RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557700.1

IFI27-203, Transcript of interferon alpha inducible protein 27, humanhuman

TSL 2

Gene IFI27, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27-203ENST00000557700 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.34■■■■■ 6.93
IFI27-203ENST00000557700 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.81■■■■■ 5.88
IFI27-203ENST00000557700 ABCC9O60706 1549 aa50.54■■■■■ 5.68
IFI27-203ENST00000557700 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.73■■■■■ 5.39
IFI27-203ENST00000557700 NACADO15069 1562 aa48.73■■■■■ 5.39
IFI27-203ENST00000557700 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.67■■■■■ 5.38
IFI27-203ENST00000557700 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.38
IFI27-203ENST00000557700 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.53■■■■■ 5.36
IFI27-203ENST00000557700 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.34■■■■■ 5.33
IFI27-203ENST00000557700 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.44■■■■■ 5.19
IFI27-203ENST00000557700 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.25■■■■■ 5.15
IFI27-203ENST00000557700 SCRIBQ14160 1630 aa47.22■■■■■ 5.15
IFI27-203ENST00000557700 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.19■■■■■ 5.14
IFI27-203ENST00000557700 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.87■■■■■ 5.09
IFI27-203ENST00000557700 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.26■■■■■ 5
IFI27-203ENST00000557700 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
IFI27-203ENST00000557700 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.72■■■■■ 4.91
IFI27-203ENST00000557700 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.45■■■■■ 4.87
IFI27-203ENST00000557700 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.24■■■■■ 4.83
IFI27-203ENST00000557700 SMARCA4P51532 1647 aa45.22■■■■■ 4.83
IFI27-203ENST00000557700 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.98■■■■■ 4.79
IFI27-203ENST00000557700 NCAPD3P42695 1498 aa44.98■■■■■ 4.79
IFI27-203ENST00000557700 SMARCA2P51531 1590 aa44.96■■■■■ 4.79
IFI27-203ENST00000557700 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.92■■■■■ 4.78
IFI27-203ENST00000557700 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.82■■■■■ 4.77
IFI27-203ENST00000557700 HMGXB3Q12766 1538 aa44.75■■■■■ 4.75
IFI27-203ENST00000557700 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
IFI27-203ENST00000557700 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
IFI27-203ENST00000557700 WIZO95785 1651 aa44.39■■■■■ 4.7
IFI27-203ENST00000557700 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
IFI27-203ENST00000557700 NESP48681 1621 aa43.74■■■■■ 4.59
IFI27-203ENST00000557700 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.74■■■■■ 4.59
IFI27-203ENST00000557700 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.67■■■■■ 4.58
IFI27-203ENST00000557700 ERCC6Q03468 1493 aa43.62■■■■■ 4.57
IFI27-203ENST00000557700 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.49■■■■■ 4.55
IFI27-203ENST00000557700 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.49■■■■■ 4.55
IFI27-203ENST00000557700 CFTRP13569 1480 aa43.43■■■■■ 4.54
IFI27-203ENST00000557700 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
IFI27-203ENST00000557700 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.18■■■■■ 4.5
IFI27-203ENST00000557700 CUX2O14529 1486 aa43.14■■■■■ 4.5
IFI27-203ENST00000557700 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.13■■■■■ 4.5
IFI27-203ENST00000557700 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.08■■■■■ 4.49
IFI27-203ENST00000557700 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
IFI27-203ENST00000557700 MRC2Q9UBG0 1479 aa43■■■■■ 4.47
IFI27-203ENST00000557700 PRDM2Q13029 1718 aa42.97■■■■■ 4.47
IFI27-203ENST00000557700 WDR62O43379 1518 aa42.84■■■■■ 4.45
IFI27-203ENST00000557700 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
IFI27-203ENST00000557700 ABCC8Q09428 1581 aa42.53■■■■■ 4.4
IFI27-203ENST00000557700 TOPBP1Q92547 1522 aa42.45■■■■■ 4.39
IFI27-203ENST00000557700 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.41■■■■■ 4.38
IFI27-203ENST00000557700 IFT140Q96RY7 1462 aa42.2■■■■■ 4.35
IFI27-203ENST00000557700 CUX1P39880 1505 aa42.15■■■■■ 4.34
IFI27-203ENST00000557700 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
IFI27-203ENST00000557700 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42■■■■■ 4.31
IFI27-203ENST00000557700 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.31
IFI27-203ENST00000557700 SOGA1O94964 1423 aa41.95■■■■■ 4.31
IFI27-203ENST00000557700 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
IFI27-203ENST00000557700 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
IFI27-203ENST00000557700 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.87■■■■■ 4.29
IFI27-203ENST00000557700 TOP2BQ02880 1626 aa41.84■■■■■ 4.29
IFI27-203ENST00000557700 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.8■■■■■ 4.28
IFI27-203ENST00000557700 SYNJ1O43426 1573 aa41.78■■■■■ 4.28
IFI27-203ENST00000557700 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.27
IFI27-203ENST00000557700 WDR97A6NE52 1622 aa41.71■■■■■ 4.27
IFI27-203ENST00000557700 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.71■■■■■ 4.27
IFI27-203ENST00000557700 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
IFI27-203ENST00000557700 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.66■■■■■ 4.26
IFI27-203ENST00000557700 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.64■■■■■ 4.26
IFI27-203ENST00000557700 GRIN2BQ13224 1484 aa41.47■■■■■ 4.23
IFI27-203ENST00000557700 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.47■■■■■ 4.23
IFI27-203ENST00000557700 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.41■■■■■ 4.22
IFI27-203ENST00000557700 OSCARQ8IYS5 282 aa41.39■■■■■ 4.22
IFI27-203ENST00000557700 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
IFI27-203ENST00000557700 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.34■■■■■ 4.21
IFI27-203ENST00000557700 PBRM1Q86U86 1689 aa41.26■■■■■ 4.2
IFI27-203ENST00000557700 FBLN2P98095 1184 aa41.21■■■■■ 4.19
IFI27-203ENST00000557700 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
IFI27-203ENST00000557700 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
IFI27-203ENST00000557700 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.15■■■■■ 4.18
IFI27-203ENST00000557700 CHD1O14646 1710 aa41.14■■■■■ 4.18
IFI27-203ENST00000557700 KIF27Q86VH2 1401 aa41.12■■■■■ 4.17
IFI27-203ENST00000557700 TRIM41Q8WV44 630 aa41.07■■■■■ 4.17
IFI27-203ENST00000557700 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.01■■■■■ 4.16
IFI27-203ENST00000557700 ADAMTS12P58397 1594 aa41.01■■■■■ 4.16
IFI27-203ENST00000557700 GRIN2AQ12879 1464 aa40.9■■■■■ 4.14
IFI27-203ENST00000557700 IGF1RP08069 1367 aa40.9■■■■■ 4.14
IFI27-203ENST00000557700 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.79■■■■■ 4.12
IFI27-203ENST00000557700 CUL7Q14999 1698 aa40.77■■■■■ 4.12
IFI27-203ENST00000557700 NUP160Q12769 1436 aa40.74■■■■■ 4.11
IFI27-203ENST00000557700 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.67■■■■■ 4.1
IFI27-203ENST00000557700 ARHGEF11O15085 1522 aa40.65■■■■■ 4.1
IFI27-203ENST00000557700 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
IFI27-203ENST00000557700 CEP170Q5SW79 1584 aa40.64■■■■■ 4.1
IFI27-203ENST00000557700 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.61■■■■■ 4.09
IFI27-203ENST00000557700 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
IFI27-203ENST00000557700 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
IFI27-203ENST00000557700 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
IFI27-203ENST00000557700 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.45■■■■■ 4.07
IFI27-203ENST00000557700 EEA1Q15075 1411 aa40.44■■■■■ 4.06
IFI27-203ENST00000557700 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms