RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533877.1

FAM220A-204, Transcript of family with sequence similarity 220 member A, humanhuman

TSL 4

Gene FAM220A, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220A-204ENST00000533877 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.61■■■■■ 8.25
FAM220A-204ENST00000533877 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.97■■■■■ 7.03
FAM220A-204ENST00000533877 ABCC9O60706 1549 aa57.64■■■■■ 6.82
FAM220A-204ENST00000533877 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.8■■■■■ 6.52
FAM220A-204ENST00000533877 NACADO15069 1562 aa55.49■■■■■ 6.47
FAM220A-204ENST00000533877 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.49■■■■■ 6.47
FAM220A-204ENST00000533877 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.48■■■■■ 6.47
FAM220A-204ENST00000533877 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.22■■■■■ 6.43
FAM220A-204ENST00000533877 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.08■■■■■ 6.41
FAM220A-204ENST00000533877 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.08■■■■■ 6.25
FAM220A-204ENST00000533877 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.02■■■■■ 6.24
FAM220A-204ENST00000533877 SCRIBQ14160 1630 aa53.91■■■■■ 6.22
FAM220A-204ENST00000533877 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.77■■■■■ 6.2
FAM220A-204ENST00000533877 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.21■■■■■ 6.11
FAM220A-204ENST00000533877 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.77■■■■■ 6.04
FAM220A-204ENST00000533877 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.34■■■■■ 5.97
FAM220A-204ENST00000533877 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.07■■■■■ 5.93
FAM220A-204ENST00000533877 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.9■■■■■ 5.9
FAM220A-204ENST00000533877 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.58■■■■■ 5.85
FAM220A-204ENST00000533877 SMARCA4P51532 1647 aa51.57■■■■■ 5.85
FAM220A-204ENST00000533877 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.34■■■■■ 5.81
FAM220A-204ENST00000533877 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.31■■■■■ 5.8
FAM220A-204ENST00000533877 NCAPD3P42695 1498 aa51.26■■■■■ 5.8
FAM220A-204ENST00000533877 SMARCA2P51531 1590 aa51.22■■■■■ 5.79
FAM220A-204ENST00000533877 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.05■■■■■ 5.76
FAM220A-204ENST00000533877 HMGXB3Q12766 1538 aa50.92■■■■■ 5.74
FAM220A-204ENST00000533877 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.9■■■■■ 5.74
FAM220A-204ENST00000533877 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.89■■■■■ 5.74
FAM220A-204ENST00000533877 WIZO95785 1651 aa50.76■■■■■ 5.72
FAM220A-204ENST00000533877 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.24■■■■■ 5.63
FAM220A-204ENST00000533877 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.94■■■■■ 5.59
FAM220A-204ENST00000533877 NESP48681 1621 aa49.93■■■■■ 5.58
FAM220A-204ENST00000533877 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.82■■■■■ 5.57
FAM220A-204ENST00000533877 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.79■■■■■ 5.56
FAM220A-204ENST00000533877 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.74■■■■■ 5.55
FAM220A-204ENST00000533877 ERCC6Q03468 1493 aa49.67■■■■■ 5.54
FAM220A-204ENST00000533877 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.56■■■■■ 5.52
FAM220A-204ENST00000533877 CFTRP13569 1480 aa49.52■■■■■ 5.52
FAM220A-204ENST00000533877 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.23■■■■■ 5.47
FAM220A-204ENST00000533877 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.19■■■■■ 5.47
FAM220A-204ENST00000533877 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.09■■■■■ 5.45
FAM220A-204ENST00000533877 CUX2O14529 1486 aa48.99■■■■■ 5.43
FAM220A-204ENST00000533877 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
FAM220A-204ENST00000533877 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.97■■■■■ 5.43
FAM220A-204ENST00000533877 PRDM2Q13029 1718 aa48.95■■■■■ 5.43
FAM220A-204ENST00000533877 WDR62O43379 1518 aa48.74■■■■■ 5.39
FAM220A-204ENST00000533877 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
FAM220A-204ENST00000533877 ABCC8Q09428 1581 aa48.47■■■■■ 5.35
FAM220A-204ENST00000533877 TOPBP1Q92547 1522 aa48.42■■■■■ 5.34
FAM220A-204ENST00000533877 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.34■■■■■ 5.33
FAM220A-204ENST00000533877 CUX1P39880 1505 aa48.13■■■■■ 5.3
FAM220A-204ENST00000533877 IFT140Q96RY7 1462 aa48.07■■■■■ 5.29
FAM220A-204ENST00000533877 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.02■■■■■ 5.28
FAM220A-204ENST00000533877 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.98■■■■■ 5.27
FAM220A-204ENST00000533877 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.95■■■■■ 5.27
FAM220A-204ENST00000533877 SOGA1O94964 1423 aa47.92■■■■■ 5.26
FAM220A-204ENST00000533877 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.86■■■■■ 5.25
FAM220A-204ENST00000533877 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.83■■■■■ 5.25
FAM220A-204ENST00000533877 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
FAM220A-204ENST00000533877 TOP2BQ02880 1626 aa47.76■■■■■ 5.24
FAM220A-204ENST00000533877 SYNJ1O43426 1573 aa47.75■■■■■ 5.24
FAM220A-204ENST00000533877 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.7■■■■■ 5.23
FAM220A-204ENST00000533877 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.65■■■■■ 5.22
FAM220A-204ENST00000533877 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.63■■■■■ 5.22
FAM220A-204ENST00000533877 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
FAM220A-204ENST00000533877 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.49■■■■■ 5.19
FAM220A-204ENST00000533877 WDR97A6NE52 1622 aa47.42■■■■■ 5.18
FAM220A-204ENST00000533877 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.35■■■■■ 5.17
FAM220A-204ENST00000533877 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.33■■■■■ 5.17
FAM220A-204ENST00000533877 GRIN2BQ13224 1484 aa47.27■■■■■ 5.16
FAM220A-204ENST00000533877 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.19■■■■■ 5.15
FAM220A-204ENST00000533877 OSCARQ8IYS5 282 aa47.19■■■■■ 5.14
FAM220A-204ENST00000533877 TRIM41Q8WV44 630 aa47.17■■■■■ 5.14
FAM220A-204ENST00000533877 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.15■■■■■ 5.14
FAM220A-204ENST00000533877 FBLN2P98095 1184 aa47.14■■■■■ 5.14
FAM220A-204ENST00000533877 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
FAM220A-204ENST00000533877 PBRM1Q86U86 1689 aa47.05■■■■■ 5.12
FAM220A-204ENST00000533877 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
FAM220A-204ENST00000533877 KIF27Q86VH2 1401 aa46.98■■■■■ 5.11
FAM220A-204ENST00000533877 SYNJ2O15056 1496 aa46.92■■■■■ 5.1
FAM220A-204ENST00000533877 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.91■■■■■ 5.1
FAM220A-204ENST00000533877 CHD1O14646 1710 aa46.88■■■■■ 5.09
FAM220A-204ENST00000533877 IGF1RP08069 1367 aa46.8■■■■■ 5.08
FAM220A-204ENST00000533877 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.79■■■■■ 5.08
FAM220A-204ENST00000533877 ADAMTS12P58397 1594 aa46.73■■■■■ 5.07
FAM220A-204ENST00000533877 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.73■■■■■ 5.07
FAM220A-204ENST00000533877 GRIN2AQ12879 1464 aa46.63■■■■■ 5.06
FAM220A-204ENST00000533877 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.62■■■■■ 5.05
FAM220A-204ENST00000533877 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.52■■■■■ 5.04
FAM220A-204ENST00000533877 CUL7Q14999 1698 aa46.48■■■■■ 5.03
FAM220A-204ENST00000533877 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.43■■■■■ 5.02
FAM220A-204ENST00000533877 NUP160Q12769 1436 aa46.42■■■■■ 5.02
FAM220A-204ENST00000533877 CEP170Q5SW79 1584 aa46.35■■■■■ 5.01
FAM220A-204ENST00000533877 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.26■■■■■ 5
FAM220A-204ENST00000533877 ARHGEF11O15085 1522 aa46.24■■■■■ 4.99
FAM220A-204ENST00000533877 EEA1Q15075 1411 aa46.22■■■■■ 4.99
FAM220A-204ENST00000533877 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.22■■■■■ 4.99
FAM220A-204ENST00000533877 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.2■■■■■ 4.99
FAM220A-204ENST00000533877 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.2■■■■■ 4.99
FAM220A-204ENST00000533877 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.2■■■■■ 4.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms