RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565426.1

RPL3L-202, Transcript of ribosomal protein L3 like, humanhuman

TSL 4

Gene RPL3L, Length 575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3L-202ENST00000565426 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.7■■■■□ 3.63
RPL3L-202ENST00000565426 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.65■■■□□ 2.98
RPL3L-202ENST00000565426 ABCC9O60706 1549 aa33.45■■■□□ 2.95
RPL3L-202ENST00000565426 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.04■■■□□ 2.72
RPL3L-202ENST00000565426 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.97■■■□□ 2.71
RPL3L-202ENST00000565426 NACADO15069 1562 aa31.8■■■□□ 2.68
RPL3L-202ENST00000565426 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.39■■■□□ 2.61
RPL3L-202ENST00000565426 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
RPL3L-202ENST00000565426 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
RPL3L-202ENST00000565426 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.12■■■□□ 2.57
RPL3L-202ENST00000565426 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.11■■■□□ 2.57
RPL3L-202ENST00000565426 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.03■■■□□ 2.56
RPL3L-202ENST00000565426 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.88■■■□□ 2.53
RPL3L-202ENST00000565426 SCRIBQ14160 1630 aa30.76■■■□□ 2.51
RPL3L-202ENST00000565426 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.56■■■□□ 2.48
RPL3L-202ENST00000565426 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.18■■■□□ 2.42
RPL3L-202ENST00000565426 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
RPL3L-202ENST00000565426 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.09■■■□□ 2.41
RPL3L-202ENST00000565426 NCAPD3P42695 1498 aa29.33■■■□□ 2.29
RPL3L-202ENST00000565426 SMARCA4P51532 1647 aa29.32■■■□□ 2.28
RPL3L-202ENST00000565426 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.29■■■□□ 2.28
RPL3L-202ENST00000565426 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
RPL3L-202ENST00000565426 SMARCA2P51531 1590 aa29.27■■■□□ 2.28
RPL3L-202ENST00000565426 HMGXB3Q12766 1538 aa29.11■■■□□ 2.25
RPL3L-202ENST00000565426 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
RPL3L-202ENST00000565426 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.04■■■□□ 2.24
RPL3L-202ENST00000565426 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.97■■■□□ 2.23
RPL3L-202ENST00000565426 ERCC6Q03468 1493 aa28.96■■■□□ 2.23
RPL3L-202ENST00000565426 NESP48681 1621 aa28.77■■■□□ 2.2
RPL3L-202ENST00000565426 WIZO95785 1651 aa28.73■■■□□ 2.19
RPL3L-202ENST00000565426 CUX2O14529 1486 aa28.66■■■□□ 2.18
RPL3L-202ENST00000565426 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.65■■■□□ 2.18
RPL3L-202ENST00000565426 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
RPL3L-202ENST00000565426 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.56■■■□□ 2.16
RPL3L-202ENST00000565426 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.52■■■□□ 2.16
RPL3L-202ENST00000565426 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.39■■■□□ 2.14
RPL3L-202ENST00000565426 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
RPL3L-202ENST00000565426 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.35■■■□□ 2.13
RPL3L-202ENST00000565426 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
RPL3L-202ENST00000565426 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.21■■■□□ 2.11
RPL3L-202ENST00000565426 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.21■■■□□ 2.11
RPL3L-202ENST00000565426 CFTRP13569 1480 aa28.2■■■□□ 2.1
RPL3L-202ENST00000565426 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.19■■■□□ 2.1
RPL3L-202ENST00000565426 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.09■■■□□ 2.09
RPL3L-202ENST00000565426 WDR62O43379 1518 aa28.07■■■□□ 2.08
RPL3L-202ENST00000565426 PRDM2Q13029 1718 aa27.92■■■□□ 2.06
RPL3L-202ENST00000565426 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
RPL3L-202ENST00000565426 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
RPL3L-202ENST00000565426 ABCC8Q09428 1581 aa27.71■■■□□ 2.03
RPL3L-202ENST00000565426 TOPBP1Q92547 1522 aa27.65■■■□□ 2.02
RPL3L-202ENST00000565426 IFT140Q96RY7 1462 aa27.62■■■□□ 2.01
RPL3L-202ENST00000565426 OSCARQ8IYS5 282 aa27.59■■■□□ 2.01
RPL3L-202ENST00000565426 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.57■■■□□ 2
RPL3L-202ENST00000565426 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
RPL3L-202ENST00000565426 TRIM41Q8WV44 630 aa27.39■■□□□ 1.98
RPL3L-202ENST00000565426 SOGA1O94964 1423 aa27.38■■□□□ 1.97
RPL3L-202ENST00000565426 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
RPL3L-202ENST00000565426 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
RPL3L-202ENST00000565426 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
RPL3L-202ENST00000565426 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
RPL3L-202ENST00000565426 FBLN2P98095 1184 aa27.31■■□□□ 1.96
RPL3L-202ENST00000565426 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.31■■□□□ 1.96
RPL3L-202ENST00000565426 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.28■■□□□ 1.96
RPL3L-202ENST00000565426 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
RPL3L-202ENST00000565426 CUX1P39880 1505 aa27.26■■□□□ 1.95
RPL3L-202ENST00000565426 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
RPL3L-202ENST00000565426 WDR97A6NE52 1622 aa27.11■■□□□ 1.93
RPL3L-202ENST00000565426 CHD1O14646 1710 aa27.09■■□□□ 1.93
RPL3L-202ENST00000565426 GRIN2BQ13224 1484 aa27.06■■□□□ 1.92
RPL3L-202ENST00000565426 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.05■■□□□ 1.92
RPL3L-202ENST00000565426 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
RPL3L-202ENST00000565426 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.01■■□□□ 1.91
RPL3L-202ENST00000565426 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27■■□□□ 1.91
RPL3L-202ENST00000565426 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27■■□□□ 1.91
RPL3L-202ENST00000565426 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27■■□□□ 1.91
RPL3L-202ENST00000565426 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
RPL3L-202ENST00000565426 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.96■■□□□ 1.91
RPL3L-202ENST00000565426 ARHGEF11O15085 1522 aa26.95■■□□□ 1.91
RPL3L-202ENST00000565426 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.93■■□□□ 1.9
RPL3L-202ENST00000565426 TOP2BQ02880 1626 aa26.93■■□□□ 1.9
RPL3L-202ENST00000565426 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.93■■□□□ 1.9
RPL3L-202ENST00000565426 SYNJ2O15056 1496 aa26.91■■□□□ 1.9
RPL3L-202ENST00000565426 PBRM1Q86U86 1689 aa26.91■■□□□ 1.9
RPL3L-202ENST00000565426 SYNJ1O43426 1573 aa26.89■■□□□ 1.9
RPL3L-202ENST00000565426 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.83■■□□□ 1.89
RPL3L-202ENST00000565426 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.73■■□□□ 1.87
RPL3L-202ENST00000565426 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.68■■□□□ 1.86
RPL3L-202ENST00000565426 ARAP1Q96P48 1450 aa26.68■■□□□ 1.86
RPL3L-202ENST00000565426 GRIN2AQ12879 1464 aa26.67■■□□□ 1.86
RPL3L-202ENST00000565426 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.65■■□□□ 1.86
RPL3L-202ENST00000565426 ADAMTS12P58397 1594 aa26.63■■□□□ 1.85
RPL3L-202ENST00000565426 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
RPL3L-202ENST00000565426 KIF27Q86VH2 1401 aa26.54■■□□□ 1.84
RPL3L-202ENST00000565426 NUP160Q12769 1436 aa26.52■■□□□ 1.84
RPL3L-202ENST00000565426 CEP170Q5SW79 1584 aa26.51■■□□□ 1.83
RPL3L-202ENST00000565426 JPH4Q96JJ6 628 aa26.43■■□□□ 1.82
RPL3L-202ENST00000565426 IGF1RP08069 1367 aa26.43■■□□□ 1.82
RPL3L-202ENST00000565426 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
RPL3L-202ENST00000565426 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.35■■□□□ 1.81
RPL3L-202ENST00000565426 CUL7Q14999 1698 aa26.34■■□□□ 1.81
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