RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548390.5

LETMD1-215, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LETMD1, Length 549 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-215ENST00000548390 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.48■■■■■ 4.07
LETMD1-215ENST00000548390 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.58■■■■□ 3.29
LETMD1-215ENST00000548390 ABCC9O60706 1549 aa33.95■■■■□ 3.03
LETMD1-215ENST00000548390 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
LETMD1-215ENST00000548390 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.6■■■□□ 2.97
LETMD1-215ENST00000548390 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.44■■■□□ 2.94
LETMD1-215ENST00000548390 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.44■■■□□ 2.94
LETMD1-215ENST00000548390 NACADO15069 1562 aa33.3■■■□□ 2.92
LETMD1-215ENST00000548390 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.1■■■□□ 2.89
LETMD1-215ENST00000548390 SCRIBQ14160 1630 aa32.48■■■□□ 2.79
LETMD1-215ENST00000548390 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.44■■■□□ 2.78
LETMD1-215ENST00000548390 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.18■■■□□ 2.74
LETMD1-215ENST00000548390 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.99■■■□□ 2.71
LETMD1-215ENST00000548390 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.88■■■□□ 2.69
LETMD1-215ENST00000548390 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.38■■■□□ 2.61
LETMD1-215ENST00000548390 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
LETMD1-215ENST00000548390 SMARCA4P51532 1647 aa31.19■■■□□ 2.58
LETMD1-215ENST00000548390 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
LETMD1-215ENST00000548390 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.17■■■□□ 2.58
LETMD1-215ENST00000548390 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
LETMD1-215ENST00000548390 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
LETMD1-215ENST00000548390 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.92■■■□□ 2.54
LETMD1-215ENST00000548390 SMARCA2P51531 1590 aa30.88■■■□□ 2.53
LETMD1-215ENST00000548390 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.84■■■□□ 2.53
LETMD1-215ENST00000548390 WIZO95785 1651 aa30.83■■■□□ 2.53
LETMD1-215ENST00000548390 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.74■■■□□ 2.51
LETMD1-215ENST00000548390 NCAPD3P42695 1498 aa30.73■■■□□ 2.51
LETMD1-215ENST00000548390 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
LETMD1-215ENST00000548390 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
LETMD1-215ENST00000548390 HMGXB3Q12766 1538 aa30.64■■■□□ 2.5
LETMD1-215ENST00000548390 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.33■■■□□ 2.45
LETMD1-215ENST00000548390 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.27■■■□□ 2.44
LETMD1-215ENST00000548390 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.89■■■□□ 2.37
LETMD1-215ENST00000548390 CFTRP13569 1480 aa29.87■■■□□ 2.37
LETMD1-215ENST00000548390 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.75■■■□□ 2.35
LETMD1-215ENST00000548390 NESP48681 1621 aa29.6■■■□□ 2.33
LETMD1-215ENST00000548390 PRDM2Q13029 1718 aa29.6■■■□□ 2.33
LETMD1-215ENST00000548390 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.57■■■□□ 2.32
LETMD1-215ENST00000548390 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.5■■■□□ 2.31
LETMD1-215ENST00000548390 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.49■■■□□ 2.31
LETMD1-215ENST00000548390 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.4■■■□□ 2.3
LETMD1-215ENST00000548390 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
LETMD1-215ENST00000548390 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
LETMD1-215ENST00000548390 ABCC8Q09428 1581 aa29.36■■■□□ 2.29
LETMD1-215ENST00000548390 TRIM41Q8WV44 630 aa29.32■■■□□ 2.28
LETMD1-215ENST00000548390 ERCC6Q03468 1493 aa29.25■■■□□ 2.27
LETMD1-215ENST00000548390 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.24■■■□□ 2.27
LETMD1-215ENST00000548390 TOP2BQ02880 1626 aa29.2■■■□□ 2.26
LETMD1-215ENST00000548390 CUX1P39880 1505 aa29.2■■■□□ 2.26
LETMD1-215ENST00000548390 SYNJ1O43426 1573 aa29.18■■■□□ 2.26
LETMD1-215ENST00000548390 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.17■■■□□ 2.26
LETMD1-215ENST00000548390 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.17■■■□□ 2.26
LETMD1-215ENST00000548390 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.16■■■□□ 2.26
LETMD1-215ENST00000548390 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
LETMD1-215ENST00000548390 TOPBP1Q92547 1522 aa29.12■■■□□ 2.25
LETMD1-215ENST00000548390 WDR62O43379 1518 aa29.03■■■□□ 2.24
LETMD1-215ENST00000548390 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
LETMD1-215ENST00000548390 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.98■■■□□ 2.23
LETMD1-215ENST00000548390 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
LETMD1-215ENST00000548390 SOGA1O94964 1423 aa28.86■■■□□ 2.21
LETMD1-215ENST00000548390 EEA1Q15075 1411 aa28.82■■■□□ 2.2
LETMD1-215ENST00000548390 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.79■■■□□ 2.2
LETMD1-215ENST00000548390 IFT140Q96RY7 1462 aa28.78■■■□□ 2.2
LETMD1-215ENST00000548390 CUX2O14529 1486 aa28.76■■■□□ 2.19
LETMD1-215ENST00000548390 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.76■■■□□ 2.19
LETMD1-215ENST00000548390 KIF27Q86VH2 1401 aa28.75■■■□□ 2.19
LETMD1-215ENST00000548390 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
LETMD1-215ENST00000548390 WDR97A6NE52 1622 aa28.64■■■□□ 2.18
LETMD1-215ENST00000548390 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.62■■■□□ 2.17
LETMD1-215ENST00000548390 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
LETMD1-215ENST00000548390 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.6■■■□□ 2.17
LETMD1-215ENST00000548390 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
LETMD1-215ENST00000548390 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.54■■■□□ 2.16
LETMD1-215ENST00000548390 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.53■■■□□ 2.16
LETMD1-215ENST00000548390 IGF1RP08069 1367 aa28.49■■■□□ 2.15
LETMD1-215ENST00000548390 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
LETMD1-215ENST00000548390 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.46■■■□□ 2.15
LETMD1-215ENST00000548390 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.149e-11■□□□□ 10.1
LETMD1-215ENST00000548390 GRIN2BQ13224 1484 aa28.43■■■□□ 2.14
LETMD1-215ENST00000548390 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
LETMD1-215ENST00000548390 PRXQ9BXM0 1461 aa28.39■■■□□ 2.13
LETMD1-215ENST00000548390 KIF21BO75037 1637 aa28.36■■■□□ 2.13
LETMD1-215ENST00000548390 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.35■■■□□ 2.13
LETMD1-215ENST00000548390 CUL7Q14999 1698 aa28.34■■■□□ 2.13
LETMD1-215ENST00000548390 PBRM1Q86U86 1689 aa28.31■■■□□ 2.12
LETMD1-215ENST00000548390 GOLGA3Q08378 1498 aa28.3■■■□□ 2.12
LETMD1-215ENST00000548390 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
LETMD1-215ENST00000548390 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.27■■■□□ 2.12
LETMD1-215ENST00000548390 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.26■■■□□ 2.12
LETMD1-215ENST00000548390 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.22■■■□□ 2.11
LETMD1-215ENST00000548390 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.22■■■□□ 2.11
LETMD1-215ENST00000548390 ADAMTS12P58397 1594 aa28.2■■■□□ 2.11
LETMD1-215ENST00000548390 SYNJ2O15056 1496 aa28.14■■■□□ 2.09
LETMD1-215ENST00000548390 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
LETMD1-215ENST00000548390 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.12■■■□□ 2.09
LETMD1-215ENST00000548390 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.1■■■□□ 2.09
LETMD1-215ENST00000548390 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
LETMD1-215ENST00000548390 GRIN2AQ12879 1464 aa28.03■■■□□ 2.08
LETMD1-215ENST00000548390 FBLN2P98095 1184 aa27.96■■■□□ 2.07
LETMD1-215ENST00000548390 NUP160Q12769 1436 aa27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms