RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558834.1

C15orf59-202, Transcript of UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf59, Length 598 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59-202ENST00000558834 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.43■■■□□ 2.3
C15orf59-202ENST00000558834 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.88■■□□□ 1.73
C15orf59-202ENST00000558834 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
C15orf59-202ENST00000558834 ABCC9O60706 1549 aa24.61■■□□□ 1.53
C15orf59-202ENST00000558834 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.39■■□□□ 1.49
C15orf59-202ENST00000558834 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.19■■□□□ 1.46
C15orf59-202ENST00000558834 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.13■■□□□ 1.45
C15orf59-202ENST00000558834 NACADO15069 1562 aa24.08■■□□□ 1.45
C15orf59-202ENST00000558834 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.92■■□□□ 1.42
C15orf59-202ENST00000558834 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.7■■□□□ 1.38
C15orf59-202ENST00000558834 SCRIBQ14160 1630 aa23.67■■□□□ 1.38
C15orf59-202ENST00000558834 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.53■■□□□ 1.36
C15orf59-202ENST00000558834 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.24■■□□□ 1.31
C15orf59-202ENST00000558834 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.22■■□□□ 1.31
C15orf59-202ENST00000558834 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
C15orf59-202ENST00000558834 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.85■■□□□ 1.25
C15orf59-202ENST00000558834 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
C15orf59-202ENST00000558834 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.72■■□□□ 1.23
C15orf59-202ENST00000558834 SMARCA4P51532 1647 aa22.71■■□□□ 1.23
C15orf59-202ENST00000558834 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
C15orf59-202ENST00000558834 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
C15orf59-202ENST00000558834 WIZO95785 1651 aa22.55■■□□□ 1.2
C15orf59-202ENST00000558834 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
C15orf59-202ENST00000558834 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.47■■□□□ 1.19
C15orf59-202ENST00000558834 SMARCA2P51531 1590 aa22.35■■□□□ 1.17
C15orf59-202ENST00000558834 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.34■■□□□ 1.17
C15orf59-202ENST00000558834 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
C15orf59-202ENST00000558834 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.24■■□□□ 1.15
C15orf59-202ENST00000558834 HMGXB3Q12766 1538 aa22.21■■□□□ 1.15
C15orf59-202ENST00000558834 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
C15orf59-202ENST00000558834 NCAPD3P42695 1498 aa22.18■■□□□ 1.14
C15orf59-202ENST00000558834 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.03■■□□□ 1.12
C15orf59-202ENST00000558834 PRDM2Q13029 1718 aa21.66■■□□□ 1.06
C15orf59-202ENST00000558834 CFTRP13569 1480 aa21.64■■□□□ 1.05
C15orf59-202ENST00000558834 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.61■■□□□ 1.05
C15orf59-202ENST00000558834 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.56■■□□□ 1.04
C15orf59-202ENST00000558834 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.51■■□□□ 1.03
C15orf59-202ENST00000558834 ABCC8Q09428 1581 aa21.5■■□□□ 1.03
C15orf59-202ENST00000558834 NESP48681 1621 aa21.47■■□□□ 1.03
C15orf59-202ENST00000558834 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
C15orf59-202ENST00000558834 SYNJ1O43426 1573 aa21.36■■□□□ 1.01
C15orf59-202ENST00000558834 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.35■■□□□ 1.01
C15orf59-202ENST00000558834 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.32■■□□□ 1
C15orf59-202ENST00000558834 TRIM41Q8WV44 630 aa21.31■■□□□ 1
C15orf59-202ENST00000558834 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.31■■□□□ 1
C15orf59-202ENST00000558834 TOP2BQ02880 1626 aa21.29■■□□□ 1
C15orf59-202ENST00000558834 CUX1P39880 1505 aa21.28■■□□□ 1
C15orf59-202ENST00000558834 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.27■■□□□ 1
C15orf59-202ENST00000558834 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.25■□□□□ 0.99
C15orf59-202ENST00000558834 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.18■□□□□ 0.98
C15orf59-202ENST00000558834 ERCC6Q03468 1493 aa21.17■□□□□ 0.98
C15orf59-202ENST00000558834 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.16■□□□□ 0.98
C15orf59-202ENST00000558834 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
C15orf59-202ENST00000558834 TOPBP1Q92547 1522 aa21.12■□□□□ 0.97
C15orf59-202ENST00000558834 CUX2O14529 1486 aa21.07■□□□□ 0.96
C15orf59-202ENST00000558834 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.07■□□□□ 0.96
C15orf59-202ENST00000558834 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.05■□□□□ 0.96
C15orf59-202ENST00000558834 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
C15orf59-202ENST00000558834 WDR62O43379 1518 aa21.01■□□□□ 0.95
C15orf59-202ENST00000558834 SOGA1O94964 1423 aa21■□□□□ 0.95
C15orf59-202ENST00000558834 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
C15orf59-202ENST00000558834 EEA1Q15075 1411 aa20.95■□□□□ 0.95
C15orf59-202ENST00000558834 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.95■□□□□ 0.94
C15orf59-202ENST00000558834 WDR97A6NE52 1622 aa20.94■□□□□ 0.94
C15orf59-202ENST00000558834 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
C15orf59-202ENST00000558834 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.88■□□□□ 0.93
C15orf59-202ENST00000558834 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.88■□□□□ 0.93
C15orf59-202ENST00000558834 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
C15orf59-202ENST00000558834 KIF27Q86VH2 1401 aa20.83■□□□□ 0.93
C15orf59-202ENST00000558834 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.78■□□□□ 0.92
C15orf59-202ENST00000558834 KIF21BO75037 1637 aa20.76■□□□□ 0.91
C15orf59-202ENST00000558834 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.76■□□□□ 0.91
C15orf59-202ENST00000558834 IFT140Q96RY7 1462 aa20.75■□□□□ 0.91
C15orf59-202ENST00000558834 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.71■□□□□ 0.91
C15orf59-202ENST00000558834 PRXQ9BXM0 1461 aa20.68■□□□□ 0.9
C15orf59-202ENST00000558834 PBRM1Q86U86 1689 aa20.67■□□□□ 0.9
C15orf59-202ENST00000558834 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.66■□□□□ 0.9
C15orf59-202ENST00000558834 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.65■□□□□ 0.9
C15orf59-202ENST00000558834 GOLGA3Q08378 1498 aa20.65■□□□□ 0.9
C15orf59-202ENST00000558834 IGF1RP08069 1367 aa20.65■□□□□ 0.9
C15orf59-202ENST00000558834 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
C15orf59-202ENST00000558834 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
C15orf59-202ENST00000558834 CUL7Q14999 1698 aa20.64■□□□□ 0.89
C15orf59-202ENST00000558834 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
C15orf59-202ENST00000558834 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.62■□□□□ 0.89
C15orf59-202ENST00000558834 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
C15orf59-202ENST00000558834 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.56■□□□□ 0.88
C15orf59-202ENST00000558834 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.55■□□□□ 0.88
C15orf59-202ENST00000558834 GRIN2BQ13224 1484 aa20.55■□□□□ 0.88
C15orf59-202ENST00000558834 ADAMTS12P58397 1594 aa20.52■□□□□ 0.88
C15orf59-202ENST00000558834 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.51■□□□□ 0.87
C15orf59-202ENST00000558834 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.44■□□□□ 0.86
C15orf59-202ENST00000558834 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.44■□□□□ 0.86
C15orf59-202ENST00000558834 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
C15orf59-202ENST00000558834 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
C15orf59-202ENST00000558834 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.41■□□□□ 0.86
C15orf59-202ENST00000558834 CEP162Q5TB80 1403 aa20.39■□□□□ 0.85
C15orf59-202ENST00000558834 OSCARQ8IYS5 282 aa20.38■□□□□ 0.85
C15orf59-202ENST00000558834 SYNJ2O15056 1496 aa20.33■□□□□ 0.85
C15orf59-202ENST00000558834 GRIN2AQ12879 1464 aa20.3■□□□□ 0.84
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