RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561327.5

MIR9-3HG-212, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 3

Gene MIR9-3HG, Length 957 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-212ENST00000561327 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.56■■■■■ 5.04
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.29■■■■■ 4.2
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ABCC9O60706 1549 aa39.86■■■■□ 3.97
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
MIR9-3HG-212ENST00000561327 NACADO15069 1562 aa38.62■■■■□ 3.77
MIR9-3HG-212ENST00000561327 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.58■■■■□ 3.77
MIR9-3HG-212ENST00000561327 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.58■■■■□ 3.77
MIR9-3HG-212ENST00000561327 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.55■■■■□ 3.76
MIR9-3HG-212ENST00000561327 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.53■■■■□ 3.76
MIR9-3HG-212ENST00000561327 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.76■■■■□ 3.64
MIR9-3HG-212ENST00000561327 SCRIBQ14160 1630 aa37.71■■■■□ 3.63
MIR9-3HG-212ENST00000561327 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.38■■■■□ 3.58
MIR9-3HG-212ENST00000561327 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.23■■■■□ 3.55
MIR9-3HG-212ENST00000561327 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.06■■■■□ 3.52
MIR9-3HG-212ENST00000561327 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.56■■■■□ 3.44
MIR9-3HG-212ENST00000561327 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.19■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.11■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-212ENST00000561327 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-212ENST00000561327 SMARCA4P51532 1647 aa36.08■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-212ENST00000561327 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.89■■■■□ 3.34
MIR9-3HG-212ENST00000561327 SMARCA2P51531 1590 aa35.73■■■■□ 3.31
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.71■■■■□ 3.31
MIR9-3HG-212ENST00000561327 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.7■■■■□ 3.31
MIR9-3HG-212ENST00000561327 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
MIR9-3HG-212ENST00000561327 NCAPD3P42695 1498 aa35.58■■■■□ 3.29
MIR9-3HG-212ENST00000561327 WIZO95785 1651 aa35.56■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-212ENST00000561327 HMGXB3Q12766 1538 aa35.55■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-212ENST00000561327 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
MIR9-3HG-212ENST00000561327 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-212ENST00000561327 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.73■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-212ENST00000561327 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.64■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-212ENST00000561327 NESP48681 1621 aa34.63■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.56■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CFTRP13569 1480 aa34.49■■■■□ 3.11
MIR9-3HG-212ENST00000561327 PRDM2Q13029 1718 aa34.41■■■■□ 3.1
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ERCC6Q03468 1493 aa34.34■■■■□ 3.09
MIR9-3HG-212ENST00000561327 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.33■■■■□ 3.09
MIR9-3HG-212ENST00000561327 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.32■■■■□ 3.08
MIR9-3HG-212ENST00000561327 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.22■■■■□ 3.07
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.18■■■■□ 3.06
MIR9-3HG-212ENST00000561327 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
MIR9-3HG-212ENST00000561327 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.01■■■■□ 3.04
MIR9-3HG-212ENST00000561327 WDR62O43379 1518 aa33.9■■■■□ 3.02
MIR9-3HG-212ENST00000561327 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CUX2O14529 1486 aa33.82■■■■□ 3
MIR9-3HG-212ENST00000561327 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.78■■■■□ 3
MIR9-3HG-212ENST00000561327 TOPBP1Q92547 1522 aa33.74■■■□□ 2.99
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ABCC8Q09428 1581 aa33.72■■■□□ 2.99
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CUX1P39880 1505 aa33.68■■■□□ 2.98
MIR9-3HG-212ENST00000561327 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.61■■■□□ 2.97
MIR9-3HG-212ENST00000561327 SYNJ1O43426 1573 aa33.55■■■□□ 2.96
MIR9-3HG-212ENST00000561327 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.54■■■□□ 2.96
MIR9-3HG-212ENST00000561327 TOP2BQ02880 1626 aa33.52■■■□□ 2.96
MIR9-3HG-212ENST00000561327 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
MIR9-3HG-212ENST00000561327 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.49■■■□□ 2.95
MIR9-3HG-212ENST00000561327 IFT140Q96RY7 1462 aa33.4■■■□□ 2.94
MIR9-3HG-212ENST00000561327 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
MIR9-3HG-212ENST00000561327 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.31■■■□□ 2.92
MIR9-3HG-212ENST00000561327 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.3■■■□□ 2.92
MIR9-3HG-212ENST00000561327 SOGA1O94964 1423 aa33.28■■■□□ 2.92
MIR9-3HG-212ENST00000561327 WDR97A6NE52 1622 aa33.27■■■□□ 2.92
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
MIR9-3HG-212ENST00000561327 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.17■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.06■■■□□ 2.88
MIR9-3HG-212ENST00000561327 TRIM41Q8WV44 630 aa33.04■■■□□ 2.88
MIR9-3HG-212ENST00000561327 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
MIR9-3HG-212ENST00000561327 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.04■■■□□ 2.88
MIR9-3HG-212ENST00000561327 PBRM1Q86U86 1689 aa32.97■■■□□ 2.87
MIR9-3HG-212ENST00000561327 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.96■■■□□ 2.87
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.93■■■□□ 2.86
MIR9-3HG-212ENST00000561327 GRIN2BQ13224 1484 aa32.9■■■□□ 2.86
MIR9-3HG-212ENST00000561327 KIF27Q86VH2 1401 aa32.85■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-212ENST00000561327 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.83■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.79■■■□□ 2.84
MIR9-3HG-212ENST00000561327 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
MIR9-3HG-212ENST00000561327 ADAMTS12P58397 1594 aa32.73■■■□□ 2.83
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CHD1O14646 1710 aa32.68■■■□□ 2.82
MIR9-3HG-212ENST00000561327 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.67■■■□□ 2.82
MIR9-3HG-212ENST00000561327 SYNJ2O15056 1496 aa32.64■■■□□ 2.82
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CUL7Q14999 1698 aa32.64■■■□□ 2.82
MIR9-3HG-212ENST00000561327 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.59■■■□□ 2.81
MIR9-3HG-212ENST00000561327 IGF1RP08069 1367 aa32.58■■■□□ 2.81
MIR9-3HG-212ENST00000561327 EEA1Q15075 1411 aa32.54■■■□□ 2.8
MIR9-3HG-212ENST00000561327 FBLN2P98095 1184 aa32.52■■■□□ 2.8
MIR9-3HG-212ENST00000561327 GRIN2AQ12879 1464 aa32.5■■■□□ 2.79
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.44■■■□□ 2.78
MIR9-3HG-212ENST00000561327 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
MIR9-3HG-212ENST00000561327 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.35■■■□□ 2.77
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CEP170Q5SW79 1584 aa32.34■■■□□ 2.77
MIR9-3HG-212ENST00000561327 OSCARQ8IYS5 282 aa32.34■■■□□ 2.77
MIR9-3HG-212ENST00000561327 PRXQ9BXM0 1461 aa32.34■■■□□ 2.77
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.32■■■□□ 2.76
MIR9-3HG-212ENST00000561327 NUP160Q12769 1436 aa32.32■■■□□ 2.76
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.3■■■□□ 2.76
MIR9-3HG-212ENST00000561327 KIF21BO75037 1637 aa32.24■■■□□ 2.75
MIR9-3HG-212ENST00000561327 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.13■■■□□ 2.73
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