RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555124.1

LRP1-208, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene LRP1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-208ENST00000555124 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.65■■■■□ 3.3
LRP1-208ENST00000555124 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.65■■■□□ 2.66
LRP1-208ENST00000555124 ABCC9O60706 1549 aa30.84■■■□□ 2.53
LRP1-208ENST00000555124 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.81■■■□□ 2.36
LRP1-208ENST00000555124 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.73■■■□□ 2.35
LRP1-208ENST00000555124 NACADO15069 1562 aa29.72■■■□□ 2.35
LRP1-208ENST00000555124 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
LRP1-208ENST00000555124 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.55■■■□□ 2.32
LRP1-208ENST00000555124 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.49■■■□□ 2.31
LRP1-208ENST00000555124 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.11■■■□□ 2.25
LRP1-208ENST00000555124 SCRIBQ14160 1630 aa28.9■■■□□ 2.22
LRP1-208ENST00000555124 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
LRP1-208ENST00000555124 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.8■■■□□ 2.2
LRP1-208ENST00000555124 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.48■■■□□ 2.15
LRP1-208ENST00000555124 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.18■■■□□ 2.1
LRP1-208ENST00000555124 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
LRP1-208ENST00000555124 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.91■■■□□ 2.06
LRP1-208ENST00000555124 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.76■■■□□ 2.04
LRP1-208ENST00000555124 SMARCA4P51532 1647 aa27.65■■■□□ 2.02
LRP1-208ENST00000555124 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
LRP1-208ENST00000555124 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.48■■□□□ 1.99
LRP1-208ENST00000555124 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.44■■□□□ 1.98
LRP1-208ENST00000555124 SMARCA2P51531 1590 aa27.43■■□□□ 1.98
LRP1-208ENST00000555124 NCAPD3P42695 1498 aa27.41■■□□□ 1.98
LRP1-208ENST00000555124 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.35■■□□□ 1.97
LRP1-208ENST00000555124 HMGXB3Q12766 1538 aa27.28■■□□□ 1.96
LRP1-208ENST00000555124 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
LRP1-208ENST00000555124 WIZO95785 1651 aa27.23■■□□□ 1.95
LRP1-208ENST00000555124 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
LRP1-208ENST00000555124 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
LRP1-208ENST00000555124 NESP48681 1621 aa26.72■■□□□ 1.87
LRP1-208ENST00000555124 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
LRP1-208ENST00000555124 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.67■■□□□ 1.86
LRP1-208ENST00000555124 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.62■■□□□ 1.85
LRP1-208ENST00000555124 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.61■■□□□ 1.85
LRP1-208ENST00000555124 ERCC6Q03468 1493 aa26.58■■□□□ 1.85
LRP1-208ENST00000555124 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.49■■□□□ 1.83
LRP1-208ENST00000555124 CFTRP13569 1480 aa26.49■■□□□ 1.83
LRP1-208ENST00000555124 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.44■■□□□ 1.82
LRP1-208ENST00000555124 PRDM2Q13029 1718 aa26.38■■□□□ 1.81
LRP1-208ENST00000555124 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.32■■□□□ 1.8
LRP1-208ENST00000555124 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.28■■□□□ 1.8
LRP1-208ENST00000555124 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
LRP1-208ENST00000555124 CUX2O14529 1486 aa26.23■■□□□ 1.79
LRP1-208ENST00000555124 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.21■■□□□ 1.79
LRP1-208ENST00000555124 WDR62O43379 1518 aa26.11■■□□□ 1.77
LRP1-208ENST00000555124 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
LRP1-208ENST00000555124 ABCC8Q09428 1581 aa25.94■■□□□ 1.74
LRP1-208ENST00000555124 TOPBP1Q92547 1522 aa25.92■■□□□ 1.74
LRP1-208ENST00000555124 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.9■■□□□ 1.74
LRP1-208ENST00000555124 CUX1P39880 1505 aa25.78■■□□□ 1.72
LRP1-208ENST00000555124 IFT140Q96RY7 1462 aa25.72■■□□□ 1.71
LRP1-208ENST00000555124 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
LRP1-208ENST00000555124 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.66■■□□□ 1.7
LRP1-208ENST00000555124 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
LRP1-208ENST00000555124 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
LRP1-208ENST00000555124 SOGA1O94964 1423 aa25.63■■□□□ 1.69
LRP1-208ENST00000555124 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.6■■□□□ 1.69
LRP1-208ENST00000555124 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.6■■□□□ 1.69
LRP1-208ENST00000555124 TOP2BQ02880 1626 aa25.59■■□□□ 1.69
LRP1-208ENST00000555124 SYNJ1O43426 1573 aa25.59■■□□□ 1.69
LRP1-208ENST00000555124 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
LRP1-208ENST00000555124 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
LRP1-208ENST00000555124 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.674e-6■■■■□ 19.6
LRP1-208ENST00000555124 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
LRP1-208ENST00000555124 WDR97A6NE52 1622 aa25.45■■□□□ 1.67
LRP1-208ENST00000555124 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.42■■□□□ 1.66
LRP1-208ENST00000555124 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.33■■□□□ 1.65
LRP1-208ENST00000555124 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.3■■□□□ 1.64
LRP1-208ENST00000555124 PBRM1Q86U86 1689 aa25.29■■□□□ 1.64
LRP1-208ENST00000555124 GRIN2BQ13224 1484 aa25.29■■□□□ 1.64
LRP1-208ENST00000555124 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.28■■□□□ 1.64
LRP1-208ENST00000555124 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.23■■□□□ 1.63
LRP1-208ENST00000555124 OSCARQ8IYS5 282 aa25.21■■□□□ 1.63
LRP1-208ENST00000555124 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
LRP1-208ENST00000555124 CHD1O14646 1710 aa25.2■■□□□ 1.63
LRP1-208ENST00000555124 TRIM41Q8WV44 630 aa25.2■■□□□ 1.62
LRP1-208ENST00000555124 FBLN2P98095 1184 aa25.18■■□□□ 1.62
LRP1-208ENST00000555124 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
LRP1-208ENST00000555124 KIF27Q86VH2 1401 aa25.12■■□□□ 1.61
LRP1-208ENST00000555124 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.12■■□□□ 1.61
LRP1-208ENST00000555124 SYNJ2O15056 1496 aa25.1■■□□□ 1.61
LRP1-208ENST00000555124 ADAMTS12P58397 1594 aa25.05■■□□□ 1.6
LRP1-208ENST00000555124 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.03■■□□□ 1.6
LRP1-208ENST00000555124 IGF1RP08069 1367 aa25■■□□□ 1.59
LRP1-208ENST00000555124 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.97■■□□□ 1.59
LRP1-208ENST00000555124 GRIN2AQ12879 1464 aa24.96■■□□□ 1.59
LRP1-208ENST00000555124 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.94■■□□□ 1.58
LRP1-208ENST00000555124 CUL7Q14999 1698 aa24.94■■□□□ 1.58
LRP1-208ENST00000555124 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.88■■□□□ 1.57
LRP1-208ENST00000555124 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.86■■□□□ 1.57
LRP1-208ENST00000555124 NUP160Q12769 1436 aa24.84■■□□□ 1.57
LRP1-208ENST00000555124 CEP170Q5SW79 1584 aa24.84■■□□□ 1.57
LRP1-208ENST00000555124 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LRP1-208ENST00000555124 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LRP1-208ENST00000555124 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LRP1-208ENST00000555124 ARHGEF11O15085 1522 aa24.76■■□□□ 1.55
LRP1-208ENST00000555124 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.73■■□□□ 1.55
LRP1-208ENST00000555124 EEA1Q15075 1411 aa24.73■■□□□ 1.55
LRP1-208ENST00000555124 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.71■■□□□ 1.55
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