RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549462.1

ITGB7-208, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB7, Length 1,526 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-208ENST00000549462 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.08■■■■■ 5.29
ITGB7-208ENST00000549462 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.7■■■■■ 4.43
ITGB7-208ENST00000549462 ABCC9O60706 1549 aa42.2■■■■■ 4.35
ITGB7-208ENST00000549462 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.45■■■■■ 4.07
ITGB7-208ENST00000549462 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.36■■■■■ 4.05
ITGB7-208ENST00000549462 NACADO15069 1562 aa40.26■■■■■ 4.04
ITGB7-208ENST00000549462 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
ITGB7-208ENST00000549462 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.91■■■■□ 3.98
ITGB7-208ENST00000549462 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.68■■■■□ 3.94
ITGB7-208ENST00000549462 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.49■■■■□ 3.91
ITGB7-208ENST00000549462 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.41■■■■□ 3.9
ITGB7-208ENST00000549462 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.21■■■■□ 3.87
ITGB7-208ENST00000549462 SCRIBQ14160 1630 aa39.1■■■■□ 3.85
ITGB7-208ENST00000549462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.01■■■■□ 3.84
ITGB7-208ENST00000549462 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.64■■■■□ 3.78
ITGB7-208ENST00000549462 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
ITGB7-208ENST00000549462 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.08■■■■□ 3.69
ITGB7-208ENST00000549462 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.9■■■■□ 3.66
ITGB7-208ENST00000549462 SMARCA4P51532 1647 aa37.33■■■■□ 3.57
ITGB7-208ENST00000549462 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
ITGB7-208ENST00000549462 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.23■■■■□ 3.55
ITGB7-208ENST00000549462 NCAPD3P42695 1498 aa37.2■■■■□ 3.55
ITGB7-208ENST00000549462 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.1■■■■□ 3.53
ITGB7-208ENST00000549462 SMARCA2P51531 1590 aa37.1■■■■□ 3.53
ITGB7-208ENST00000549462 HMGXB3Q12766 1538 aa36.95■■■■□ 3.51
ITGB7-208ENST00000549462 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.91■■■■□ 3.5
ITGB7-208ENST00000549462 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
ITGB7-208ENST00000549462 WIZO95785 1651 aa36.66■■■■□ 3.46
ITGB7-208ENST00000549462 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
ITGB7-208ENST00000549462 NESP48681 1621 aa36.47■■■■□ 3.43
ITGB7-208ENST00000549462 ERCC6Q03468 1493 aa36.34■■■■□ 3.41
ITGB7-208ENST00000549462 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
ITGB7-208ENST00000549462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.2■■■■□ 3.38
ITGB7-208ENST00000549462 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.15■■■■□ 3.38
ITGB7-208ENST00000549462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.03■■■■□ 3.36
ITGB7-208ENST00000549462 CUX2O14529 1486 aa35.95■■■■□ 3.35
ITGB7-208ENST00000549462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.91■■■■□ 3.34
ITGB7-208ENST00000549462 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.87■■■■□ 3.33
ITGB7-208ENST00000549462 CFTRP13569 1480 aa35.86■■■■□ 3.33
ITGB7-208ENST00000549462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
ITGB7-208ENST00000549462 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.73■■■■□ 3.31
ITGB7-208ENST00000549462 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.68■■■■□ 3.3
ITGB7-208ENST00000549462 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
ITGB7-208ENST00000549462 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.67■■■■□ 3.3
ITGB7-208ENST00000549462 WDR62O43379 1518 aa35.52■■■■□ 3.28
ITGB7-208ENST00000549462 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
ITGB7-208ENST00000549462 PRDM2Q13029 1718 aa35.4■■■■□ 3.26
ITGB7-208ENST00000549462 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.21■■■■□ 3.23
ITGB7-208ENST00000549462 TOPBP1Q92547 1522 aa35.13■■■■□ 3.21
ITGB7-208ENST00000549462 ABCC8Q09428 1581 aa35.03■■■■□ 3.2
ITGB7-208ENST00000549462 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.02■■■■□ 3.2
ITGB7-208ENST00000549462 IFT140Q96RY7 1462 aa34.93■■■■□ 3.18
ITGB7-208ENST00000549462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
ITGB7-208ENST00000549462 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
ITGB7-208ENST00000549462 CUX1P39880 1505 aa34.81■■■■□ 3.16
ITGB7-208ENST00000549462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.74■■■■□ 3.15
ITGB7-208ENST00000549462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
ITGB7-208ENST00000549462 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.72■■■■□ 3.15
ITGB7-208ENST00000549462 SOGA1O94964 1423 aa34.7■■■■□ 3.15
ITGB7-208ENST00000549462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.67■■■■□ 3.14
ITGB7-208ENST00000549462 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
ITGB7-208ENST00000549462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
ITGB7-208ENST00000549462 OSCARQ8IYS5 282 aa34.54■■■■□ 3.12
ITGB7-208ENST00000549462 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.51■■■■□ 3.11
ITGB7-208ENST00000549462 SYNJ1O43426 1573 aa34.42■■■■□ 3.1
ITGB7-208ENST00000549462 TOP2BQ02880 1626 aa34.39■■■■□ 3.1
ITGB7-208ENST00000549462 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.35■■■■□ 3.09
ITGB7-208ENST00000549462 FBLN2P98095 1184 aa34.34■■■■□ 3.09
ITGB7-208ENST00000549462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.34■■■■□ 3.09
ITGB7-208ENST00000549462 WDR97A6NE52 1622 aa34.33■■■■□ 3.09
ITGB7-208ENST00000549462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.29■■■■□ 3.08
ITGB7-208ENST00000549462 GRIN2BQ13224 1484 aa34.28■■■■□ 3.08
ITGB7-208ENST00000549462 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.27■■■■□ 3.08
ITGB7-208ENST00000549462 CHD1O14646 1710 aa34.21■■■■□ 3.07
ITGB7-208ENST00000549462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.18■■■■□ 3.06
ITGB7-208ENST00000549462 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
ITGB7-208ENST00000549462 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
ITGB7-208ENST00000549462 PBRM1Q86U86 1689 aa34.12■■■■□ 3.05
ITGB7-208ENST00000549462 SYNJ2O15056 1496 aa34.08■■■■□ 3.05
ITGB7-208ENST00000549462 TRIM41Q8WV44 630 aa34.05■■■■□ 3.04
ITGB7-208ENST00000549462 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.94■■■■□ 3.02
ITGB7-208ENST00000549462 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.94■■■■□ 3.02
ITGB7-208ENST00000549462 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.94■■■■□ 3.02
ITGB7-208ENST00000549462 ARHGEF11O15085 1522 aa33.93■■■■□ 3.02
ITGB7-208ENST00000549462 ADAMTS12P58397 1594 aa33.89■■■■□ 3.02
ITGB7-208ENST00000549462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.89■■■■□ 3.02
ITGB7-208ENST00000549462 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.86■■■■□ 3.01
ITGB7-208ENST00000549462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.86■■■■□ 3.01
ITGB7-208ENST00000549462 GRIN2AQ12879 1464 aa33.84■■■■□ 3.01
ITGB7-208ENST00000549462 KIF27Q86VH2 1401 aa33.78■■■■□ 3
ITGB7-208ENST00000549462 IGF1RP08069 1367 aa33.74■■■□□ 2.99
ITGB7-208ENST00000549462 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.74■■■□□ 2.99
ITGB7-208ENST00000549462 NUP160Q12769 1436 aa33.69■■■□□ 2.98
ITGB7-208ENST00000549462 CEP170Q5SW79 1584 aa33.69■■■□□ 2.98
ITGB7-208ENST00000549462 ARAP1Q96P48 1450 aa33.67■■■□□ 2.98
ITGB7-208ENST00000549462 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.52■■■□□ 2.96
ITGB7-208ENST00000549462 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.51■■■□□ 2.96
ITGB7-208ENST00000549462 CUL7Q14999 1698 aa33.5■■■□□ 2.95
ITGB7-208ENST00000549462 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.47■■■□□ 2.95
ITGB7-208ENST00000549462 JPH4Q96JJ6 628 aa33.43■■■□□ 2.94
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