RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560253.1

MEIS3-208, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,060 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-208ENST00000560253 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.22■■■■□ 3.39
MEIS3-208ENST00000560253 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.27■■■□□ 2.76
MEIS3-208ENST00000560253 ABCC9O60706 1549 aa32.1■■■□□ 2.73
MEIS3-208ENST00000560253 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.19■■■□□ 2.58
MEIS3-208ENST00000560253 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.57■■■□□ 2.48
MEIS3-208ENST00000560253 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.56■■■□□ 2.48
MEIS3-208ENST00000560253 NACADO15069 1562 aa30.46■■■□□ 2.47
MEIS3-208ENST00000560253 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.19■■■□□ 2.42
MEIS3-208ENST00000560253 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-208ENST00000560253 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.96■■■□□ 2.39
MEIS3-208ENST00000560253 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.35
MEIS3-208ENST00000560253 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.68■■■□□ 2.34
MEIS3-208ENST00000560253 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-208ENST00000560253 SCRIBQ14160 1630 aa29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-208ENST00000560253 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.37■■■□□ 2.29
MEIS3-208ENST00000560253 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.31■■■□□ 2.28
MEIS3-208ENST00000560253 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.03■■■□□ 2.24
MEIS3-208ENST00000560253 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.98■■■□□ 2.23
MEIS3-208ENST00000560253 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
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MEIS3-208ENST00000560253 SMARCA4P51532 1647 aa28.12■■■□□ 2.09
MEIS3-208ENST00000560253 CUX2O14529 1486 aa28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-208ENST00000560253 NCAPD3P42695 1498 aa28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-208ENST00000560253 SMARCA2P51531 1590 aa28.07■■■□□ 2.08
MEIS3-208ENST00000560253 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.06■■■□□ 2.08
MEIS3-208ENST00000560253 HMGXB3Q12766 1538 aa27.91■■■□□ 2.06
MEIS3-208ENST00000560253 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.87■■■□□ 2.05
MEIS3-208ENST00000560253 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
MEIS3-208ENST00000560253 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.84■■■□□ 2.05
MEIS3-208ENST00000560253 ERCC6Q03468 1493 aa27.73■■■□□ 2.03
MEIS3-208ENST00000560253 WIZO95785 1651 aa27.55■■■□□ 2
MEIS3-208ENST00000560253 TRIM41Q8WV44 630 aa27.54■■■□□ 2
MEIS3-208ENST00000560253 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
MEIS3-208ENST00000560253 NESP48681 1621 aa27.41■■□□□ 1.98
MEIS3-208ENST00000560253 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.39■■□□□ 1.98
MEIS3-208ENST00000560253 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.31■■□□□ 1.96
MEIS3-208ENST00000560253 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.31■■□□□ 1.96
MEIS3-208ENST00000560253 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
MEIS3-208ENST00000560253 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
MEIS3-208ENST00000560253 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-208ENST00000560253 CFTRP13569 1480 aa27.05■■□□□ 1.92
MEIS3-208ENST00000560253 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.98■■□□□ 1.91
MEIS3-208ENST00000560253 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.97■■□□□ 1.91
MEIS3-208ENST00000560253 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.97■■□□□ 1.91
MEIS3-208ENST00000560253 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.95■■□□□ 1.91
MEIS3-208ENST00000560253 WDR62O43379 1518 aa26.81■■□□□ 1.88
MEIS3-208ENST00000560253 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
MEIS3-208ENST00000560253 PRDM2Q13029 1718 aa26.76■■□□□ 1.87
MEIS3-208ENST00000560253 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
MEIS3-208ENST00000560253 OSCARQ8IYS5 282 aa26.63■■□□□ 1.85
MEIS3-208ENST00000560253 ABCC8Q09428 1581 aa26.59■■□□□ 1.85
MEIS3-208ENST00000560253 TOPBP1Q92547 1522 aa26.48■■□□□ 1.83
MEIS3-208ENST00000560253 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.44■■□□□ 1.82
MEIS3-208ENST00000560253 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.44■■□□□ 1.82
MEIS3-208ENST00000560253 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.44■■□□□ 1.82
MEIS3-208ENST00000560253 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.43■■□□□ 1.82
MEIS3-208ENST00000560253 IFT140Q96RY7 1462 aa26.42■■□□□ 1.82
MEIS3-208ENST00000560253 ARHGEF11O15085 1522 aa26.24■■□□□ 1.79
MEIS3-208ENST00000560253 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
MEIS3-208ENST00000560253 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
MEIS3-208ENST00000560253 SOGA1O94964 1423 aa26.22■■□□□ 1.79
MEIS3-208ENST00000560253 CUX1P39880 1505 aa26.15■■□□□ 1.78
MEIS3-208ENST00000560253 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
MEIS3-208ENST00000560253 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.15■■□□□ 1.78
MEIS3-208ENST00000560253 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.12■■□□□ 1.77
MEIS3-208ENST00000560253 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
MEIS3-208ENST00000560253 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
MEIS3-208ENST00000560253 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.09■■□□□ 1.77
MEIS3-208ENST00000560253 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
MEIS3-208ENST00000560253 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
MEIS3-208ENST00000560253 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
MEIS3-208ENST00000560253 WDR97A6NE52 1622 aa26.03■■□□□ 1.76
MEIS3-208ENST00000560253 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
MEIS3-208ENST00000560253 FBLN2P98095 1184 aa26■■□□□ 1.75
MEIS3-208ENST00000560253 ARAP1Q96P48 1450 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-208ENST00000560253 GRIN2BQ13224 1484 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-208ENST00000560253 TOP2BQ02880 1626 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-208ENST00000560253 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-208ENST00000560253 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.89■■□□□ 1.74
MEIS3-208ENST00000560253 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-208ENST00000560253 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-208ENST00000560253 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
MEIS3-208ENST00000560253 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.85■■□□□ 1.73
MEIS3-208ENST00000560253 SYNJ1O43426 1573 aa25.83■■□□□ 1.73
MEIS3-208ENST00000560253 CHD1O14646 1710 aa25.8■■□□□ 1.72
MEIS3-208ENST00000560253 SYNJ2O15056 1496 aa25.75■■□□□ 1.71
MEIS3-208ENST00000560253 PBRM1Q86U86 1689 aa25.74■■□□□ 1.71
MEIS3-208ENST00000560253 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.74■■□□□ 1.71
MEIS3-208ENST00000560253 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.6■■□□□ 1.69
MEIS3-208ENST00000560253 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.59■■□□□ 1.69
MEIS3-208ENST00000560253 GRIN2AQ12879 1464 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-208ENST00000560253 KIF27Q86VH2 1401 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-208ENST00000560253 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-208ENST00000560253 ADAMTS12P58397 1594 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-208ENST00000560253 NUP160Q12769 1436 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-208ENST00000560253 IGF1RP08069 1367 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-208ENST00000560253 CEP170Q5SW79 1584 aa25.35■■□□□ 1.65
MEIS3-208ENST00000560253 CUL7Q14999 1698 aa25.32■■□□□ 1.64
MEIS3-208ENST00000560253 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.3■■□□□ 1.64
MEIS3-208ENST00000560253 JPH4Q96JJ6 628 aa25.28■■□□□ 1.64
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