RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533922.5

AP000911.1-201, humanhuman

TSL 2

Gene AP000911.1, Length 2,206 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000911.1-201ENST00000533922 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.93■■■□□ 2.54
AP000911.1-201ENST00000533922 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.7■■□□□ 1.87
AP000911.1-201ENST00000533922 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
AP000911.1-201ENST00000533922 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.86■■□□□ 1.73
AP000911.1-201ENST00000533922 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.74■■□□□ 1.71
AP000911.1-201ENST00000533922 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.41■■□□□ 1.66
AP000911.1-201ENST00000533922 ABCC9O60706 1549 aa25.36■■□□□ 1.65
AP000911.1-201ENST00000533922 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.98■■□□□ 1.59
AP000911.1-201ENST00000533922 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
AP000911.1-201ENST00000533922 NACADO15069 1562 aa24.87■■□□□ 1.57
AP000911.1-201ENST00000533922 SCRIBQ14160 1630 aa24.85■■□□□ 1.57
AP000911.1-201ENST00000533922 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.64■■□□□ 1.54
AP000911.1-201ENST00000533922 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.21■■□□□ 1.47
AP000911.1-201ENST00000533922 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
AP000911.1-201ENST00000533922 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.15■■□□□ 1.46
AP000911.1-201ENST00000533922 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
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AP000911.1-201ENST00000533922 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.96■■□□□ 1.43
AP000911.1-201ENST00000533922 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.83■■□□□ 1.4
AP000911.1-201ENST00000533922 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
AP000911.1-201ENST00000533922 WIZO95785 1651 aa23.82■■□□□ 1.4
AP000911.1-201ENST00000533922 SMARCA4P51532 1647 aa23.72■■□□□ 1.39
AP000911.1-201ENST00000533922 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
AP000911.1-201ENST00000533922 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.33■■□□□ 1.33
AP000911.1-201ENST00000533922 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.31■■□□□ 1.32
AP000911.1-201ENST00000533922 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.31■■□□□ 1.32
AP000911.1-201ENST00000533922 SMARCA2P51531 1590 aa23.3■■□□□ 1.32
AP000911.1-201ENST00000533922 TRIM41Q8WV44 630 aa23.27■■□□□ 1.32
AP000911.1-201ENST00000533922 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
AP000911.1-201ENST00000533922 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
AP000911.1-201ENST00000533922 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.07■■□□□ 1.28
AP000911.1-201ENST00000533922 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
AP000911.1-201ENST00000533922 NCAPD3P42695 1498 aa23■■□□□ 1.27
AP000911.1-201ENST00000533922 ABCC8Q09428 1581 aa22.99■■□□□ 1.27
AP000911.1-201ENST00000533922 HMGXB3Q12766 1538 aa22.93■■□□□ 1.26
AP000911.1-201ENST00000533922 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.85■■□□□ 1.25
AP000911.1-201ENST00000533922 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.83■■□□□ 1.25
AP000911.1-201ENST00000533922 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
AP000911.1-201ENST00000533922 SYNJ1O43426 1573 aa22.63■■□□□ 1.21
AP000911.1-201ENST00000533922 SOGA1O94964 1423 aa22.62■■□□□ 1.21
AP000911.1-201ENST00000533922 CFTRP13569 1480 aa22.58■■□□□ 1.21
AP000911.1-201ENST00000533922 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.55■■□□□ 1.2
AP000911.1-201ENST00000533922 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.5■■□□□ 1.19
AP000911.1-201ENST00000533922 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.46■■□□□ 1.19
AP000911.1-201ENST00000533922 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.45■■□□□ 1.18
AP000911.1-201ENST00000533922 TOP2BQ02880 1626 aa22.44■■□□□ 1.18
AP000911.1-201ENST00000533922 EEA1Q15075 1411 aa22.4■■□□□ 1.18
AP000911.1-201ENST00000533922 CUX1P39880 1505 aa22.39■■□□□ 1.18
AP000911.1-201ENST00000533922 PRDM2Q13029 1718 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000911.1-201ENST00000533922 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.38■■□□□ 1.17
AP000911.1-201ENST00000533922 NESP48681 1621 aa22.35■■□□□ 1.17
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AP000911.1-201ENST00000533922 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.18■■□□□ 1.14
AP000911.1-201ENST00000533922 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.16■■□□□ 1.14
AP000911.1-201ENST00000533922 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.16■■□□□ 1.14
AP000911.1-201ENST00000533922 CEP162Q5TB80 1403 aa22.14■■□□□ 1.13
AP000911.1-201ENST00000533922 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.12■■□□□ 1.13
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AP000911.1-201ENST00000533922 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.11■■□□□ 1.13
AP000911.1-201ENST00000533922 KIF27Q86VH2 1401 aa22.1■■□□□ 1.13
AP000911.1-201ENST00000533922 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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AP000911.1-201ENST00000533922 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.04■■□□□ 1.12
AP000911.1-201ENST00000533922 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.04■■□□□ 1.12
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AP000911.1-201ENST00000533922 TOPBP1Q92547 1522 aa22.04■■□□□ 1.12
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AP000911.1-201ENST00000533922 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.99■■□□□ 1.11
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AP000911.1-201ENST00000533922 HRCP23327 699 aa21.93■■□□□ 1.1
AP000911.1-201ENST00000533922 CLIP1P30622 1438 aa21.91■■□□□ 1.1
AP000911.1-201ENST00000533922 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.91■■□□□ 1.1
AP000911.1-201ENST00000533922 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
AP000911.1-201ENST00000533922 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.85■■□□□ 1.09
AP000911.1-201ENST00000533922 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.83■■□□□ 1.09
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AP000911.1-201ENST00000533922 WDR97A6NE52 1622 aa21.72■■□□□ 1.07
AP000911.1-201ENST00000533922 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.7■■□□□ 1.06
AP000911.1-201ENST00000533922 ERCC6Q03468 1493 aa21.68■■□□□ 1.06
AP000911.1-201ENST00000533922 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.67■■□□□ 1.06
AP000911.1-201ENST00000533922 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
AP000911.1-201ENST00000533922 ARAP1Q96P48 1450 aa21.65■■□□□ 1.06
AP000911.1-201ENST00000533922 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.64■■□□□ 1.05
AP000911.1-201ENST00000533922 APLP2Q06481 763 aa21.61■■□□□ 1.05
AP000911.1-201ENST00000533922 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.6■■□□□ 1.05
AP000911.1-201ENST00000533922 CUL7Q14999 1698 aa21.6■■□□□ 1.05
AP000911.1-201ENST00000533922 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
AP000911.1-201ENST00000533922 WDR62O43379 1518 aa21.57■■□□□ 1.04
AP000911.1-201ENST00000533922 P3H3Q8IVL6 736 aa21.54■■□□□ 1.04
AP000911.1-201ENST00000533922 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AP000911.1-201ENST00000533922 IFT140Q96RY7 1462 aa21.5■■□□□ 1.03
AP000911.1-201ENST00000533922 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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