RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538043.1

SLC35E3-205, Transcript of solute carrier family 35 member E3, humanhuman

TSL 3

Gene SLC35E3, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E3-205ENST00000538043 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.39■■■□□ 2.61
SLC35E3-205ENST00000538043 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.83■■■□□ 2.05
SLC35E3-205ENST00000538043 ABCC9O60706 1549 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC35E3-205ENST00000538043 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SLC35E3-205ENST00000538043 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC35E3-205ENST00000538043 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC35E3-205ENST00000538043 NACADO15069 1562 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC35E3-205ENST00000538043 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC35E3-205ENST00000538043 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26■■□□□ 1.75
SLC35E3-205ENST00000538043 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC35E3-205ENST00000538043 SCRIBQ14160 1630 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC35E3-205ENST00000538043 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC35E3-205ENST00000538043 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC35E3-205ENST00000538043 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
SLC35E3-205ENST00000538043 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SLC35E3-205ENST00000538043 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SLC35E3-205ENST00000538043 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC35E3-205ENST00000538043 SMARCA4P51532 1647 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC35E3-205ENST00000538043 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC35E3-205ENST00000538043 SMARCA2P51531 1590 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC35E3-205ENST00000538043 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC35E3-205ENST00000538043 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.08■■□□□ 1.44
SLC35E3-205ENST00000538043 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.03■■□□□ 1.44
SLC35E3-205ENST00000538043 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.03■■□□□ 1.44
SLC35E3-205ENST00000538043 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SLC35E3-205ENST00000538043 NCAPD3P42695 1498 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC35E3-205ENST00000538043 HMGXB3Q12766 1538 aa23.95■■□□□ 1.43
SLC35E3-205ENST00000538043 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SLC35E3-205ENST00000538043 WIZO95785 1651 aa23.88■■□□□ 1.41
SLC35E3-205ENST00000538043 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SLC35E3-205ENST00000538043 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SLC35E3-205ENST00000538043 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC35E3-205ENST00000538043 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.35■■□□□ 1.33
SLC35E3-205ENST00000538043 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC35E3-205ENST00000538043 CFTRP13569 1480 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC35E3-205ENST00000538043 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.2■■□□□ 1.3
SLC35E3-205ENST00000538043 PRDM2Q13029 1718 aa23.17■■□□□ 1.3
SLC35E3-205ENST00000538043 NESP48681 1621 aa23.16■■□□□ 1.3
SLC35E3-205ENST00000538043 ERCC6Q03468 1493 aa23.08■■□□□ 1.29
SLC35E3-205ENST00000538043 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC35E3-205ENST00000538043 CEP164Q9UPV0 1460 aa23■■□□□ 1.27
SLC35E3-205ENST00000538043 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.97■■□□□ 1.27
SLC35E3-205ENST00000538043 ABCC8Q09428 1581 aa22.88■■□□□ 1.25
SLC35E3-205ENST00000538043 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.87■■□□□ 1.25
SLC35E3-205ENST00000538043 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SLC35E3-205ENST00000538043 WDR62O43379 1518 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC35E3-205ENST00000538043 CUX2O14529 1486 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC35E3-205ENST00000538043 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC35E3-205ENST00000538043 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SLC35E3-205ENST00000538043 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
SLC35E3-205ENST00000538043 TOPBP1Q92547 1522 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC35E3-205ENST00000538043 CUX1P39880 1505 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC35E3-205ENST00000538043 TOP2BQ02880 1626 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC35E3-205ENST00000538043 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC35E3-205ENST00000538043 SYNJ1O43426 1573 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC35E3-205ENST00000538043 IFT140Q96RY7 1462 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC35E3-205ENST00000538043 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SLC35E3-205ENST00000538043 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC35E3-205ENST00000538043 SOGA1O94964 1423 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC35E3-205ENST00000538043 TRIM41Q8WV44 630 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC35E3-205ENST00000538043 WDR97A6NE52 1622 aa22.42■■□□□ 1.18
SLC35E3-205ENST00000538043 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SLC35E3-205ENST00000538043 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.36■■□□□ 1.17
SLC35E3-205ENST00000538043 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC35E3-205ENST00000538043 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.33■■□□□ 1.17
SLC35E3-205ENST00000538043 KIF27Q86VH2 1401 aa22.24■■□□□ 1.15
SLC35E3-205ENST00000538043 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SLC35E3-205ENST00000538043 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SLC35E3-205ENST00000538043 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SLC35E3-205ENST00000538043 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC35E3-205ENST00000538043 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.2■■□□□ 1.15
SLC35E3-205ENST00000538043 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SLC35E3-205ENST00000538043 GRIN2BQ13224 1484 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC35E3-205ENST00000538043 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC35E3-205ENST00000538043 EEA1Q15075 1411 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC35E3-205ENST00000538043 PBRM1Q86U86 1689 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC35E3-205ENST00000538043 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC35E3-205ENST00000538043 CUL7Q14999 1698 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC35E3-205ENST00000538043 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E3-205ENST00000538043 IGF1RP08069 1367 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC35E3-205ENST00000538043 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22■■□□□ 1.11
SLC35E3-205ENST00000538043 SYNJ2O15056 1496 aa22■■□□□ 1.11
SLC35E3-205ENST00000538043 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SLC35E3-205ENST00000538043 ADAMTS12P58397 1594 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC35E3-205ENST00000538043 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC35E3-205ENST00000538043 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC35E3-205ENST00000538043 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC35E3-205ENST00000538043 FBLN2P98095 1184 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC35E3-205ENST00000538043 CHD1O14646 1710 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC35E3-205ENST00000538043 GRIN2AQ12879 1464 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC35E3-205ENST00000538043 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC35E3-205ENST00000538043 OSCARQ8IYS5 282 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC35E3-205ENST00000538043 PRXQ9BXM0 1461 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC35E3-205ENST00000538043 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC35E3-205ENST00000538043 KIF21BO75037 1637 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC35E3-205ENST00000538043 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SLC35E3-205ENST00000538043 NUP160Q12769 1436 aa21.75■■□□□ 1.07
SLC35E3-205ENST00000538043 GOLGA3Q08378 1498 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC35E3-205ENST00000538043 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.69■■□□□ 1.06
SLC35E3-205ENST00000538043 CEP170Q5SW79 1584 aa21.68■■□□□ 1.06
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