■■■■□ 3.08
MEFV-211ENST00000570511 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
MEFV-211ENST00000570511 GRIN2AQ12879 1464 aa34.26■■■■□ 3.07
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