RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553238.5

SLC8B1-216, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 5

Gene SLC8B1, Length 1,675 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-216ENST00000553238 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.67■■■□□ 2.66
SLC8B1-216ENST00000553238 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.74■■■□□ 2.03
SLC8B1-216ENST00000553238 ABCC9O60706 1549 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC8B1-216ENST00000553238 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SLC8B1-216ENST00000553238 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC8B1-216ENST00000553238 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC8B1-216ENST00000553238 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.01■■□□□ 1.75
SLC8B1-216ENST00000553238 NACADO15069 1562 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC8B1-216ENST00000553238 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.65■■□□□ 1.7
SLC8B1-216ENST00000553238 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.56■■□□□ 1.68
SLC8B1-216ENST00000553238 SCRIBQ14160 1630 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC8B1-216ENST00000553238 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC8B1-216ENST00000553238 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
SLC8B1-216ENST00000553238 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.98■■□□□ 1.59
SLC8B1-216ENST00000553238 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.96■■□□□ 1.59
SLC8B1-216ENST00000553238 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC8B1-216ENST00000553238 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SLC8B1-216ENST00000553238 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SLC8B1-216ENST00000553238 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SLC8B1-216ENST00000553238 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC8B1-216ENST00000553238 SMARCA4P51532 1647 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC8B1-216ENST00000553238 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SLC8B1-216ENST00000553238 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC8B1-216ENST00000553238 WIZO95785 1651 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC8B1-216ENST00000553238 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC8B1-216ENST00000553238 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.02■■□□□ 1.44
SLC8B1-216ENST00000553238 SMARCA2P51531 1590 aa24■■□□□ 1.43
SLC8B1-216ENST00000553238 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SLC8B1-216ENST00000553238 NCAPD3P42695 1498 aa23.87■■□□□ 1.41
SLC8B1-216ENST00000553238 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SLC8B1-216ENST00000553238 HMGXB3Q12766 1538 aa23.82■■□□□ 1.4
SLC8B1-216ENST00000553238 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC8B1-216ENST00000553238 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC8B1-216ENST00000553238 CFTRP13569 1480 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC8B1-216ENST00000553238 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.21■■□□□ 1.31
SLC8B1-216ENST00000553238 NESP48681 1621 aa23.2■■□□□ 1.3
SLC8B1-216ENST00000553238 PRDM2Q13029 1718 aa23.18■■□□□ 1.3
SLC8B1-216ENST00000553238 ABCC8Q09428 1581 aa23.14■■□□□ 1.29
SLC8B1-216ENST00000553238 ERCC6Q03468 1493 aa23.13■■□□□ 1.29
SLC8B1-216ENST00000553238 TRIM41Q8WV44 630 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC8B1-216ENST00000553238 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.07■■□□□ 1.28
SLC8B1-216ENST00000553238 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
SLC8B1-216ENST00000553238 SYNJ1O43426 1573 aa22.96■■□□□ 1.27
SLC8B1-216ENST00000553238 CUX2O14529 1486 aa22.96■■□□□ 1.27
SLC8B1-216ENST00000553238 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC8B1-216ENST00000553238 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.93■■□□□ 1.26
SLC8B1-216ENST00000553238 TOP2BQ02880 1626 aa22.9■■□□□ 1.26
SLC8B1-216ENST00000553238 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.9■■□□□ 1.26
SLC8B1-216ENST00000553238 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SLC8B1-216ENST00000553238 CUX1P39880 1505 aa22.87■■□□□ 1.25
SLC8B1-216ENST00000553238 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.85■■□□□ 1.25
SLC8B1-216ENST00000553238 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC8B1-216ENST00000553238 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC8B1-216ENST00000553238 TOPBP1Q92547 1522 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC8B1-216ENST00000553238 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC8B1-216ENST00000553238 SOGA1O94964 1423 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC8B1-216ENST00000553238 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC8B1-216ENST00000553238 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC8B1-216ENST00000553238 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC8B1-216ENST00000553238 EEA1Q15075 1411 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC8B1-216ENST00000553238 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC8B1-216ENST00000553238 WDR62O43379 1518 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC8B1-216ENST00000553238 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SLC8B1-216ENST00000553238 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SLC8B1-216ENST00000553238 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC8B1-216ENST00000553238 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC8B1-216ENST00000553238 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.46■■□□□ 1.19
SLC8B1-216ENST00000553238 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC8B1-216ENST00000553238 KIF27Q86VH2 1401 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC8B1-216ENST00000553238 WDR97A6NE52 1622 aa22.43■■□□□ 1.18
SLC8B1-216ENST00000553238 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SLC8B1-216ENST00000553238 KIF21BO75037 1637 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC8B1-216ENST00000553238 PRXQ9BXM0 1461 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC8B1-216ENST00000553238 IGF1RP08069 1367 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC8B1-216ENST00000553238 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC8B1-216ENST00000553238 IFT140Q96RY7 1462 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC8B1-216ENST00000553238 GOLGA3Q08378 1498 aa22.27■■□□□ 1.15
SLC8B1-216ENST00000553238 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.24■■□□□ 1.15
SLC8B1-216ENST00000553238 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SLC8B1-216ENST00000553238 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC8B1-216ENST00000553238 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC8B1-216ENST00000553238 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC8B1-216ENST00000553238 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC8B1-216ENST00000553238 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SLC8B1-216ENST00000553238 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC8B1-216ENST00000553238 CUL7Q14999 1698 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC8B1-216ENST00000553238 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.137e-7■■■■■ 34.7
SLC8B1-216ENST00000553238 PBRM1Q86U86 1689 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC8B1-216ENST00000553238 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SLC8B1-216ENST00000553238 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC8B1-216ENST00000553238 GRIN2BQ13224 1484 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC8B1-216ENST00000553238 CEP162Q5TB80 1403 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC8B1-216ENST00000553238 ADAMTS12P58397 1594 aa22■■□□□ 1.11
SLC8B1-216ENST00000553238 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC8B1-216ENST00000553238 OSCARQ8IYS5 282 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC8B1-216ENST00000553238 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC8B1-216ENST00000553238 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SLC8B1-216ENST00000553238 CLIP1P30622 1438 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC8B1-216ENST00000553238 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC8B1-216ENST00000553238 CHD1O14646 1710 aa21.86■■□□□ 1.09
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