RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539149.1

ADD1-225, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 2

Gene ADD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-225ENST00000539149 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.46■■■■□ 3.43
ADD1-225ENST00000539149 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.44■■■□□ 2.78
ADD1-225ENST00000539149 ABCC9O60706 1549 aa32.02■■■□□ 2.72
ADD1-225ENST00000539149 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.8■■■□□ 2.52
ADD1-225ENST00000539149 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.72■■■□□ 2.51
ADD1-225ENST00000539149 NACADO15069 1562 aa30.64■■■□□ 2.5
ADD1-225ENST00000539149 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.37■■■□□ 2.45
ADD1-225ENST00000539149 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
ADD1-225ENST00000539149 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.16■■■□□ 2.42
ADD1-225ENST00000539149 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.98■■■□□ 2.39
ADD1-225ENST00000539149 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.84■■■□□ 2.37
ADD1-225ENST00000539149 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.69■■■□□ 2.34
ADD1-225ENST00000539149 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.62■■■□□ 2.33
ADD1-225ENST00000539149 SCRIBQ14160 1630 aa29.6■■■□□ 2.33
ADD1-225ENST00000539149 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.46■■■□□ 2.31
ADD1-225ENST00000539149 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ADD1-225ENST00000539149 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.91■■■□□ 2.22
ADD1-225ENST00000539149 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.82■■■□□ 2.2
ADD1-225ENST00000539149 NCAPD3P42695 1498 aa28.3■■■□□ 2.12
ADD1-225ENST00000539149 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
ADD1-225ENST00000539149 SMARCA4P51532 1647 aa28.29■■■□□ 2.12
ADD1-225ENST00000539149 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.25■■■□□ 2.11
ADD1-225ENST00000539149 SMARCA2P51531 1590 aa28.22■■■□□ 2.11
ADD1-225ENST00000539149 HMGXB3Q12766 1538 aa28.07■■■□□ 2.08
ADD1-225ENST00000539149 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.07■■■□□ 2.08
ADD1-225ENST00000539149 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
ADD1-225ENST00000539149 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.01■■■□□ 2.07
ADD1-225ENST00000539149 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
ADD1-225ENST00000539149 WIZO95785 1651 aa27.72■■■□□ 2.03
ADD1-225ENST00000539149 ERCC6Q03468 1493 aa27.69■■■□□ 2.02
ADD1-225ENST00000539149 NESP48681 1621 aa27.6■■■□□ 2.01
ADD1-225ENST00000539149 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.55■■■□□ 2
ADD1-225ENST00000539149 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.5■■□□□ 1.99
ADD1-225ENST00000539149 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.48■■□□□ 1.99
ADD1-225ENST00000539149 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
ADD1-225ENST00000539149 CUX2O14529 1486 aa27.43■■□□□ 1.98
ADD1-225ENST00000539149 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.31■■□□□ 1.96
ADD1-225ENST00000539149 CFTRP13569 1480 aa27.23■■□□□ 1.95
ADD1-225ENST00000539149 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.21■■□□□ 1.95
ADD1-225ENST00000539149 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.19■■□□□ 1.94
ADD1-225ENST00000539149 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
ADD1-225ENST00000539149 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.14■■□□□ 1.94
ADD1-225ENST00000539149 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.13■■□□□ 1.93
ADD1-225ENST00000539149 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.11■■□□□ 1.93
ADD1-225ENST00000539149 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
ADD1-225ENST00000539149 WDR62O43379 1518 aa26.97■■□□□ 1.91
ADD1-225ENST00000539149 PRDM2Q13029 1718 aa26.87■■□□□ 1.89
ADD1-225ENST00000539149 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ADD1-225ENST00000539149 ABCC8Q09428 1581 aa26.75■■□□□ 1.87
ADD1-225ENST00000539149 TOPBP1Q92547 1522 aa26.65■■□□□ 1.86
ADD1-225ENST00000539149 IFT140Q96RY7 1462 aa26.58■■□□□ 1.85
ADD1-225ENST00000539149 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.58■■□□□ 1.85
ADD1-225ENST00000539149 OSCARQ8IYS5 282 aa26.41■■□□□ 1.82
ADD1-225ENST00000539149 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ADD1-225ENST00000539149 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ADD1-225ENST00000539149 SOGA1O94964 1423 aa26.39■■□□□ 1.82
ADD1-225ENST00000539149 CUX1P39880 1505 aa26.34■■□□□ 1.81
ADD1-225ENST00000539149 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
ADD1-225ENST00000539149 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.31■■□□□ 1.8
ADD1-225ENST00000539149 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.81e-13■■■■□ 26.7
ADD1-225ENST00000539149 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.3■■□□□ 1.8
ADD1-225ENST00000539149 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
ADD1-225ENST00000539149 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
ADD1-225ENST00000539149 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
ADD1-225ENST00000539149 FBLN2P98095 1184 aa26.17■■□□□ 1.78
ADD1-225ENST00000539149 WDR97A6NE52 1622 aa26.15■■□□□ 1.78
ADD1-225ENST00000539149 GRIN2BQ13224 1484 aa26.07■■□□□ 1.76
ADD1-225ENST00000539149 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ADD1-225ENST00000539149 TOP2BQ02880 1626 aa26.06■■□□□ 1.76
ADD1-225ENST00000539149 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.06■■□□□ 1.76
ADD1-225ENST00000539149 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
ADD1-225ENST00000539149 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.02■■□□□ 1.76
ADD1-225ENST00000539149 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.01■■□□□ 1.75
ADD1-225ENST00000539149 SYNJ1O43426 1573 aa26■■□□□ 1.75
ADD1-225ENST00000539149 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
ADD1-225ENST00000539149 TRIM41Q8WV44 630 aa25.99■■□□□ 1.75
ADD1-225ENST00000539149 CHD1O14646 1710 aa25.94■■□□□ 1.74
ADD1-225ENST00000539149 SYNJ2O15056 1496 aa25.91■■□□□ 1.74
ADD1-225ENST00000539149 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.88■■□□□ 1.73
ADD1-225ENST00000539149 PBRM1Q86U86 1689 aa25.86■■□□□ 1.73
ADD1-225ENST00000539149 ARHGEF11O15085 1522 aa25.78■■□□□ 1.72
ADD1-225ENST00000539149 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
ADD1-225ENST00000539149 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
ADD1-225ENST00000539149 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
ADD1-225ENST00000539149 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.76■■□□□ 1.71
ADD1-225ENST00000539149 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.75■■□□□ 1.71
ADD1-225ENST00000539149 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.73■■□□□ 1.71
ADD1-225ENST00000539149 GRIN2AQ12879 1464 aa25.7■■□□□ 1.7
ADD1-225ENST00000539149 KIF27Q86VH2 1401 aa25.7■■□□□ 1.7
ADD1-225ENST00000539149 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.68■■□□□ 1.7
ADD1-225ENST00000539149 ADAMTS12P58397 1594 aa25.66■■□□□ 1.7
ADD1-225ENST00000539149 IGF1RP08069 1367 aa25.6■■□□□ 1.69
ADD1-225ENST00000539149 NUP160Q12769 1436 aa25.57■■□□□ 1.68
ADD1-225ENST00000539149 ARAP1Q96P48 1450 aa25.53■■□□□ 1.68
ADD1-225ENST00000539149 CEP170Q5SW79 1584 aa25.51■■□□□ 1.67
ADD1-225ENST00000539149 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.47■■□□□ 1.67
ADD1-225ENST00000539149 JPH4Q96JJ6 628 aa25.47■■□□□ 1.67
ADD1-225ENST00000539149 CUL7Q14999 1698 aa25.45■■□□□ 1.66
ADD1-225ENST00000539149 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
ADD1-225ENST00000539149 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms