RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567820.1

LMF1-AS1-201, LMF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene LMF1-AS1, Length 1,064 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.86■■■■■ 4.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.2■■■■□ 3.39
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ABCC9O60706 1549 aa34.96■■■■□ 3.19
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NACADO15069 1562 aa33.89■■■■□ 3.02
LMF1-AS1-201ENST00000567820 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.85■■■■□ 3.01
LMF1-AS1-201ENST00000567820 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.85■■■■□ 3.01
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.83■■■■□ 3.01
LMF1-AS1-201ENST00000567820 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.8■■■■□ 3
LMF1-AS1-201ENST00000567820 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.2■■■□□ 2.91
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SCRIBQ14160 1630 aa33.02■■■□□ 2.88
LMF1-AS1-201ENST00000567820 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.87■■■□□ 2.85
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.69■■■□□ 2.82
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.5■■■□□ 2.79
LMF1-AS1-201ENST00000567820 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.35■■■□□ 2.77
LMF1-AS1-201ENST00000567820 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.78■■■□□ 2.68
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.7■■■□□ 2.66
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SMARCA4P51532 1647 aa31.64■■■□□ 2.66
LMF1-AS1-201ENST00000567820 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
LMF1-AS1-201ENST00000567820 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.51■■■□□ 2.63
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.35■■■□□ 2.61
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.34■■■□□ 2.61
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SMARCA2P51531 1590 aa31.31■■■□□ 2.6
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NCAPD3P42695 1498 aa31.27■■■□□ 2.6
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.6
LMF1-AS1-201ENST00000567820 WIZO95785 1651 aa31.2■■■□□ 2.59
LMF1-AS1-201ENST00000567820 HMGXB3Q12766 1538 aa31.17■■■□□ 2.58
LMF1-AS1-201ENST00000567820 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.49■■■□□ 2.47
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NESP48681 1621 aa30.4■■■□□ 2.46
LMF1-AS1-201ENST00000567820 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.39■■■□□ 2.46
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.34■■■□□ 2.45
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CFTRP13569 1480 aa30.28■■■□□ 2.44
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PRDM2Q13029 1718 aa30.18■■■□□ 2.42
LMF1-AS1-201ENST00000567820 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.11■■■□□ 2.41
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.11■■■□□ 2.41
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ERCC6Q03468 1493 aa30.06■■■□□ 2.4
LMF1-AS1-201ENST00000567820 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30■■■□□ 2.39
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.93■■■□□ 2.38
LMF1-AS1-201ENST00000567820 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
LMF1-AS1-201ENST00000567820 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.81■■■□□ 2.36
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CUX2O14529 1486 aa29.77■■■□□ 2.36
LMF1-AS1-201ENST00000567820 WDR62O43379 1518 aa29.75■■■□□ 2.35
LMF1-AS1-201ENST00000567820 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TOPBP1Q92547 1522 aa29.6■■■□□ 2.33
LMF1-AS1-201ENST00000567820 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.6■■■□□ 2.33
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ABCC8Q09428 1581 aa29.57■■■□□ 2.32
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CUX1P39880 1505 aa29.54■■■□□ 2.32
LMF1-AS1-201ENST00000567820 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.46■■■□□ 2.31
LMF1-AS1-201ENST00000567820 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SYNJ1O43426 1573 aa29.41■■■□□ 2.3
LMF1-AS1-201ENST00000567820 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.41■■■□□ 2.3
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TOP2BQ02880 1626 aa29.38■■■□□ 2.29
LMF1-AS1-201ENST00000567820 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
LMF1-AS1-201ENST00000567820 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.34■■■□□ 2.29
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
LMF1-AS1-201ENST00000567820 IFT140Q96RY7 1462 aa29.28■■■□□ 2.28
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.22■■■□□ 2.27
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SOGA1O94964 1423 aa29.2■■■□□ 2.27
LMF1-AS1-201ENST00000567820 WDR97A6NE52 1622 aa29.18■■■□□ 2.26
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.09■■■□□ 2.25
LMF1-AS1-201ENST00000567820 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
LMF1-AS1-201ENST00000567820 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.99■■■□□ 2.23
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TRIM41Q8WV44 630 aa28.92■■■□□ 2.22
LMF1-AS1-201ENST00000567820 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.9■■■□□ 2.22
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PBRM1Q86U86 1689 aa28.89■■■□□ 2.21
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.88■■■□□ 2.21
LMF1-AS1-201ENST00000567820 GRIN2BQ13224 1484 aa28.84■■■□□ 2.21
LMF1-AS1-201ENST00000567820 KIF27Q86VH2 1401 aa28.77■■■□□ 2.2
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.75■■■□□ 2.19
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.75■■■□□ 2.19
LMF1-AS1-201ENST00000567820 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.69■■■□□ 2.18
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CHD1O14646 1710 aa28.66■■■□□ 2.18
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ADAMTS12P58397 1594 aa28.66■■■□□ 2.18
LMF1-AS1-201ENST00000567820 IGF1RP08069 1367 aa28.63■■■□□ 2.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SYNJ2O15056 1496 aa28.61■■■□□ 2.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CUL7Q14999 1698 aa28.58■■■□□ 2.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.57■■■□□ 2.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 GRIN2AQ12879 1464 aa28.48■■■□□ 2.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 EEA1Q15075 1411 aa28.47■■■□□ 2.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 FBLN2P98095 1184 aa28.47■■■□□ 2.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.44■■■□□ 2.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 OSCARQ8IYS5 282 aa28.43■■■□□ 2.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PRXQ9BXM0 1461 aa28.37■■■□□ 2.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CEP170Q5SW79 1584 aa28.37■■■□□ 2.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NUP160Q12769 1436 aa28.36■■■□□ 2.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.35■■■□□ 2.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.34■■■□□ 2.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.34■■■□□ 2.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.25■■■□□ 2.11
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.25■■■□□ 2.11
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