RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544685.2

SNHG21-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 21, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG21, Length 594 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG21-201ENST00000544685 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.09■■■■□ 3.05
SNHG21-201ENST00000544685 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.17■■■□□ 2.42
SNHG21-201ENST00000544685 ABCC9O60706 1549 aa29.49■■■□□ 2.31
SNHG21-201ENST00000544685 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SNHG21-201ENST00000544685 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.29■■■□□ 2.12
SNHG21-201ENST00000544685 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.28■■■□□ 2.12
SNHG21-201ENST00000544685 NACADO15069 1562 aa28.28■■■□□ 2.12
SNHG21-201ENST00000544685 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.21■■■□□ 2.11
SNHG21-201ENST00000544685 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.2■■■□□ 2.1
SNHG21-201ENST00000544685 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.58■■■□□ 2.01
SNHG21-201ENST00000544685 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
SNHG21-201ENST00000544685 SCRIBQ14160 1630 aa27.48■■□□□ 1.99
SNHG21-201ENST00000544685 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.34■■□□□ 1.97
SNHG21-201ENST00000544685 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.27■■□□□ 1.96
SNHG21-201ENST00000544685 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.15■■□□□ 1.94
SNHG21-201ENST00000544685 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SNHG21-201ENST00000544685 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.62■■□□□ 1.85
SNHG21-201ENST00000544685 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.49■■□□□ 1.83
SNHG21-201ENST00000544685 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SNHG21-201ENST00000544685 SMARCA4P51532 1647 aa26.36■■□□□ 1.81
SNHG21-201ENST00000544685 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.26■■□□□ 1.79
SNHG21-201ENST00000544685 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.16■■□□□ 1.78
SNHG21-201ENST00000544685 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.14■■□□□ 1.78
SNHG21-201ENST00000544685 SMARCA2P51531 1590 aa26.13■■□□□ 1.77
SNHG21-201ENST00000544685 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SNHG21-201ENST00000544685 NCAPD3P42695 1498 aa26.11■■□□□ 1.77
SNHG21-201ENST00000544685 HMGXB3Q12766 1538 aa26■■□□□ 1.75
SNHG21-201ENST00000544685 WIZO95785 1651 aa25.97■■□□□ 1.75
SNHG21-201ENST00000544685 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SNHG21-201ENST00000544685 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SNHG21-201ENST00000544685 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SNHG21-201ENST00000544685 ERCC6Q03468 1493 aa25.47■■□□□ 1.67
SNHG21-201ENST00000544685 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.44■■□□□ 1.66
SNHG21-201ENST00000544685 NESP48681 1621 aa25.41■■□□□ 1.66
SNHG21-201ENST00000544685 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.34■■□□□ 1.65
SNHG21-201ENST00000544685 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.34■■□□□ 1.65
SNHG21-201ENST00000544685 CFTRP13569 1480 aa25.28■■□□□ 1.64
SNHG21-201ENST00000544685 CUX2O14529 1486 aa25.19■■□□□ 1.62
SNHG21-201ENST00000544685 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.14■■□□□ 1.62
SNHG21-201ENST00000544685 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.13■■□□□ 1.61
SNHG21-201ENST00000544685 PRDM2Q13029 1718 aa25.08■■□□□ 1.61
SNHG21-201ENST00000544685 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SNHG21-201ENST00000544685 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.02■■□□□ 1.6
SNHG21-201ENST00000544685 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.96■■□□□ 1.59
SNHG21-201ENST00000544685 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.85■■□□□ 1.57
SNHG21-201ENST00000544685 WDR62O43379 1518 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG21-201ENST00000544685 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.77■■□□□ 1.56
SNHG21-201ENST00000544685 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SNHG21-201ENST00000544685 ABCC8Q09428 1581 aa24.72■■□□□ 1.55
SNHG21-201ENST00000544685 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.68■■□□□ 1.54
SNHG21-201ENST00000544685 TOPBP1Q92547 1522 aa24.66■■□□□ 1.54
SNHG21-201ENST00000544685 CUX1P39880 1505 aa24.61■■□□□ 1.53
SNHG21-201ENST00000544685 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
SNHG21-201ENST00000544685 TOP2BQ02880 1626 aa24.52■■□□□ 1.52
SNHG21-201ENST00000544685 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.51■■□□□ 1.51
SNHG21-201ENST00000544685 SYNJ1O43426 1573 aa24.5■■□□□ 1.51
SNHG21-201ENST00000544685 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SNHG21-201ENST00000544685 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.46■■□□□ 1.51
SNHG21-201ENST00000544685 IFT140Q96RY7 1462 aa24.44■■□□□ 1.5
SNHG21-201ENST00000544685 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SNHG21-201ENST00000544685 SOGA1O94964 1423 aa24.38■■□□□ 1.49
SNHG21-201ENST00000544685 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.34■■□□□ 1.49
SNHG21-201ENST00000544685 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.28■■□□□ 1.48
SNHG21-201ENST00000544685 WDR97A6NE52 1622 aa24.27■■□□□ 1.48
SNHG21-201ENST00000544685 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SNHG21-201ENST00000544685 TRIM41Q8WV44 630 aa24.23■■□□□ 1.47
SNHG21-201ENST00000544685 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SNHG21-201ENST00000544685 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.18■■□□□ 1.46
SNHG21-201ENST00000544685 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SNHG21-201ENST00000544685 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.462e-6■■■■■ 31.8
SNHG21-201ENST00000544685 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.14■■□□□ 1.46
SNHG21-201ENST00000544685 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.11■■□□□ 1.45
SNHG21-201ENST00000544685 OSCARQ8IYS5 282 aa24.09■■□□□ 1.45
SNHG21-201ENST00000544685 GRIN2BQ13224 1484 aa24.07■■□□□ 1.44
SNHG21-201ENST00000544685 KIF27Q86VH2 1401 aa24.06■■□□□ 1.44
SNHG21-201ENST00000544685 PBRM1Q86U86 1689 aa24.02■■□□□ 1.44
SNHG21-201ENST00000544685 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24■■□□□ 1.43
SNHG21-201ENST00000544685 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SNHG21-201ENST00000544685 CHD1O14646 1710 aa23.98■■□□□ 1.43
SNHG21-201ENST00000544685 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.96■■□□□ 1.43
SNHG21-201ENST00000544685 FBLN2P98095 1184 aa23.95■■□□□ 1.42
SNHG21-201ENST00000544685 IGF1RP08069 1367 aa23.92■■□□□ 1.42
SNHG21-201ENST00000544685 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.91■■□□□ 1.42
SNHG21-201ENST00000544685 SYNJ2O15056 1496 aa23.87■■□□□ 1.41
SNHG21-201ENST00000544685 ADAMTS12P58397 1594 aa23.87■■□□□ 1.41
SNHG21-201ENST00000544685 EEA1Q15075 1411 aa23.87■■□□□ 1.41
SNHG21-201ENST00000544685 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.86■■□□□ 1.41
SNHG21-201ENST00000544685 CUL7Q14999 1698 aa23.84■■□□□ 1.41
SNHG21-201ENST00000544685 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.84■■□□□ 1.41
SNHG21-201ENST00000544685 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.84■■□□□ 1.41
SNHG21-201ENST00000544685 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.84■■□□□ 1.41
SNHG21-201ENST00000544685 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SNHG21-201ENST00000544685 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.77■■□□□ 1.4
SNHG21-201ENST00000544685 ARHGEF11O15085 1522 aa23.76■■□□□ 1.39
SNHG21-201ENST00000544685 GRIN2AQ12879 1464 aa23.75■■□□□ 1.39
SNHG21-201ENST00000544685 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.74■■□□□ 1.39
SNHG21-201ENST00000544685 PRXQ9BXM0 1461 aa23.71■■□□□ 1.39
SNHG21-201ENST00000544685 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.68■■□□□ 1.38
SNHG21-201ENST00000544685 NUP160Q12769 1436 aa23.66■■□□□ 1.38
SNHG21-201ENST00000544685 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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