RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546281.5

LMO3-234, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 496 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-234ENST00000546281 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.28■■■□□ 2.28
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LMO3-234ENST00000546281 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
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LMO3-234ENST00000546281 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.25■■□□□ 1.47
LMO3-234ENST00000546281 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.25■■□□□ 1.47
LMO3-234ENST00000546281 NACADO15069 1562 aa24.18■■□□□ 1.46
LMO3-234ENST00000546281 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.06■■□□□ 1.44
LMO3-234ENST00000546281 SCRIBQ14160 1630 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO3-234ENST00000546281 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.39■■□□□ 1.33
LMO3-234ENST00000546281 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.35■■□□□ 1.33
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LMO3-234ENST00000546281 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.31■■□□□ 1.32
LMO3-234ENST00000546281 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.77■■□□□ 1.24
LMO3-234ENST00000546281 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LMO3-234ENST00000546281 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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LMO3-234ENST00000546281 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.55■■□□□ 1.2
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LMO3-234ENST00000546281 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.46■■□□□ 1.19
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LMO3-234ENST00000546281 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.41■■□□□ 1.18
LMO3-234ENST00000546281 NCAPD3P42695 1498 aa22.38■■□□□ 1.17
LMO3-234ENST00000546281 SMARCA2P51531 1590 aa22.36■■□□□ 1.17
LMO3-234ENST00000546281 WIZO95785 1651 aa22.25■■□□□ 1.15
LMO3-234ENST00000546281 HMGXB3Q12766 1538 aa22.22■■□□□ 1.15
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LMO3-234ENST00000546281 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.61■■□□□ 1.05
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LMO3-234ENST00000546281 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.43■■□□□ 1.02
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LMO3-234ENST00000546281 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.33■■□□□ 1.01
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LMO3-234ENST00000546281 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.26■□□□□ 0.99
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LMO3-234ENST00000546281 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.88■□□□□ 0.93
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LMO3-234ENST00000546281 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.57■□□□□ 0.88
LMO3-234ENST00000546281 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.54■□□□□ 0.88
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LMO3-234ENST00000546281 OSCARQ8IYS5 282 aa20.28■□□□□ 0.84
LMO3-234ENST00000546281 KIF21BO75037 1637 aa20.27■□□□□ 0.84
LMO3-234ENST00000546281 GOLGA3Q08378 1498 aa20.22■□□□□ 0.83
LMO3-234ENST00000546281 CHD1O14646 1710 aa20.21■□□□□ 0.83
LMO3-234ENST00000546281 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.18■□□□□ 0.82
LMO3-234ENST00000546281 CEP170Q5SW79 1584 aa20.18■□□□□ 0.82
LMO3-234ENST00000546281 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.15■□□□□ 0.82
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