RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.73■■■■■ 5.07
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.82■■■■■ 4.12
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCC9O60706 1549 aa38.8■■■■□ 3.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.69■■■■□ 3.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.64■■■■□ 3.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.26■■■■□ 3.72
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NACADO15069 1562 aa38.09■■■■□ 3.69
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.95■■■■□ 3.67
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.8■■■■□ 3.64
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SCRIBQ14160 1630 aa37.49■■■■□ 3.59
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.03■■■■□ 3.52
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.68■■■■□ 3.46
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.58■■■■□ 3.45
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.33■■■■□ 3.41
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.08■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SMARCA4P51532 1647 aa35.94■■■■□ 3.34
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WIZO95785 1651 aa35.78■■■■□ 3.32
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.53■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.43■■■■□ 3.26
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SMARCA2P51531 1590 aa35.38■■■■□ 3.26
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NCAPD3P42695 1498 aa35.17■■■■□ 3.22
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.11■■■■□ 3.21
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HMGXB3Q12766 1538 aa35.07■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.06■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.79■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.46■■■■□ 3.11
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CFTRP13569 1480 aa34.33■■■■□ 3.09
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TRIM41Q8WV44 630 aa34.29■■■■□ 3.08
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.26■■■■□ 3.07
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCC8Q09428 1581 aa34.22■■■■□ 3.07
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PRDM2Q13029 1718 aa34.1■■■■□ 3.05
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.04■■■■□ 3.04
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NESP48681 1621 aa34■■■■□ 3.03
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.99■■■■□ 3.03
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SYNJ1O43426 1573 aa33.9■■■■□ 3.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.86■■■■□ 3.01
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TOP2BQ02880 1626 aa33.79■■■■□ 3
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CUX1P39880 1505 aa33.75■■■□□ 2.99
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.75■■■□□ 2.99
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.74■■■□□ 2.99
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.65■■■□□ 2.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.57■■■□□ 2.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SOGA1O94964 1423 aa33.56■■■□□ 2.96
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.5■■■□□ 2.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TOPBP1Q92547 1522 aa33.46■■■□□ 2.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.46■■■□□ 2.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.45■■■□□ 2.95
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EEA1Q15075 1411 aa33.44■■■□□ 2.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.41■■■□□ 2.94
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.33■■■□□ 2.93
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.3■■■□□ 2.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ERCC6Q03468 1493 aa33.28■■■□□ 2.92
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIF27Q86VH2 1401 aa33.21■■■□□ 2.91
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.18■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.16■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CUX2O14529 1486 aa33.15■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WDR62O43379 1518 aa33.13■■■□□ 2.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.12■■■□□ 2.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WDR97A6NE52 1622 aa33■■■□□ 2.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIF21BO75037 1637 aa33■■■□□ 2.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IGF1RP08069 1367 aa32.96■■■□□ 2.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GOLGA3Q08378 1498 aa32.96■■■□□ 2.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PRXQ9BXM0 1461 aa32.93■■■□□ 2.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.88■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IFT140Q96RY7 1462 aa32.87■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.85■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.85■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.83■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.82■■■□□ 2.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.78■■■□□ 2.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.72■■■□□ 2.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CUL7Q14999 1698 aa32.68■■■□□ 2.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CEP162Q5TB80 1403 aa32.63■■■□□ 2.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PBRM1Q86U86 1689 aa32.61■■■□□ 2.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GRIN2BQ13224 1484 aa32.59■■■□□ 2.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.46■■■□□ 2.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CLIP1P30622 1438 aa32.43■■■□□ 2.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ADAMTS12P58397 1594 aa32.42■■■□□ 2.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.38■■■□□ 2.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.28■■■□□ 2.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SYNJ2O15056 1496 aa32.21■■■□□ 2.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GRIN2AQ12879 1464 aa32.19■■■□□ 2.74
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