RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556960.1

TTC7B-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 3

Gene TTC7B, Length 387 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-211ENST00000556960 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.79■■■■□ 3.48
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TTC7B-211ENST00000556960 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
TTC7B-211ENST00000556960 NACADO15069 1562 aa30.59■■■□□ 2.49
TTC7B-211ENST00000556960 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.59■■■□□ 2.49
TTC7B-211ENST00000556960 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.54■■■□□ 2.48
TTC7B-211ENST00000556960 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.53■■■□□ 2.48
TTC7B-211ENST00000556960 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.41■■■□□ 2.46
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TTC7B-211ENST00000556960 SCRIBQ14160 1630 aa29.67■■■□□ 2.34
TTC7B-211ENST00000556960 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.57■■■□□ 2.32
TTC7B-211ENST00000556960 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.43■■■□□ 2.3
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TTC7B-211ENST00000556960 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.6■■■□□ 2.17
TTC7B-211ENST00000556960 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.55■■■□□ 2.16
TTC7B-211ENST00000556960 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.54■■■□□ 2.16
TTC7B-211ENST00000556960 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
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TTC7B-211ENST00000556960 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.31■■■□□ 2.12
TTC7B-211ENST00000556960 SMARCA2P51531 1590 aa28.26■■■□□ 2.11
TTC7B-211ENST00000556960 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.26■■■□□ 2.11
TTC7B-211ENST00000556960 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.24■■■□□ 2.11
TTC7B-211ENST00000556960 NCAPD3P42695 1498 aa28.22■■■□□ 2.11
TTC7B-211ENST00000556960 HMGXB3Q12766 1538 aa28.13■■■□□ 2.09
TTC7B-211ENST00000556960 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
TTC7B-211ENST00000556960 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TTC7B-211ENST00000556960 WIZO95785 1651 aa27.98■■■□□ 2.07
TTC7B-211ENST00000556960 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
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TTC7B-211ENST00000556960 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.43■■□□□ 1.98
TTC7B-211ENST00000556960 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.41■■□□□ 1.98
TTC7B-211ENST00000556960 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.38■■□□□ 1.97
TTC7B-211ENST00000556960 NESP48681 1621 aa27.34■■□□□ 1.97
TTC7B-211ENST00000556960 CFTRP13569 1480 aa27.31■■□□□ 1.96
TTC7B-211ENST00000556960 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.21■■□□□ 1.95
TTC7B-211ENST00000556960 ERCC6Q03468 1493 aa27.15■■□□□ 1.94
TTC7B-211ENST00000556960 PRDM2Q13029 1718 aa27.1■■□□□ 1.93
TTC7B-211ENST00000556960 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.05■■□□□ 1.92
TTC7B-211ENST00000556960 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.04■■□□□ 1.92
TTC7B-211ENST00000556960 CEP164Q9UPV0 1460 aa27■■□□□ 1.91
TTC7B-211ENST00000556960 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TTC7B-211ENST00000556960 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC7B-211ENST00000556960 CUX2O14529 1486 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC7B-211ENST00000556960 WDR62O43379 1518 aa26.83■■□□□ 1.89
TTC7B-211ENST00000556960 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TTC7B-211ENST00000556960 ABCC8Q09428 1581 aa26.73■■□□□ 1.87
TTC7B-211ENST00000556960 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.67■■□□□ 1.86
TTC7B-211ENST00000556960 TOPBP1Q92547 1522 aa26.65■■□□□ 1.86
TTC7B-211ENST00000556960 CUX1P39880 1505 aa26.55■■□□□ 1.84
TTC7B-211ENST00000556960 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
TTC7B-211ENST00000556960 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
TTC7B-211ENST00000556960 IFT140Q96RY7 1462 aa26.44■■□□□ 1.82
TTC7B-211ENST00000556960 TOP2BQ02880 1626 aa26.43■■□□□ 1.82
TTC7B-211ENST00000556960 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.43■■□□□ 1.82
TTC7B-211ENST00000556960 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.42■■□□□ 1.82
TTC7B-211ENST00000556960 SYNJ1O43426 1573 aa26.39■■□□□ 1.82
TTC7B-211ENST00000556960 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
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TTC7B-211ENST00000556960 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.27■■□□□ 1.8
TTC7B-211ENST00000556960 WDR97A6NE52 1622 aa26.25■■□□□ 1.79
TTC7B-211ENST00000556960 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.22■■□□□ 1.79
TTC7B-211ENST00000556960 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TTC7B-211ENST00000556960 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
TTC7B-211ENST00000556960 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
TTC7B-211ENST00000556960 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
TTC7B-211ENST00000556960 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC7B-211ENST00000556960 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
TTC7B-211ENST00000556960 GRIN2BQ13224 1484 aa26.02■■□□□ 1.76
TTC7B-211ENST00000556960 TRIM41Q8WV44 630 aa26.01■■□□□ 1.75
TTC7B-211ENST00000556960 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TTC7B-211ENST00000556960 PBRM1Q86U86 1689 aa25.95■■□□□ 1.74
TTC7B-211ENST00000556960 KIF27Q86VH2 1401 aa25.94■■□□□ 1.74
TTC7B-211ENST00000556960 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.92■■□□□ 1.74
TTC7B-211ENST00000556960 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.91■■□□□ 1.74
TTC7B-211ENST00000556960 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.88■■□□□ 1.73
TTC7B-211ENST00000556960 SYNJ2O15056 1496 aa25.82■■□□□ 1.72
TTC7B-211ENST00000556960 ADAMTS12P58397 1594 aa25.8■■□□□ 1.72
TTC7B-211ENST00000556960 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.78■■□□□ 1.72
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TTC7B-211ENST00000556960 CHD1O14646 1710 aa25.74■■□□□ 1.71
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TTC7B-211ENST00000556960 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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TTC7B-211ENST00000556960 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.69■■□□□ 1.7
TTC7B-211ENST00000556960 EEA1Q15075 1411 aa25.69■■□□□ 1.7
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TTC7B-211ENST00000556960 FBLN2P98095 1184 aa25.67■■□□□ 1.7
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TTC7B-211ENST00000556960 NUP160Q12769 1436 aa25.58■■□□□ 1.69
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TTC7B-211ENST00000556960 PRXQ9BXM0 1461 aa25.53■■□□□ 1.68
TTC7B-211ENST00000556960 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.53■■□□□ 1.68
TTC7B-211ENST00000556960 CEP170Q5SW79 1584 aa25.52■■□□□ 1.68
TTC7B-211ENST00000556960 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.51■■□□□ 1.67
TTC7B-211ENST00000556960 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.4■■□□□ 1.66
TTC7B-211ENST00000556960 KIF21BO75037 1637 aa25.37■■□□□ 1.65
TTC7B-211ENST00000556960 SHROOM2Q13796 1616 aa25.35■■□□□ 1.65
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