RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532260.1

NDUFV1-222, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V1, human

TSL 4

Gene NDUFV1, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFV1-222	ENST00000532260	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.98	■■■■■ 6.71
NDUFV1-222	ENST00000532260	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.59	■■■■■ 5.69
NDUFV1-222	ENST00000532260	ABCC9	O60706	1549 aa		50.03	■■■■■ 5.6
NDUFV1-222	ENST00000532260	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.91	■■■■■ 5.26
NDUFV1-222	ENST00000532260	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.83	■■■■■ 5.25
NDUFV1-222	ENST00000532260	NACAD	O15069	1562 aa		47.73	■■■■■ 5.23
NDUFV1-222	ENST00000532260	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.37	■■■■■ 5.17
NDUFV1-222	ENST00000532260	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.32	■■■■■ 5.17
NDUFV1-222	ENST00000532260	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.05	■■■■■ 5.12
NDUFV1-222	ENST00000532260	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.84	■■■■■ 5.09
NDUFV1-222	ENST00000532260	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.73	■■■■■ 5.07
NDUFV1-222	ENST00000532260	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.51	■■■■■ 5.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.38	■■■■■ 5.02
NDUFV1-222	ENST00000532260	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.29	■■■■■ 5
NDUFV1-222	ENST00000532260	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.8	■■■■■ 4.92
NDUFV1-222	ENST00000532260	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.25	■■■■■ 4.83
NDUFV1-222	ENST00000532260	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.15	■■■■■ 4.82
NDUFV1-222	ENST00000532260	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.94	■■■■■ 4.78
NDUFV1-222	ENST00000532260	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.21	■■■■■ 4.67
NDUFV1-222	ENST00000532260	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.14	■■■■■ 4.66
NDUFV1-222	ENST00000532260	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.14	■■■■■ 4.66
NDUFV1-222	ENST00000532260	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.1	■■■■■ 4.65
NDUFV1-222	ENST00000532260	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.97	■■■■■ 4.63
NDUFV1-222	ENST00000532260	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.95	■■■■■ 4.63
NDUFV1-222	ENST00000532260	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.78	■■■■■ 4.6
NDUFV1-222	ENST00000532260	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.75	■■■■■ 4.59
NDUFV1-222	ENST00000532260	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.7	■■■■■ 4.59
NDUFV1-222	ENST00000532260	WIZ	O95785	1651 aa		43.43	■■■■■ 4.54
NDUFV1-222	ENST00000532260	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.39	■■■■■ 4.54
NDUFV1-222	ENST00000532260	NES	P48681	1621 aa		43.24	■■■■■ 4.51
NDUFV1-222	ENST00000532260	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.06	■■■■■ 4.48
NDUFV1-222	ENST00000532260	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.9	■■■■■ 4.46
NDUFV1-222	ENST00000532260	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.89	■■■■■ 4.46
NDUFV1-222	ENST00000532260	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.87	■■■■■ 4.45
NDUFV1-222	ENST00000532260	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.71	■■■■■ 4.43
NDUFV1-222	ENST00000532260	CUX2	O14529	1486 aa		42.67	■■■■■ 4.42
NDUFV1-222	ENST00000532260	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.55	■■■■■ 4.4
NDUFV1-222	ENST00000532260	CFTR	P13569	1480 aa		42.52	■■■■■ 4.4
NDUFV1-222	ENST00000532260	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.51	■■■■■ 4.4
NDUFV1-222	ENST00000532260	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
NDUFV1-222	ENST00000532260	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.34	■■■■■ 4.37
NDUFV1-222	ENST00000532260	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.28	■■■■■ 4.36
NDUFV1-222	ENST00000532260	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.26	■■■■■ 4.36
NDUFV1-222	ENST00000532260	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
NDUFV1-222	ENST00000532260	WDR62	O43379	1518 aa		42.11	■■■■■ 4.33
NDUFV1-222	ENST00000532260	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
NDUFV1-222	ENST00000532260	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.93	■■■■■ 4.3
NDUFV1-222	ENST00000532260	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.88	■■■■■ 4.29
NDUFV1-222	ENST00000532260	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.63	■■■■■ 4.25
NDUFV1-222	ENST00000532260	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.52	■■■■■ 4.24
NDUFV1-222	ENST00000532260	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.49	■■■■■ 4.23
NDUFV1-222	ENST00000532260	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.41	■■■■■ 4.22
NDUFV1-222	ENST00000532260	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.34	■■■■■ 4.21
NDUFV1-222	ENST00000532260	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.26	■■■■■ 4.2
NDUFV1-222	ENST00000532260	CUX1	P39880	1505 aa		41.24	■■■■■ 4.19
NDUFV1-222	ENST00000532260	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.17	■■■■■ 4.18
NDUFV1-222	ENST00000532260	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.16	■■■■■ 4.18
NDUFV1-222	ENST00000532260	SOGA1	O94964	1423 aa		41.13	■■■■■ 4.17
NDUFV1-222	ENST00000532260	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.12	■■■■■ 4.17
NDUFV1-222	ENST00000532260	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.1	■■■■■ 4.17	7e-7	■■■■□ 23.2
NDUFV1-222	ENST00000532260	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.01	■■■■■ 4.16
NDUFV1-222	ENST00000532260	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41	■■■■■ 4.15
NDUFV1-222	ENST00000532260	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15
NDUFV1-222	ENST00000532260	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.85	■■■■■ 4.13
NDUFV1-222	ENST00000532260	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.75	■■■■■ 4.11
NDUFV1-222	ENST00000532260	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.72	■■■■■ 4.11
NDUFV1-222	ENST00000532260	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.68	■■■■■ 4.1
NDUFV1-222	ENST00000532260	FBLN2	P98095	1184 aa		40.68	■■■■■ 4.1
NDUFV1-222	ENST00000532260	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.67	■■■■■ 4.1
NDUFV1-222	ENST00000532260	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.67	■■■■■ 4.1
NDUFV1-222	ENST00000532260	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.63	■■■■■ 4.09
NDUFV1-222	ENST00000532260	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.62	■■■■■ 4.09
NDUFV1-222	ENST00000532260	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.61	■■■■■ 4.09
NDUFV1-222	ENST00000532260	CHD1	O14646	1710 aa		40.54	■■■■■ 4.08
NDUFV1-222	ENST00000532260	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
NDUFV1-222	ENST00000532260	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
NDUFV1-222	ENST00000532260	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.49	■■■■■ 4.07
NDUFV1-222	ENST00000532260	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.4	■■■■■ 4.06
NDUFV1-222	ENST00000532260	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.4	■■■■■ 4.06
NDUFV1-222	ENST00000532260	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.38	■■■■■ 4.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.25	■■■■■ 4.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.25	■■■■■ 4.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.25	■■■■■ 4.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.24	■■■■■ 4.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.16	■■■■■ 4.02
NDUFV1-222	ENST00000532260	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.15	■■■■■ 4.02
NDUFV1-222	ENST00000532260	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.13	■■■■■ 4.01
NDUFV1-222	ENST00000532260	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.12	■■■■■ 4.01
NDUFV1-222	ENST00000532260	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.09	■■■■■ 4.01
NDUFV1-222	ENST00000532260	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.03	■■■■■ 4
NDUFV1-222	ENST00000532260	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40	■■■■□ 3.99
NDUFV1-222	ENST00000532260	IGF1R	P08069	1367 aa		40	■■■■□ 3.99
NDUFV1-222	ENST00000532260	NUP160	Q12769	1436 aa		39.96	■■■■□ 3.99
NDUFV1-222	ENST00000532260	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.94	■■■■□ 3.98
NDUFV1-222	ENST00000532260	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.91	■■■■□ 3.98
NDUFV1-222	ENST00000532260	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.72	■■■■□ 3.95
NDUFV1-222	ENST00000532260	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.7	■■■■□ 3.95
NDUFV1-222	ENST00000532260	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.68	■■■■□ 3.94
NDUFV1-222	ENST00000532260	CUL7	Q14999	1698 aa		39.65	■■■■□ 3.94
NDUFV1-222	ENST00000532260	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.65	■■■■□ 3.94

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