RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569504.5

TSNAXIP1-216, Transcript of translin associated factor X interacting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TSNAXIP1, Length 2,009 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1-216ENST00000569504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.13■■■■□ 3.85
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TSNAXIP1-216ENST00000569504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.34■■■□□ 2.77
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TSNAXIP1-216ENST00000569504 SMARCA2P51531 1590 aa29.62■■■□□ 2.33
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TSNAXIP1-216ENST00000569504 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.29■■■□□ 2.28
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TSNAXIP1-216ENST00000569504 PRDM2Q13029 1718 aa28.61■■■□□ 2.17
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TSNAXIP1-216ENST00000569504 SYNJ1O43426 1573 aa28.45■■■□□ 2.15
TSNAXIP1-216ENST00000569504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.4■■■□□ 2.14
TSNAXIP1-216ENST00000569504 NESP48681 1621 aa28.4■■■□□ 2.14
TSNAXIP1-216ENST00000569504 TOP2BQ02880 1626 aa28.34■■■□□ 2.13
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TSNAXIP1-216ENST00000569504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.32■■■□□ 2.12
TSNAXIP1-216ENST00000569504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNAXIP1-216ENST00000569504 CUX1P39880 1505 aa28.27■■■□□ 2.12
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TSNAXIP1-216ENST00000569504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.09■■■□□ 2.09
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TSNAXIP1-216ENST00000569504 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
TSNAXIP1-216ENST00000569504 ADAMTS12P58397 1594 aa27.17■■□□□ 1.94
TSNAXIP1-216ENST00000569504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.16■■□□□ 1.94
TSNAXIP1-216ENST00000569504 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.12■■□□□ 1.93
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TSNAXIP1-216ENST00000569504 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.02■■□□□ 1.92
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