RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.39■■■■□ 3.26
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.48■■■□□ 2.63
HECTD4-212ENST00000550724 ABCC9O60706 1549 aa31.34■■■□□ 2.61
HECTD4-212ENST00000550724 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30■■■□□ 2.39
HECTD4-212ENST00000550724 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.89■■■□□ 2.38
HECTD4-212ENST00000550724 NACADO15069 1562 aa29.74■■■□□ 2.35
HECTD4-212ENST00000550724 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
HECTD4-212ENST00000550724 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.39■■■□□ 2.3
HECTD4-212ENST00000550724 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
HECTD4-212ENST00000550724 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.17■■■□□ 2.26
HECTD4-212ENST00000550724 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.08■■■□□ 2.25
HECTD4-212ENST00000550724 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.07■■■□□ 2.24
HECTD4-212ENST00000550724 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.96■■■□□ 2.23
HECTD4-212ENST00000550724 SCRIBQ14160 1630 aa28.87■■■□□ 2.21
HECTD4-212ENST00000550724 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.57■■■□□ 2.16
HECTD4-212ENST00000550724 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
HECTD4-212ENST00000550724 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.23■■■□□ 2.11
HECTD4-212ENST00000550724 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.16■■■□□ 2.1
HECTD4-212ENST00000550724 SMARCA4P51532 1647 aa27.51■■□□□ 1.99
HECTD4-212ENST00000550724 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.49■■□□□ 1.99
HECTD4-212ENST00000550724 NCAPD3P42695 1498 aa27.48■■□□□ 1.99
HECTD4-212ENST00000550724 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HECTD4-212ENST00000550724 SMARCA2P51531 1590 aa27.4■■□□□ 1.98
HECTD4-212ENST00000550724 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.31■■□□□ 1.96
HECTD4-212ENST00000550724 HMGXB3Q12766 1538 aa27.27■■□□□ 1.96
HECTD4-212ENST00000550724 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
HECTD4-212ENST00000550724 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.17■■□□□ 1.94
HECTD4-212ENST00000550724 ERCC6Q03468 1493 aa27.06■■□□□ 1.92
HECTD4-212ENST00000550724 NESP48681 1621 aa27.01■■□□□ 1.91
HECTD4-212ENST00000550724 WIZO95785 1651 aa26.98■■□□□ 1.91
HECTD4-212ENST00000550724 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HECTD4-212ENST00000550724 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.77■■□□□ 1.88
HECTD4-212ENST00000550724 CUX2O14529 1486 aa26.76■■□□□ 1.87
HECTD4-212ENST00000550724 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.72■■□□□ 1.87
HECTD4-212ENST00000550724 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.7■■□□□ 1.86
HECTD4-212ENST00000550724 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HECTD4-212ENST00000550724 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.57■■□□□ 1.84
HECTD4-212ENST00000550724 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HECTD4-212ENST00000550724 CFTRP13569 1480 aa26.45■■□□□ 1.82
HECTD4-212ENST00000550724 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.43■■□□□ 1.82
HECTD4-212ENST00000550724 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.42■■□□□ 1.82
HECTD4-212ENST00000550724 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.42■■□□□ 1.82
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.4■■□□□ 1.82
HECTD4-212ENST00000550724 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.39■■□□□ 1.82
HECTD4-212ENST00000550724 WDR62O43379 1518 aa26.29■■□□□ 1.8
HECTD4-212ENST00000550724 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
HECTD4-212ENST00000550724 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
HECTD4-212ENST00000550724 PRDM2Q13029 1718 aa26.06■■□□□ 1.76
HECTD4-212ENST00000550724 TOPBP1Q92547 1522 aa25.93■■□□□ 1.74
HECTD4-212ENST00000550724 ABCC8Q09428 1581 aa25.88■■□□□ 1.73
HECTD4-212ENST00000550724 IFT140Q96RY7 1462 aa25.86■■□□□ 1.73
HECTD4-212ENST00000550724 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.85■■□□□ 1.73
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
HECTD4-212ENST00000550724 OSCARQ8IYS5 282 aa25.72■■□□□ 1.71
HECTD4-212ENST00000550724 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
HECTD4-212ENST00000550724 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.66■■□□□ 1.7
HECTD4-212ENST00000550724 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
HECTD4-212ENST00000550724 SOGA1O94964 1423 aa25.65■■□□□ 1.7
HECTD4-212ENST00000550724 CUX1P39880 1505 aa25.63■■□□□ 1.69
HECTD4-212ENST00000550724 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.62■■□□□ 1.69
HECTD4-212ENST00000550724 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
HECTD4-212ENST00000550724 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HECTD4-212ENST00000550724 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HECTD4-212ENST00000550724 TRIM41Q8WV44 630 aa25.55■■□□□ 1.68
HECTD4-212ENST00000550724 FBLN2P98095 1184 aa25.54■■□□□ 1.68
HECTD4-212ENST00000550724 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
HECTD4-212ENST00000550724 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.38■■□□□ 1.65
HECTD4-212ENST00000550724 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
HECTD4-212ENST00000550724 GRIN2BQ13224 1484 aa25.34■■□□□ 1.65
HECTD4-212ENST00000550724 WDR97A6NE52 1622 aa25.33■■□□□ 1.65
HECTD4-212ENST00000550724 CHD1O14646 1710 aa25.32■■□□□ 1.64
HECTD4-212ENST00000550724 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.32■■□□□ 1.64
HECTD4-212ENST00000550724 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.3■■□□□ 1.64
HECTD4-212ENST00000550724 SYNJ1O43426 1573 aa25.29■■□□□ 1.64
HECTD4-212ENST00000550724 TOP2BQ02880 1626 aa25.27■■□□□ 1.64
HECTD4-212ENST00000550724 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HECTD4-212ENST00000550724 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.24■■□□□ 1.63
HECTD4-212ENST00000550724 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
HECTD4-212ENST00000550724 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
HECTD4-212ENST00000550724 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGEF11O15085 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
HECTD4-212ENST00000550724 SYNJ2O15056 1496 aa25.21■■□□□ 1.63
HECTD4-212ENST00000550724 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.19■■□□□ 1.62
HECTD4-212ENST00000550724 PBRM1Q86U86 1689 aa25.18■■□□□ 1.62
HECTD4-212ENST00000550724 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.15■■□□□ 1.62
HECTD4-212ENST00000550724 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.05■■□□□ 1.6
HECTD4-212ENST00000550724 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.01■■□□□ 1.59
HECTD4-212ENST00000550724 GRIN2AQ12879 1464 aa25.01■■□□□ 1.59
HECTD4-212ENST00000550724 ADAMTS12P58397 1594 aa25.01■■□□□ 1.59
HECTD4-212ENST00000550724 ARAP1Q96P48 1450 aa25■■□□□ 1.59
HECTD4-212ENST00000550724 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.97■■□□□ 1.59
HECTD4-212ENST00000550724 KIF27Q86VH2 1401 aa24.89■■□□□ 1.58
HECTD4-212ENST00000550724 CEP170Q5SW79 1584 aa24.88■■□□□ 1.57
HECTD4-212ENST00000550724 NUP160Q12769 1436 aa24.87■■□□□ 1.57
HECTD4-212ENST00000550724 IGF1RP08069 1367 aa24.82■■□□□ 1.56
HECTD4-212ENST00000550724 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HECTD4-212ENST00000550724 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.76■■□□□ 1.55
HECTD4-212ENST00000550724 JPH4Q96JJ6 628 aa24.73■■□□□ 1.55
HECTD4-212ENST00000550724 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HECTD4-212ENST00000550724 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms