RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564848.1

C15orf39-205, Transcript of chromosome 15 open reading frame 39, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene C15orf39, Length 353 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39-205ENST00000564848 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.76■■■■■ 6.36
C15orf39-205ENST00000564848 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.67■■■■■ 5.38
C15orf39-205ENST00000564848 ABCC9O60706 1549 aa47.36■■■■■ 5.17
C15orf39-205ENST00000564848 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.71■■■■■ 4.91
C15orf39-205ENST00000564848 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.7■■■■■ 4.91
C15orf39-205ENST00000564848 NACADO15069 1562 aa45.7■■■■■ 4.91
C15orf39-205ENST00000564848 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
C15orf39-205ENST00000564848 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.47■■■■■ 4.87
C15orf39-205ENST00000564848 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.35■■■■■ 4.85
C15orf39-205ENST00000564848 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.64■■■■■ 4.74
C15orf39-205ENST00000564848 SCRIBQ14160 1630 aa44.38■■■■■ 4.69
C15orf39-205ENST00000564848 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.26■■■■■ 4.68
C15orf39-205ENST00000564848 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.23■■■■■ 4.67
C15orf39-205ENST00000564848 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.89■■■■■ 4.62
C15orf39-205ENST00000564848 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.19■■■■■ 4.5
C15orf39-205ENST00000564848 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
C15orf39-205ENST00000564848 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.87■■■■■ 4.45
C15orf39-205ENST00000564848 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.58■■■■■ 4.41
C15orf39-205ENST00000564848 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
C15orf39-205ENST00000564848 SMARCA4P51532 1647 aa42.47■■■■■ 4.39
C15orf39-205ENST00000564848 SMARCA2P51531 1590 aa42.18■■■■■ 4.34
C15orf39-205ENST00000564848 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.18■■■■■ 4.34
C15orf39-205ENST00000564848 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.16■■■■■ 4.34
C15orf39-205ENST00000564848 NCAPD3P42695 1498 aa42.11■■■■■ 4.33
C15orf39-205ENST00000564848 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.04■■■■■ 4.32
C15orf39-205ENST00000564848 HMGXB3Q12766 1538 aa41.96■■■■■ 4.31
C15orf39-205ENST00000564848 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
C15orf39-205ENST00000564848 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
C15orf39-205ENST00000564848 WIZO95785 1651 aa41.76■■■■■ 4.28
C15orf39-205ENST00000564848 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
C15orf39-205ENST00000564848 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.03■■■■■ 4.16
C15orf39-205ENST00000564848 NESP48681 1621 aa41.01■■■■■ 4.16
C15orf39-205ENST00000564848 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.91■■■■■ 4.14
C15orf39-205ENST00000564848 ERCC6Q03468 1493 aa40.89■■■■■ 4.14
C15orf39-205ENST00000564848 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
C15orf39-205ENST00000564848 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.83■■■■■ 4.13
C15orf39-205ENST00000564848 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.75■■■■■ 4.11
C15orf39-205ENST00000564848 CFTRP13569 1480 aa40.7■■■■■ 4.11
C15orf39-205ENST00000564848 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.59■■■■■ 4.09
C15orf39-205ENST00000564848 PRDM2Q13029 1718 aa40.49■■■■■ 4.07
C15orf39-205ENST00000564848 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.45■■■■■ 4.07
C15orf39-205ENST00000564848 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.41■■■■■ 4.06
C15orf39-205ENST00000564848 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
C15orf39-205ENST00000564848 CUX2O14529 1486 aa40.36■■■■■ 4.05
C15orf39-205ENST00000564848 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.3■■■■■ 4.04
C15orf39-205ENST00000564848 WDR62O43379 1518 aa40.15■■■■■ 4.02
C15orf39-205ENST00000564848 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
C15orf39-205ENST00000564848 ABCC8Q09428 1581 aa39.89■■■■□ 3.98
C15orf39-205ENST00000564848 TOPBP1Q92547 1522 aa39.82■■■■□ 3.97
C15orf39-205ENST00000564848 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.82■■■■□ 3.97
C15orf39-205ENST00000564848 CUX1P39880 1505 aa39.56■■■■□ 3.92
C15orf39-205ENST00000564848 IFT140Q96RY7 1462 aa39.56■■■■□ 3.92
C15orf39-205ENST00000564848 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
C15orf39-205ENST00000564848 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.43■■■■□ 3.9
C15orf39-205ENST00000564848 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.42■■■■□ 3.9
C15orf39-205ENST00000564848 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
C15orf39-205ENST00000564848 SOGA1O94964 1423 aa39.34■■■■□ 3.89
C15orf39-205ENST00000564848 TOP2BQ02880 1626 aa39.32■■■■□ 3.88
C15orf39-205ENST00000564848 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.32■■■■□ 3.88
C15orf39-205ENST00000564848 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.29■■■■□ 3.88
C15orf39-205ENST00000564848 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
C15orf39-205ENST00000564848 SYNJ1O43426 1573 aa39.29■■■■□ 3.88
C15orf39-205ENST00000564848 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
C15orf39-205ENST00000564848 WDR97A6NE52 1622 aa39.14■■■■□ 3.86
C15orf39-205ENST00000564848 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.1■■■■□ 3.857e-6■□□□□ 9.8
C15orf39-205ENST00000564848 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
C15orf39-205ENST00000564848 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.06■■■■□ 3.84
C15orf39-205ENST00000564848 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.91■■■■□ 3.82
C15orf39-205ENST00000564848 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.89■■■■□ 3.82
C15orf39-205ENST00000564848 GRIN2BQ13224 1484 aa38.88■■■■□ 3.81
C15orf39-205ENST00000564848 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.84■■■■□ 3.81
C15orf39-205ENST00000564848 PBRM1Q86U86 1689 aa38.84■■■■□ 3.81
C15orf39-205ENST00000564848 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.78■■■■□ 3.8
C15orf39-205ENST00000564848 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
C15orf39-205ENST00000564848 OSCARQ8IYS5 282 aa38.72■■■■□ 3.79
C15orf39-205ENST00000564848 CHD1O14646 1710 aa38.68■■■■□ 3.78
C15orf39-205ENST00000564848 FBLN2P98095 1184 aa38.66■■■■□ 3.78
C15orf39-205ENST00000564848 TRIM41Q8WV44 630 aa38.64■■■■□ 3.78
C15orf39-205ENST00000564848 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.62■■■■□ 3.77
C15orf39-205ENST00000564848 KIF27Q86VH2 1401 aa38.61■■■■□ 3.77
C15orf39-205ENST00000564848 SYNJ2O15056 1496 aa38.6■■■■□ 3.77
C15orf39-205ENST00000564848 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
C15orf39-205ENST00000564848 ADAMTS12P58397 1594 aa38.52■■■■□ 3.76
C15orf39-205ENST00000564848 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.46■■■■□ 3.75
C15orf39-205ENST00000564848 GRIN2AQ12879 1464 aa38.36■■■■□ 3.73
C15orf39-205ENST00000564848 IGF1RP08069 1367 aa38.36■■■■□ 3.73
C15orf39-205ENST00000564848 CUL7Q14999 1698 aa38.34■■■■□ 3.73
C15orf39-205ENST00000564848 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.23■■■■□ 3.71
C15orf39-205ENST00000564848 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.23■■■■□ 3.71
C15orf39-205ENST00000564848 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.21■■■■□ 3.71
C15orf39-205ENST00000564848 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.18■■■■□ 3.7
C15orf39-205ENST00000564848 NUP160Q12769 1436 aa38.17■■■■□ 3.7
C15orf39-205ENST00000564848 CEP170Q5SW79 1584 aa38.14■■■■□ 3.7
C15orf39-205ENST00000564848 ARHGEF11O15085 1522 aa38.07■■■■□ 3.68
C15orf39-205ENST00000564848 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.06■■■■□ 3.68
C15orf39-205ENST00000564848 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.06■■■■□ 3.68
C15orf39-205ENST00000564848 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.06■■■■□ 3.68
C15orf39-205ENST00000564848 EEA1Q15075 1411 aa38.02■■■■□ 3.68
C15orf39-205ENST00000564848 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.99■■■■□ 3.67
C15orf39-205ENST00000564848 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.9■■■■□ 3.66
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