RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568641.1

NLRP1-206, Transcript of NLR family pyrin domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NLRP1, Length 1,627 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1-206ENST00000568641 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.52■■■■■ 7.28
NLRP1-206ENST00000568641 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53■■■■■ 6.07
NLRP1-206ENST00000568641 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.81■■■■■ 5.72
NLRP1-206ENST00000568641 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.18■■■■■ 5.62
NLRP1-206ENST00000568641 ABCC9O60706 1549 aa50.01■■■■■ 5.6
NLRP1-206ENST00000568641 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.86■■■■■ 5.57
NLRP1-206ENST00000568641 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.68■■■■■ 5.54
NLRP1-206ENST00000568641 NACADO15069 1562 aa49.38■■■■■ 5.5
NLRP1-206ENST00000568641 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49■■■■■ 5.43
NLRP1-206ENST00000568641 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.98■■■■■ 5.43
NLRP1-206ENST00000568641 SCRIBQ14160 1630 aa48.5■■■■■ 5.36
NLRP1-206ENST00000568641 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.84■■■■■ 5.25
NLRP1-206ENST00000568641 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.34■■■■■ 5.17
NLRP1-206ENST00000568641 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.13■■■■■ 5.14
NLRP1-206ENST00000568641 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.04■■■■■ 5.12
NLRP1-206ENST00000568641 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.89■■■■■ 5.1
NLRP1-206ENST00000568641 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.82■■■■■ 5.09
NLRP1-206ENST00000568641 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.81■■■■■ 5.08
NLRP1-206ENST00000568641 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.65■■■■■ 5.06
NLRP1-206ENST00000568641 SMARCA4P51532 1647 aa46.57■■■■■ 5.04
NLRP1-206ENST00000568641 WIZO95785 1651 aa46.26■■■■■ 5
NLRP1-206ENST00000568641 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.07■■■■■ 4.97
NLRP1-206ENST00000568641 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
NLRP1-206ENST00000568641 SMARCA2P51531 1590 aa45.91■■■■■ 4.94
NLRP1-206ENST00000568641 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
NLRP1-206ENST00000568641 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.81■■■■■ 4.92
NLRP1-206ENST00000568641 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
NLRP1-206ENST00000568641 NCAPD3P42695 1498 aa45.5■■■■■ 4.87
NLRP1-206ENST00000568641 HMGXB3Q12766 1538 aa45.48■■■■■ 4.87
NLRP1-206ENST00000568641 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.34■■■■■ 4.85
NLRP1-206ENST00000568641 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.32■■■■■ 4.85
NLRP1-206ENST00000568641 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.07■■■■■ 4.81
NLRP1-206ENST00000568641 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.57■■■■■ 4.73
NLRP1-206ENST00000568641 TRIM41Q8WV44 630 aa44.46■■■■■ 4.71
NLRP1-206ENST00000568641 CFTRP13569 1480 aa44.42■■■■■ 4.7
NLRP1-206ENST00000568641 PRDM2Q13029 1718 aa44.3■■■■■ 4.68
NLRP1-206ENST00000568641 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.29■■■■■ 4.68
NLRP1-206ENST00000568641 ABCC8Q09428 1581 aa44.26■■■■■ 4.68
NLRP1-206ENST00000568641 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.14■■■■■ 4.66
NLRP1-206ENST00000568641 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.04■■■■■ 4.64
NLRP1-206ENST00000568641 SYNJ1O43426 1573 aa43.88■■■■■ 4.62
NLRP1-206ENST00000568641 TOP2BQ02880 1626 aa43.83■■■■■ 4.61
NLRP1-206ENST00000568641 NESP48681 1621 aa43.8■■■■■ 4.6
NLRP1-206ENST00000568641 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.8■■■■■ 4.6
NLRP1-206ENST00000568641 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.79■■■■■ 4.6
NLRP1-206ENST00000568641 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.69■■■■■ 4.59
NLRP1-206ENST00000568641 CUX1P39880 1505 aa43.66■■■■■ 4.58
NLRP1-206ENST00000568641 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.58■■■■■ 4.57
NLRP1-206ENST00000568641 EEA1Q15075 1411 aa43.57■■■■■ 4.56
NLRP1-206ENST00000568641 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
NLRP1-206ENST00000568641 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.43■■■■■ 4.54
NLRP1-206ENST00000568641 SOGA1O94964 1423 aa43.39■■■■■ 4.54
NLRP1-206ENST00000568641 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.38■■■■■ 4.54
NLRP1-206ENST00000568641 TOPBP1Q92547 1522 aa43.3■■■■■ 4.52
NLRP1-206ENST00000568641 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.24■■■■■ 4.51
NLRP1-206ENST00000568641 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.22■■■■■ 4.51
NLRP1-206ENST00000568641 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
NLRP1-206ENST00000568641 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.18■■■■■ 4.5
NLRP1-206ENST00000568641 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.18■■■■■ 4.5
NLRP1-206ENST00000568641 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.11■■■■■ 4.49
NLRP1-206ENST00000568641 KIF27Q86VH2 1401 aa43.09■■■■■ 4.49
NLRP1-206ENST00000568641 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
NLRP1-206ENST00000568641 ERCC6Q03468 1493 aa43.01■■■■■ 4.48
NLRP1-206ENST00000568641 CUX2O14529 1486 aa42.94■■■■■ 4.46
NLRP1-206ENST00000568641 KIF21BO75037 1637 aa42.93■■■■■ 4.46
NLRP1-206ENST00000568641 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.91■■■■■ 4.46
NLRP1-206ENST00000568641 WDR62O43379 1518 aa42.88■■■■■ 4.46
NLRP1-206ENST00000568641 GOLGA3Q08378 1498 aa42.86■■■■■ 4.45
NLRP1-206ENST00000568641 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.82■■■■■ 4.45
NLRP1-206ENST00000568641 WDR97A6NE52 1622 aa42.78■■■■■ 4.44
NLRP1-206ENST00000568641 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
NLRP1-206ENST00000568641 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.73■■■■■ 4.43
NLRP1-206ENST00000568641 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.7■■■■■ 4.43
NLRP1-206ENST00000568641 PRXQ9BXM0 1461 aa42.69■■■■■ 4.43
NLRP1-206ENST00000568641 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.66■■■■■ 4.42
NLRP1-206ENST00000568641 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
NLRP1-206ENST00000568641 IGF1RP08069 1367 aa42.61■■■■■ 4.41
NLRP1-206ENST00000568641 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
NLRP1-206ENST00000568641 IFT140Q96RY7 1462 aa42.58■■■■■ 4.41
NLRP1-206ENST00000568641 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.57■■■■■ 4.41
NLRP1-206ENST00000568641 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.57■■■■■ 4.4
NLRP1-206ENST00000568641 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.48■■■■■ 4.39
NLRP1-206ENST00000568641 CUL7Q14999 1698 aa42.47■■■■■ 4.39
NLRP1-206ENST00000568641 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.45■■■■■ 4.39
NLRP1-206ENST00000568641 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
NLRP1-206ENST00000568641 CEP162Q5TB80 1403 aa42.37■■■■■ 4.37
NLRP1-206ENST00000568641 PBRM1Q86U86 1689 aa42.27■■■■■ 4.36
NLRP1-206ENST00000568641 GRIN2BQ13224 1484 aa42.21■■■■■ 4.35
NLRP1-206ENST00000568641 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.19■■■■■ 4.34
NLRP1-206ENST00000568641 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
NLRP1-206ENST00000568641 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
NLRP1-206ENST00000568641 CLIP1P30622 1438 aa42.11■■■■■ 4.33
NLRP1-206ENST00000568641 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.06■■■■■ 4.32
NLRP1-206ENST00000568641 ADAMTS12P58397 1594 aa42.03■■■■■ 4.32
NLRP1-206ENST00000568641 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.93■■■■■ 4.3
NLRP1-206ENST00000568641 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
NLRP1-206ENST00000568641 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.87■■■■■ 4.29
NLRP1-206ENST00000568641 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
NLRP1-206ENST00000568641 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.74■■■■■ 4.27
NLRP1-206ENST00000568641 SYNJ2O15056 1496 aa41.72■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.2 ms