RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541699.1

PGA3-206, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2

Gene PGA3, Length 925 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-206ENST00000541699 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.02■■■□□ 2.56
PGA3-206ENST00000541699 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.34■■□□□ 1.97
PGA3-206ENST00000541699 ABCC9O60706 1549 aa26.27■■□□□ 1.8
PGA3-206ENST00000541699 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PGA3-206ENST00000541699 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.73■■□□□ 1.71
PGA3-206ENST00000541699 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.69■■□□□ 1.7
PGA3-206ENST00000541699 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.64■■□□□ 1.7
PGA3-206ENST00000541699 NACADO15069 1562 aa25.63■■□□□ 1.69
PGA3-206ENST00000541699 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.51■■□□□ 1.67
PGA3-206ENST00000541699 SCRIBQ14160 1630 aa24.9■■□□□ 1.58
PGA3-206ENST00000541699 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.88■■□□□ 1.57
PGA3-206ENST00000541699 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.74■■□□□ 1.55
PGA3-206ENST00000541699 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.66■■□□□ 1.54
PGA3-206ENST00000541699 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
PGA3-206ENST00000541699 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.09■■□□□ 1.45
PGA3-206ENST00000541699 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PGA3-206ENST00000541699 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PGA3-206ENST00000541699 SMARCA4P51532 1647 aa23.93■■□□□ 1.42
PGA3-206ENST00000541699 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.88■■□□□ 1.41
PGA3-206ENST00000541699 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PGA3-206ENST00000541699 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.8■■□□□ 1.4
PGA3-206ENST00000541699 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.76■■□□□ 1.39
PGA3-206ENST00000541699 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.75■■□□□ 1.39
PGA3-206ENST00000541699 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.73■■□□□ 1.39
PGA3-206ENST00000541699 SMARCA2P51531 1590 aa23.7■■□□□ 1.38
PGA3-206ENST00000541699 NCAPD3P42695 1498 aa23.68■■□□□ 1.38
PGA3-206ENST00000541699 WIZO95785 1651 aa23.61■■□□□ 1.37
PGA3-206ENST00000541699 HMGXB3Q12766 1538 aa23.56■■□□□ 1.36
PGA3-206ENST00000541699 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PGA3-206ENST00000541699 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PGA3-206ENST00000541699 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PGA3-206ENST00000541699 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.17■■□□□ 1.3
PGA3-206ENST00000541699 CADPSQ9ULU8 1353 aa23■■□□□ 1.27
PGA3-206ENST00000541699 CFTRP13569 1480 aa22.96■■□□□ 1.27
PGA3-206ENST00000541699 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.93■■□□□ 1.26
PGA3-206ENST00000541699 NESP48681 1621 aa22.87■■□□□ 1.25
PGA3-206ENST00000541699 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.76■■□□□ 1.23
PGA3-206ENST00000541699 PRDM2Q13029 1718 aa22.72■■□□□ 1.23
PGA3-206ENST00000541699 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.68■■□□□ 1.22
PGA3-206ENST00000541699 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.6■■□□□ 1.21
PGA3-206ENST00000541699 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.58■■□□□ 1.21
PGA3-206ENST00000541699 ERCC6Q03468 1493 aa22.58■■□□□ 1.2
PGA3-206ENST00000541699 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.48■■□□□ 1.19
PGA3-206ENST00000541699 ABCC8Q09428 1581 aa22.45■■□□□ 1.18
PGA3-206ENST00000541699 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PGA3-206ENST00000541699 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PGA3-206ENST00000541699 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
PGA3-206ENST00000541699 WDR62O43379 1518 aa22.41■■□□□ 1.18
PGA3-206ENST00000541699 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.38■■□□□ 1.17
PGA3-206ENST00000541699 CUX1P39880 1505 aa22.37■■□□□ 1.17
PGA3-206ENST00000541699 TOPBP1Q92547 1522 aa22.37■■□□□ 1.17
PGA3-206ENST00000541699 TOP2BQ02880 1626 aa22.31■■□□□ 1.16
PGA3-206ENST00000541699 SYNJ1O43426 1573 aa22.3■■□□□ 1.16
PGA3-206ENST00000541699 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.29■■□□□ 1.16
PGA3-206ENST00000541699 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.26■■□□□ 1.15
PGA3-206ENST00000541699 CUX2O14529 1486 aa22.25■■□□□ 1.15
PGA3-206ENST00000541699 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PGA3-206ENST00000541699 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.22■■□□□ 1.15
PGA3-206ENST00000541699 TRIM41Q8WV44 630 aa22.2■■□□□ 1.14
PGA3-206ENST00000541699 SOGA1O94964 1423 aa22.14■■□□□ 1.14
PGA3-206ENST00000541699 IFT140Q96RY7 1462 aa22.13■■□□□ 1.13
PGA3-206ENST00000541699 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PGA3-206ENST00000541699 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.09■■□□□ 1.13
PGA3-206ENST00000541699 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.06■■□□□ 1.12
PGA3-206ENST00000541699 WDR97A6NE52 1622 aa21.99■■□□□ 1.11
PGA3-206ENST00000541699 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PGA3-206ENST00000541699 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PGA3-206ENST00000541699 KIF27Q86VH2 1401 aa21.92■■□□□ 1.1
PGA3-206ENST00000541699 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
PGA3-206ENST00000541699 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.9■■□□□ 1.1
PGA3-206ENST00000541699 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.9■■□□□ 1.1
PGA3-206ENST00000541699 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PGA3-206ENST00000541699 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.84■■□□□ 1.09
PGA3-206ENST00000541699 EEA1Q15075 1411 aa21.83■■□□□ 1.09
PGA3-206ENST00000541699 GRIN2BQ13224 1484 aa21.83■■□□□ 1.08
PGA3-206ENST00000541699 IGF1RP08069 1367 aa21.81■■□□□ 1.08
PGA3-206ENST00000541699 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.8■■□□□ 1.08
PGA3-206ENST00000541699 PBRM1Q86U86 1689 aa21.74■■□□□ 1.07
PGA3-206ENST00000541699 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PGA3-206ENST00000541699 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.73■■□□□ 1.07
PGA3-206ENST00000541699 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.69■■□□□ 1.06
PGA3-206ENST00000541699 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.66■■□□□ 1.06
PGA3-206ENST00000541699 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.66■■□□□ 1.06
PGA3-206ENST00000541699 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PGA3-206ENST00000541699 CUL7Q14999 1698 aa21.65■■□□□ 1.06
PGA3-206ENST00000541699 PRXQ9BXM0 1461 aa21.64■■□□□ 1.06
PGA3-206ENST00000541699 ADAMTS12P58397 1594 aa21.64■■□□□ 1.05
PGA3-206ENST00000541699 SYNJ2O15056 1496 aa21.63■■□□□ 1.05
PGA3-206ENST00000541699 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PGA3-206ENST00000541699 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.57■■□□□ 1.04
PGA3-206ENST00000541699 GRIN2AQ12879 1464 aa21.54■■□□□ 1.04
PGA3-206ENST00000541699 KIF21BO75037 1637 aa21.53■■□□□ 1.04
PGA3-206ENST00000541699 FBLN2P98095 1184 aa21.51■■□□□ 1.03
PGA3-206ENST00000541699 CHD1O14646 1710 aa21.48■■□□□ 1.03
PGA3-206ENST00000541699 NUP160Q12769 1436 aa21.46■■□□□ 1.03
PGA3-206ENST00000541699 OSCARQ8IYS5 282 aa21.43■■□□□ 1.02
PGA3-206ENST00000541699 GOLGA3Q08378 1498 aa21.43■■□□□ 1.02
PGA3-206ENST00000541699 CEP170Q5SW79 1584 aa21.39■■□□□ 1.01
PGA3-206ENST00000541699 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.37■■□□□ 1.01
PGA3-206ENST00000541699 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.33■■□□□ 1
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