RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535551.1

PGA3-202, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 3

Gene PGA3, Length 1,449 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PGA3-202ENST00000535551 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.42■□□□□ 0.86
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PGA3-202ENST00000535551 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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PGA3-202ENST00000535551 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.72■□□□□ 0.75
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PGA3-202ENST00000535551 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.98■□□□□ 0.63
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PGA3-202ENST00000535551 ERCC6Q03468 1493 aa18.21■□□□□ 0.51
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PGA3-202ENST00000535551 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.1■□□□□ 0.49
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PGA3-202ENST00000535551 CEP164Q9UPV0 1460 aa18■□□□□ 0.47
PGA3-202ENST00000535551 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.99■□□□□ 0.47
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PGA3-202ENST00000535551 TOPBP1Q92547 1522 aa17.71■□□□□ 0.43
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PGA3-202ENST00000535551 SOGA1O94964 1423 aa17.46■□□□□ 0.39
PGA3-202ENST00000535551 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
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PGA3-202ENST00000535551 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.33■□□□□ 0.37
PGA3-202ENST00000535551 GRIN2BQ13224 1484 aa17.31■□□□□ 0.36
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PGA3-202ENST00000535551 PBRM1Q86U86 1689 aa17.3■□□□□ 0.36
PGA3-202ENST00000535551 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.29■□□□□ 0.36
PGA3-202ENST00000535551 OSCARQ8IYS5 282 aa17.25■□□□□ 0.35
PGA3-202ENST00000535551 CHD1O14646 1710 aa17.25■□□□□ 0.35
PGA3-202ENST00000535551 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.23■□□□□ 0.35
PGA3-202ENST00000535551 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.21■□□□□ 0.35
PGA3-202ENST00000535551 SYNJ2O15056 1496 aa17.21■□□□□ 0.35
PGA3-202ENST00000535551 ADAMTS12P58397 1594 aa17.15■□□□□ 0.34
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PGA3-202ENST00000535551 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
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PGA3-202ENST00000535551 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.08■□□□□ 0.32
PGA3-202ENST00000535551 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.08■□□□□ 0.32
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PGA3-202ENST00000535551 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.05■□□□□ 0.32
PGA3-202ENST00000535551 TRIM41Q8WV44 630 aa17.04■□□□□ 0.32
PGA3-202ENST00000535551 NUP160Q12769 1436 aa17.02■□□□□ 0.32
PGA3-202ENST00000535551 ARHGEF11O15085 1522 aa17.01■□□□□ 0.31
PGA3-202ENST00000535551 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17■□□□□ 0.31
PGA3-202ENST00000535551 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17■□□□□ 0.31
PGA3-202ENST00000535551 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17■□□□□ 0.31
PGA3-202ENST00000535551 IGF1RP08069 1367 aa17■□□□□ 0.31
PGA3-202ENST00000535551 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.99■□□□□ 0.31
PGA3-202ENST00000535551 CEP170Q5SW79 1584 aa16.98■□□□□ 0.31
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